Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab35Q6PHN9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab35Q6PHN9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab35Q6PHN9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab35Q6PHN9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab35Q6PHN9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab35Q6PHN9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab35Q6PHN9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab35Q6PHN9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab35Q6PHN9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab35Q6PHN9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab35Q6PHN9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab35Q6PHN9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab35Q6PHN9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab35Q6PHN9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab35Q6PHN9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab35Q6PHN9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab35Q6PHN9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab35Q6PHN9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab35Q6PHN9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab35Q6PHN9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab35Q6PHN9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab35Q6PHN9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab35Q6PHN9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab35Q6PHN9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab35Q6PHN9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab35Q6PHN9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab35Q6PHN9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab35Q6PHN9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab35Q6PHN9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab35Q6PHN9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab35Q6PHN9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab35Q6PHN9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab35Q6PHN9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab35Q6PHN9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab35Q6PHN9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab35Q6PHN9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab35Q6PHN9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab35Q6PHN9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab35Q6PHN9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab35Q6PHN9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab35Q6PHN9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab35Q6PHN9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab35Q6PHN9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab35Q6PHN9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab35Q6PHN9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab35Q6PHN9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab35Q6PHN9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab35Q6PHN9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab35Q6PHN9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab35Q6PHN9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab35Q6PHN9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab35Q6PHN9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab35Q6PHN9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab35Q6PHN9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab35Q6PHN9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab35Q6PHN9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab35Q6PHN9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab35Q6PHN9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab35Q6PHN9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab35Q6PHN9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab35Q6PHN9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab35Q6PHN9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab35Q6PHN9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab35Q6PHN9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab35Q6PHN9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab35Q6PHN9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab35Q6PHN9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab35Q6PHN9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab35Q6PHN9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab35Q6PHN9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab35Q6PHN9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab35Q6PHN9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab35Q6PHN9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab35Q6PHN9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms