Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt77Q6IFZ6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt77Q6IFZ6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt77Q6IFZ6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt77Q6IFZ6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt77Q6IFZ6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt77Q6IFZ6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt77Q6IFZ6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt77Q6IFZ6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt77Q6IFZ6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt77Q6IFZ6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt77Q6IFZ6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt77Q6IFZ6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt77Q6IFZ6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt77Q6IFZ6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt77Q6IFZ6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt77Q6IFZ6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt77Q6IFZ6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt77Q6IFZ6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Krt77Q6IFZ6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt77Q6IFZ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt77Q6IFZ6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Krt77Q6IFZ6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt77Q6IFZ6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt77Q6IFZ6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt77Q6IFZ6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Krt77Q6IFZ6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt77Q6IFZ6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt77Q6IFZ6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt77Q6IFZ6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt77Q6IFZ6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt77Q6IFZ6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt77Q6IFZ6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt77Q6IFZ6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt77Q6IFZ6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt77Q6IFZ6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt77Q6IFZ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt77Q6IFZ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt77Q6IFZ6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt77Q6IFZ6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt77Q6IFZ6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt77Q6IFZ6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt77Q6IFZ6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt77Q6IFZ6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt77Q6IFZ6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krt77Q6IFZ6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt77Q6IFZ6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt77Q6IFZ6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt77Q6IFZ6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt77Q6IFZ6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt77Q6IFZ6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt77Q6IFZ6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt77Q6IFZ6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt77Q6IFZ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Krt77Q6IFZ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt77Q6IFZ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt77Q6IFZ6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt77Q6IFZ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt77Q6IFZ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt77Q6IFZ6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt77Q6IFZ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt77Q6IFZ6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt77Q6IFZ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt77Q6IFZ6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt77Q6IFZ6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt77Q6IFZ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt77Q6IFZ6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt77Q6IFZ6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt77Q6IFZ6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt77Q6IFZ6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt77Q6IFZ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt77Q6IFZ6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt77Q6IFZ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt77Q6IFZ6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
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