Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5416Q6IE28 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5416Q6IE28 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5416Q6IE28 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5416Q6IE28 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5416Q6IE28 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5416Q6IE28 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5416Q6IE28 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5416Q6IE28 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5416Q6IE28 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5416Q6IE28 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5416Q6IE28 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5416Q6IE28 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5416Q6IE28 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5416Q6IE28 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5416Q6IE28 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5416Q6IE28 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5416Q6IE28 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5416Q6IE28 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5416Q6IE28 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5416Q6IE28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5416Q6IE28 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5416Q6IE28 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5416Q6IE28 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5416Q6IE28 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5416Q6IE28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5416Q6IE28 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5416Q6IE28 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5416Q6IE28 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm5416Q6IE28 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5416Q6IE28 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5416Q6IE28 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5416Q6IE28 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5416Q6IE28 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5416Q6IE28 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5416Q6IE28 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5416Q6IE28 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5416Q6IE28 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5416Q6IE28 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5416Q6IE28 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5416Q6IE28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5416Q6IE28 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5416Q6IE28 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5416Q6IE28 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5416Q6IE28 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5416Q6IE28 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5416Q6IE28 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5416Q6IE28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5416Q6IE28 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5416Q6IE28 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5416Q6IE28 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm5416Q6IE28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5416Q6IE28 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5416Q6IE28 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5416Q6IE28 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5416Q6IE28 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5416Q6IE28 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5416Q6IE28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5416Q6IE28 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm5416Q6IE28 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5416Q6IE28 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5416Q6IE28 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm5416Q6IE28 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5416Q6IE28 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm5416Q6IE28 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm5416Q6IE28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm5416Q6IE28 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5416Q6IE28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5416Q6IE28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5416Q6IE28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5416Q6IE28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm5416Q6IE28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5416Q6IE28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5416Q6IE28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5416Q6IE28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm5416Q6IE28 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5416Q6IE28 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5416Q6IE28 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm5416Q6IE28 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm5416Q6IE28 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm5416Q6IE28 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5416Q6IE28 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm5416Q6IE28 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5416Q6IE28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5416Q6IE28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm5416Q6IE28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm5416Q6IE28 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms