Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Atf7ipQ7TT18 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Atf7ipQ7TT18 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Atf7ipQ7TT18 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Atf7ipQ7TT18 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Atf7ipQ7TT18 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Atf7ipQ7TT18 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Atf7ipQ7TT18 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Atf7ipQ7TT18 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Atf7ipQ7TT18 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Atf7ipQ7TT18 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Atf7ipQ7TT18 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Atf7ipQ7TT18 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Atf7ipQ7TT18 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Atf7ipQ7TT18 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Atf7ipQ7TT18 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Atf7ipQ7TT18 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Atf7ipQ7TT18 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Atf7ipQ7TT18 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Atf7ipQ7TT18 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Atf7ipQ7TT18 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Atf7ipQ7TT18 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Atf7ipQ7TT18 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Atf7ipQ7TT18 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Atf7ipQ7TT18 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Atf7ipQ7TT18 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Atf7ipQ7TT18 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Atf7ipQ7TT18 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Atf7ipQ7TT18 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Atf7ipQ7TT18 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Atf7ipQ7TT18 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Atf7ipQ7TT18 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Atf7ipQ7TT18 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Atf7ipQ7TT18 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Atf7ipQ7TT18 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Atf7ipQ7TT18 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Atf7ipQ7TT18 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Atf7ipQ7TT18 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atf7ipQ7TT18 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Atf7ipQ7TT18 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atf7ipQ7TT18 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atf7ipQ7TT18 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Atf7ipQ7TT18 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Atf7ipQ7TT18 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Atf7ipQ7TT18 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atf7ipQ7TT18 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atf7ipQ7TT18 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Atf7ipQ7TT18 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atf7ipQ7TT18 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Atf7ipQ7TT18 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Atf7ipQ7TT18 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Atf7ipQ7TT18 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Atf7ipQ7TT18 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Atf7ipQ7TT18 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Atf7ipQ7TT18 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Atf7ipQ7TT18 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Atf7ipQ7TT18 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Atf7ipQ7TT18 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Atf7ipQ7TT18 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Atf7ipQ7TT18 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Atf7ipQ7TT18 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Atf7ipQ7TT18 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Atf7ipQ7TT18 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atf7ipQ7TT18 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Atf7ipQ7TT18 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Atf7ipQ7TT18 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Atf7ipQ7TT18 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Atf7ipQ7TT18 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Atf7ipQ7TT18 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Atf7ipQ7TT18 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Atf7ipQ7TT18 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Atf7ipQ7TT18 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Atf7ipQ7TT18 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Atf7ipQ7TT18 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Atf7ipQ7TT18 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Atf7ipQ7TT18 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Atf7ipQ7TT18 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Atf7ipQ7TT18 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Atf7ipQ7TT18 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Atf7ipQ7TT18 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atf7ipQ7TT18 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Atf7ipQ7TT18 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Atf7ipQ7TT18 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Atf7ipQ7TT18 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atf7ipQ7TT18 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Atf7ipQ7TT18 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Atf7ipQ7TT18 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Atf7ipQ7TT18 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Atf7ipQ7TT18 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Atf7ipQ7TT18 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Atf7ipQ7TT18 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atf7ipQ7TT18 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atf7ipQ7TT18 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atf7ipQ7TT18 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Atf7ipQ7TT18 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Atf7ipQ7TT18 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Atf7ipQ7TT18 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Atf7ipQ7TT18 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms