Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mindy1Q76LS9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Mindy1Q76LS9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mindy1Q76LS9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Mindy1Q76LS9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Mindy1Q76LS9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mindy1Q76LS9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Mindy1Q76LS9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mindy1Q76LS9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mindy1Q76LS9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mindy1Q76LS9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Mindy1Q76LS9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mindy1Q76LS9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Mindy1Q76LS9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mindy1Q76LS9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mindy1Q76LS9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mindy1Q76LS9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mindy1Q76LS9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mindy1Q76LS9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mindy1Q76LS9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mindy1Q76LS9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mindy1Q76LS9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mindy1Q76LS9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mindy1Q76LS9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Mindy1Q76LS9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mindy1Q76LS9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mindy1Q76LS9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mindy1Q76LS9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mindy1Q76LS9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mindy1Q76LS9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Mindy1Q76LS9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mindy1Q76LS9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mindy1Q76LS9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mindy1Q76LS9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mindy1Q76LS9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mindy1Q76LS9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mindy1Q76LS9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mindy1Q76LS9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mindy1Q76LS9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mindy1Q76LS9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mindy1Q76LS9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mindy1Q76LS9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mindy1Q76LS9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Mindy1Q76LS9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mindy1Q76LS9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Mindy1Q76LS9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mindy1Q76LS9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mindy1Q76LS9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mindy1Q76LS9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mindy1Q76LS9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Mindy1Q76LS9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mindy1Q76LS9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mindy1Q76LS9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mindy1Q76LS9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Mindy1Q76LS9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mindy1Q76LS9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mindy1Q76LS9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mindy1Q76LS9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Mindy1Q76LS9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mindy1Q76LS9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Mindy1Q76LS9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mindy1Q76LS9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mindy1Q76LS9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mindy1Q76LS9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mindy1Q76LS9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mindy1Q76LS9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mindy1Q76LS9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mindy1Q76LS9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mindy1Q76LS9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mindy1Q76LS9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mindy1Q76LS9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Mindy1Q76LS9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mindy1Q76LS9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mindy1Q76LS9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mindy1Q76LS9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mindy1Q76LS9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mindy1Q76LS9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mindy1Q76LS9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mindy1Q76LS9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mindy1Q76LS9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mindy1Q76LS9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mindy1Q76LS9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mindy1Q76LS9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mindy1Q76LS9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mindy1Q76LS9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mindy1Q76LS9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mindy1Q76LS9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Mindy1Q76LS9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mindy1Q76LS9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mindy1Q76LS9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mindy1Q76LS9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mindy1Q76LS9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mindy1Q76LS9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mindy1Q76LS9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mindy1Q76LS9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mindy1Q76LS9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mindy1Q76LS9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Mindy1Q76LS9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mindy1Q76LS9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mindy1Q76LS9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms