Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GypcQ78HU7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GypcQ78HU7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GypcQ78HU7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GypcQ78HU7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GypcQ78HU7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GypcQ78HU7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GypcQ78HU7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GypcQ78HU7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GypcQ78HU7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GypcQ78HU7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GypcQ78HU7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GypcQ78HU7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GypcQ78HU7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GypcQ78HU7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GypcQ78HU7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GypcQ78HU7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GypcQ78HU7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GypcQ78HU7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GypcQ78HU7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GypcQ78HU7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GypcQ78HU7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GypcQ78HU7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GypcQ78HU7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GypcQ78HU7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GypcQ78HU7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GypcQ78HU7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GypcQ78HU7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GypcQ78HU7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GypcQ78HU7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GypcQ78HU7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GypcQ78HU7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GypcQ78HU7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GypcQ78HU7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GypcQ78HU7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GypcQ78HU7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GypcQ78HU7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GypcQ78HU7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GypcQ78HU7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GypcQ78HU7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GypcQ78HU7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GypcQ78HU7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GypcQ78HU7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GypcQ78HU7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GypcQ78HU7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GypcQ78HU7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GypcQ78HU7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GypcQ78HU7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GypcQ78HU7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GypcQ78HU7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GypcQ78HU7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GypcQ78HU7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GypcQ78HU7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GypcQ78HU7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GypcQ78HU7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GypcQ78HU7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GypcQ78HU7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GypcQ78HU7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GypcQ78HU7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GypcQ78HU7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GypcQ78HU7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GypcQ78HU7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GypcQ78HU7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GypcQ78HU7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GypcQ78HU7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GypcQ78HU7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GypcQ78HU7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GypcQ78HU7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GypcQ78HU7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GypcQ78HU7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GypcQ78HU7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GypcQ78HU7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GypcQ78HU7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GypcQ78HU7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GypcQ78HU7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GypcQ78HU7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GypcQ78HU7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GypcQ78HU7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GypcQ78HU7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GypcQ78HU7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GypcQ78HU7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GypcQ78HU7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GypcQ78HU7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GypcQ78HU7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GypcQ78HU7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GypcQ78HU7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GypcQ78HU7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GypcQ78HU7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GypcQ78HU7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
GypcQ78HU7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GypcQ78HU7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GypcQ78HU7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GypcQ78HU7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GypcQ78HU7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GypcQ78HU7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GypcQ78HU7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GypcQ78HU7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GypcQ78HU7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GypcQ78HU7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GypcQ78HU7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms