Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Hes3Q61657 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Hes3Q61657 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Hes3Q61657 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Hes3Q61657 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Hes3Q61657 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,28■■□□□ 1,16
Hes3Q61657 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Hes3Q61657 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Hes3Q61657 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Hes3Q61657 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Hes3Q61657 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Hes3Q61657 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22,25■■□□□ 1,15
Hes3Q61657 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Hes3Q61657 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Hes3Q61657 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Hes3Q61657 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Hes3Q61657 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Hes3Q61657 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Hes3Q61657 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,16■■□□□ 1,14
Hes3Q61657 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Hes3Q61657 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Hes3Q61657 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Hes3Q61657 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,14■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,13■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22,13■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22,1■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22,08■■□□□ 1,13
Hes3Q61657 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Hes3Q61657 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Hes3Q61657 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Hes3Q61657 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Hes3Q61657 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Hes3Q61657 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Hes3Q61657 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,11
Hes3Q61657 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Hes3Q61657 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Hes3Q61657 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Hes3Q61657 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Hes3Q61657 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Hes3Q61657 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,92■■□□□ 1,1
Hes3Q61657 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Hes3Q61657 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Hes3Q61657 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Hes3Q61657 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Hes3Q61657 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Hes3Q61657 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Hes3Q61657 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Hes3Q61657 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Hes3Q61657 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Hes3Q61657 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,84■■□□□ 1,09
Hes3Q61657 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Hes3Q61657 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21,84■■□□□ 1,09
Hes3Q61657 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Hes3Q61657 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Hes3Q61657 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Hes3Q61657 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Hes3Q61657 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Hes3Q61657 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Hes3Q61657 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Hes3Q61657 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Hes3Q61657 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,77■■□□□ 1,08
Hes3Q61657 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Hes3Q61657 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Hes3Q61657 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Hes3Q61657 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Hes3Q61657 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Hes3Q61657 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Hes3Q61657 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Hes3Q61657 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Hes3Q61657 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Hes3Q61657 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Hes3Q61657 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Hes3Q61657 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Hes3Q61657 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,69■■□□□ 1,06
Hes3Q61657 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Hes3Q61657 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms