Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc6a7Q6PGE7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc6a7Q6PGE7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc6a7Q6PGE7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc6a7Q6PGE7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a7Q6PGE7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a7Q6PGE7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a7Q6PGE7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a7Q6PGE7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a7Q6PGE7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc6a7Q6PGE7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc6a7Q6PGE7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a7Q6PGE7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a7Q6PGE7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a7Q6PGE7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a7Q6PGE7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a7Q6PGE7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a7Q6PGE7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a7Q6PGE7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a7Q6PGE7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a7Q6PGE7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a7Q6PGE7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a7Q6PGE7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc6a7Q6PGE7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc6a7Q6PGE7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a7Q6PGE7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc6a7Q6PGE7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a7Q6PGE7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a7Q6PGE7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a7Q6PGE7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a7Q6PGE7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a7Q6PGE7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a7Q6PGE7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc6a7Q6PGE7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a7Q6PGE7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc6a7Q6PGE7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc6a7Q6PGE7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc6a7Q6PGE7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc6a7Q6PGE7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc6a7Q6PGE7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc6a7Q6PGE7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc6a7Q6PGE7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc6a7Q6PGE7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc6a7Q6PGE7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc6a7Q6PGE7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc6a7Q6PGE7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a7Q6PGE7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a7Q6PGE7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a7Q6PGE7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a7Q6PGE7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a7Q6PGE7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc6a7Q6PGE7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc6a7Q6PGE7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a7Q6PGE7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc6a7Q6PGE7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a7Q6PGE7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a7Q6PGE7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a7Q6PGE7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc6a7Q6PGE7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc6a7Q6PGE7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc6a7Q6PGE7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc6a7Q6PGE7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc6a7Q6PGE7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc6a7Q6PGE7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc6a7Q6PGE7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc6a7Q6PGE7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a7Q6PGE7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a7Q6PGE7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a7Q6PGE7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a7Q6PGE7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a7Q6PGE7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a7Q6PGE7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a7Q6PGE7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms