Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rexo4Q6PAQ4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rexo4Q6PAQ4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rexo4Q6PAQ4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo4Q6PAQ4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo4Q6PAQ4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo4Q6PAQ4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rexo4Q6PAQ4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rexo4Q6PAQ4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rexo4Q6PAQ4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rexo4Q6PAQ4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rexo4Q6PAQ4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rexo4Q6PAQ4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rexo4Q6PAQ4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Rexo4Q6PAQ4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rexo4Q6PAQ4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rexo4Q6PAQ4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rexo4Q6PAQ4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rexo4Q6PAQ4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rexo4Q6PAQ4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rexo4Q6PAQ4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rexo4Q6PAQ4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rexo4Q6PAQ4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rexo4Q6PAQ4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rexo4Q6PAQ4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rexo4Q6PAQ4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rexo4Q6PAQ4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rexo4Q6PAQ4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo4Q6PAQ4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo4Q6PAQ4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo4Q6PAQ4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rexo4Q6PAQ4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rexo4Q6PAQ4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rexo4Q6PAQ4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rexo4Q6PAQ4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rexo4Q6PAQ4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rexo4Q6PAQ4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rexo4Q6PAQ4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rexo4Q6PAQ4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo4Q6PAQ4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo4Q6PAQ4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo4Q6PAQ4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rexo4Q6PAQ4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rexo4Q6PAQ4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rexo4Q6PAQ4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo4Q6PAQ4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo4Q6PAQ4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo4Q6PAQ4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rexo4Q6PAQ4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rexo4Q6PAQ4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rexo4Q6PAQ4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rexo4Q6PAQ4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rexo4Q6PAQ4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rexo4Q6PAQ4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rexo4Q6PAQ4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rexo4Q6PAQ4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rexo4Q6PAQ4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rexo4Q6PAQ4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rexo4Q6PAQ4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rexo4Q6PAQ4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rexo4Q6PAQ4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rexo4Q6PAQ4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rexo4Q6PAQ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rexo4Q6PAQ4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rexo4Q6PAQ4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rexo4Q6PAQ4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rexo4Q6PAQ4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rexo4Q6PAQ4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rexo4Q6PAQ4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rexo4Q6PAQ4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rexo4Q6PAQ4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rexo4Q6PAQ4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rexo4Q6PAQ4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rexo4Q6PAQ4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rexo4Q6PAQ4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rexo4Q6PAQ4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rexo4Q6PAQ4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rexo4Q6PAQ4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rexo4Q6PAQ4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rexo4Q6PAQ4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo4Q6PAQ4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rexo4Q6PAQ4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rexo4Q6PAQ4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rexo4Q6PAQ4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rexo4Q6PAQ4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rexo4Q6PAQ4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rexo4Q6PAQ4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rexo4Q6PAQ4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo4Q6PAQ4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo4Q6PAQ4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rexo4Q6PAQ4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rexo4Q6PAQ4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rexo4Q6PAQ4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rexo4Q6PAQ4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rexo4Q6PAQ4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rexo4Q6PAQ4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rexo4Q6PAQ4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rexo4Q6PAQ4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rexo4Q6PAQ4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rexo4Q6PAQ4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms