Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35,13■■■■□ 3,21
Atf7ipQ7TT18 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Atf7ipQ7TT18 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Atf7ipQ7TT18 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Atf7ipQ7TT18 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Atf7ipQ7TT18 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3,19
Atf7ipQ7TT18 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Atf7ipQ7TT18 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Atf7ipQ7TT18 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Atf7ipQ7TT18 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Atf7ipQ7TT18 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Atf7ipQ7TT18 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Atf7ipQ7TT18 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Atf7ipQ7TT18 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Atf7ipQ7TT18 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Atf7ipQ7TT18 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Atf7ipQ7TT18 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34,83■■■■□ 3,17
Atf7ipQ7TT18 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,17
Atf7ipQ7TT18 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Atf7ipQ7TT18 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Atf7ipQ7TT18 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Atf7ipQ7TT18 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Atf7ipQ7TT18 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Atf7ipQ7TT18 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Atf7ipQ7TT18 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Atf7ipQ7TT18 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Atf7ipQ7TT18 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Atf7ipQ7TT18 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Atf7ipQ7TT18 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Atf7ipQ7TT18 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Atf7ipQ7TT18 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Atf7ipQ7TT18 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Atf7ipQ7TT18 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34,61■■■■□ 3,13
Atf7ipQ7TT18 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Atf7ipQ7TT18 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34,59■■■■□ 3,13
Atf7ipQ7TT18 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
Atf7ipQ7TT18 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Atf7ipQ7TT18 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Atf7ipQ7TT18 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Atf7ipQ7TT18 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Atf7ipQ7TT18 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Atf7ipQ7TT18 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Atf7ipQ7TT18 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Atf7ipQ7TT18 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Atf7ipQ7TT18 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Atf7ipQ7TT18 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Atf7ipQ7TT18 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Atf7ipQ7TT18 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Atf7ipQ7TT18 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34,45■■■■□ 3,11
Atf7ipQ7TT18 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Atf7ipQ7TT18 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Atf7ipQ7TT18 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Atf7ipQ7TT18 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Atf7ipQ7TT18 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Atf7ipQ7TT18 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Atf7ipQ7TT18 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Atf7ipQ7TT18 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Atf7ipQ7TT18 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Atf7ipQ7TT18 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Atf7ipQ7TT18 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Atf7ipQ7TT18 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Atf7ipQ7TT18 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,26■■■■□ 3,07
Atf7ipQ7TT18 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Atf7ipQ7TT18 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Atf7ipQ7TT18 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Atf7ipQ7TT18 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Atf7ipQ7TT18 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Atf7ipQ7TT18 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Atf7ipQ7TT18 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Atf7ipQ7TT18 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Atf7ipQ7TT18 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Atf7ipQ7TT18 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Atf7ipQ7TT18 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Atf7ipQ7TT18 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Atf7ipQ7TT18 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Atf7ipQ7TT18 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Atf7ipQ7TT18 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Atf7ipQ7TT18 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Atf7ipQ7TT18 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34,15■■■■□ 3,06
Atf7ipQ7TT18 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Atf7ipQ7TT18 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Atf7ipQ7TT18 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Atf7ipQ7TT18 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Atf7ipQ7TT18 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Atf7ipQ7TT18 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Atf7ipQ7TT18 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34,08■■■■□ 3,05
Atf7ipQ7TT18 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Atf7ipQ7TT18 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Atf7ipQ7TT18 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Atf7ipQ7TT18 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Atf7ipQ7TT18 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Atf7ipQ7TT18 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Atf7ipQ7TT18 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Atf7ipQ7TT18 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Atf7ipQ7TT18 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Atf7ipQ7TT18 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Atf7ipQ7TT18 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Atf7ipQ7TT18 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms