Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrn1Q61809 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrn1Q61809 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrn1Q61809 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrn1Q61809 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrn1Q61809 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrn1Q61809 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrn1Q61809 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrn1Q61809 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrn1Q61809 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrn1Q61809 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrn1Q61809 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrn1Q61809 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrn1Q61809 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrn1Q61809 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrn1Q61809 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrn1Q61809 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrn1Q61809 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrn1Q61809 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrn1Q61809 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrn1Q61809 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrn1Q61809 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrn1Q61809 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrn1Q61809 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrn1Q61809 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrn1Q61809 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrn1Q61809 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrn1Q61809 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrn1Q61809 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrn1Q61809 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrn1Q61809 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrn1Q61809 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrn1Q61809 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrn1Q61809 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrn1Q61809 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lrrn1Q61809 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrn1Q61809 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrn1Q61809 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrn1Q61809 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrn1Q61809 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrn1Q61809 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrn1Q61809 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrn1Q61809 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrn1Q61809 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrn1Q61809 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrn1Q61809 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrn1Q61809 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrn1Q61809 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrn1Q61809 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrn1Q61809 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrn1Q61809 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrn1Q61809 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrn1Q61809 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrn1Q61809 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrn1Q61809 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrn1Q61809 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrn1Q61809 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrn1Q61809 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrn1Q61809 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrn1Q61809 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrn1Q61809 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrn1Q61809 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrn1Q61809 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrn1Q61809 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrn1Q61809 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrn1Q61809 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrn1Q61809 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrn1Q61809 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrn1Q61809 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrn1Q61809 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrn1Q61809 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lrrn1Q61809 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrn1Q61809 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrn1Q61809 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrn1Q61809 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrn1Q61809 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrn1Q61809 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrn1Q61809 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrn1Q61809 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrn1Q61809 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrrn1Q61809 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrn1Q61809 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrn1Q61809 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrn1Q61809 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn1Q61809 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrn1Q61809 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrn1Q61809 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrn1Q61809 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrn1Q61809 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrn1Q61809 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrn1Q61809 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrn1Q61809 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrn1Q61809 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrn1Q61809 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrn1Q61809 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrn1Q61809 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrn1Q61809 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrn1Q61809 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrn1Q61809 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrn1Q61809 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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