Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spcs3Q6ZWQ7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spcs3Q6ZWQ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spcs3Q6ZWQ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spcs3Q6ZWQ7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spcs3Q6ZWQ7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spcs3Q6ZWQ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spcs3Q6ZWQ7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spcs3Q6ZWQ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Spcs3Q6ZWQ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spcs3Q6ZWQ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spcs3Q6ZWQ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spcs3Q6ZWQ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Spcs3Q6ZWQ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Spcs3Q6ZWQ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spcs3Q6ZWQ7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spcs3Q6ZWQ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spcs3Q6ZWQ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spcs3Q6ZWQ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spcs3Q6ZWQ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spcs3Q6ZWQ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spcs3Q6ZWQ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spcs3Q6ZWQ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spcs3Q6ZWQ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spcs3Q6ZWQ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Spcs3Q6ZWQ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spcs3Q6ZWQ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spcs3Q6ZWQ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spcs3Q6ZWQ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Spcs3Q6ZWQ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spcs3Q6ZWQ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spcs3Q6ZWQ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spcs3Q6ZWQ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spcs3Q6ZWQ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spcs3Q6ZWQ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spcs3Q6ZWQ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spcs3Q6ZWQ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spcs3Q6ZWQ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spcs3Q6ZWQ7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spcs3Q6ZWQ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spcs3Q6ZWQ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spcs3Q6ZWQ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spcs3Q6ZWQ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spcs3Q6ZWQ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Spcs3Q6ZWQ7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spcs3Q6ZWQ7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spcs3Q6ZWQ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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