Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPT1

Klhl9, Kelch-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl9Q6ZPT1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl9Q6ZPT1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl9Q6ZPT1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl9Q6ZPT1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl9Q6ZPT1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl9Q6ZPT1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl9Q6ZPT1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl9Q6ZPT1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl9Q6ZPT1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl9Q6ZPT1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl9Q6ZPT1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl9Q6ZPT1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl9Q6ZPT1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl9Q6ZPT1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl9Q6ZPT1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl9Q6ZPT1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl9Q6ZPT1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl9Q6ZPT1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl9Q6ZPT1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl9Q6ZPT1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl9Q6ZPT1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl9Q6ZPT1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl9Q6ZPT1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl9Q6ZPT1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl9Q6ZPT1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl9Q6ZPT1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl9Q6ZPT1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl9Q6ZPT1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl9Q6ZPT1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl9Q6ZPT1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl9Q6ZPT1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl9Q6ZPT1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl9Q6ZPT1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl9Q6ZPT1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl9Q6ZPT1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl9Q6ZPT1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl9Q6ZPT1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl9Q6ZPT1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl9Q6ZPT1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl9Q6ZPT1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl9Q6ZPT1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl9Q6ZPT1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl9Q6ZPT1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl9Q6ZPT1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl9Q6ZPT1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl9Q6ZPT1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl9Q6ZPT1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl9Q6ZPT1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl9Q6ZPT1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl9Q6ZPT1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl9Q6ZPT1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl9Q6ZPT1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl9Q6ZPT1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Klhl9Q6ZPT1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Klhl9Q6ZPT1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl9Q6ZPT1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Klhl9Q6ZPT1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl9Q6ZPT1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl9Q6ZPT1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Klhl9Q6ZPT1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl9Q6ZPT1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl9Q6ZPT1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhl9Q6ZPT1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl9Q6ZPT1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klhl9Q6ZPT1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl9Q6ZPT1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl9Q6ZPT1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl9Q6ZPT1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl9Q6ZPT1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl9Q6ZPT1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl9Q6ZPT1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl9Q6ZPT1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl9Q6ZPT1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl9Q6ZPT1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl9Q6ZPT1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl9Q6ZPT1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms