Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Mindy1Q76LS9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Mindy1Q76LS9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Mindy1Q76LS9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Mindy1Q76LS9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Mindy1Q76LS9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Mindy1Q76LS9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Mindy1Q76LS9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Mindy1Q76LS9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Mindy1Q76LS9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Mindy1Q76LS9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Mindy1Q76LS9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Mindy1Q76LS9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
Mindy1Q76LS9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Mindy1Q76LS9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Mindy1Q76LS9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Mindy1Q76LS9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Mindy1Q76LS9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Mindy1Q76LS9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Mindy1Q76LS9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Mindy1Q76LS9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Mindy1Q76LS9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Mindy1Q76LS9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Mindy1Q76LS9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Mindy1Q76LS9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Mindy1Q76LS9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Mindy1Q76LS9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Mindy1Q76LS9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Mindy1Q76LS9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Mindy1Q76LS9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
Mindy1Q76LS9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Mindy1Q76LS9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Mindy1Q76LS9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Mindy1Q76LS9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Mindy1Q76LS9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Mindy1Q76LS9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Mindy1Q76LS9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Mindy1Q76LS9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Mindy1Q76LS9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Mindy1Q76LS9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Mindy1Q76LS9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Mindy1Q76LS9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Mindy1Q76LS9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Mindy1Q76LS9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Mindy1Q76LS9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Mindy1Q76LS9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Mindy1Q76LS9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Mindy1Q76LS9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Mindy1Q76LS9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Mindy1Q76LS9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Mindy1Q76LS9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Mindy1Q76LS9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Mindy1Q76LS9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Mindy1Q76LS9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Mindy1Q76LS9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Mindy1Q76LS9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Mindy1Q76LS9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Mindy1Q76LS9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Mindy1Q76LS9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Mindy1Q76LS9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Mindy1Q76LS9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Mindy1Q76LS9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Mindy1Q76LS9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Mindy1Q76LS9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Mindy1Q76LS9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Mindy1Q76LS9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Mindy1Q76LS9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Mindy1Q76LS9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Mindy1Q76LS9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Mindy1Q76LS9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Mindy1Q76LS9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Mindy1Q76LS9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Mindy1Q76LS9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Mindy1Q76LS9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Mindy1Q76LS9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Mindy1Q76LS9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Mindy1Q76LS9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Mindy1Q76LS9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Mindy1Q76LS9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Mindy1Q76LS9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Mindy1Q76LS9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Mindy1Q76LS9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Mindy1Q76LS9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Mindy1Q76LS9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Mindy1Q76LS9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Mindy1Q76LS9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Mindy1Q76LS9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Mindy1Q76LS9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Mindy1Q76LS9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Mindy1Q76LS9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Mindy1Q76LS9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Mindy1Q76LS9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Mindy1Q76LS9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Mindy1Q76LS9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Mindy1Q76LS9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Mindy1Q76LS9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Mindy1Q76LS9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
Mindy1Q76LS9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Mindy1Q76LS9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Mindy1Q76LS9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42,9 ms