Protein–RNA interactions for Protein: Q61656

Ddx5, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx5Q61656 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ddx5Q61656 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx5Q61656 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx5Q61656 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx5Q61656 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx5Q61656 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx5Q61656 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx5Q61656 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ddx5Q61656 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx5Q61656 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx5Q61656 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx5Q61656 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx5Q61656 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx5Q61656 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx5Q61656 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx5Q61656 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx5Q61656 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx5Q61656 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx5Q61656 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx5Q61656 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx5Q61656 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx5Q61656 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx5Q61656 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx5Q61656 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx5Q61656 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx5Q61656 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx5Q61656 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx5Q61656 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx5Q61656 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx5Q61656 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx5Q61656 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx5Q61656 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ddx5Q61656 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx5Q61656 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx5Q61656 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx5Q61656 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx5Q61656 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx5Q61656 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx5Q61656 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx5Q61656 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ddx5Q61656 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx5Q61656 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx5Q61656 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx5Q61656 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx5Q61656 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx5Q61656 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx5Q61656 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx5Q61656 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx5Q61656 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx5Q61656 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx5Q61656 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx5Q61656 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx5Q61656 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx5Q61656 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx5Q61656 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx5Q61656 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx5Q61656 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx5Q61656 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx5Q61656 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx5Q61656 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx5Q61656 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx5Q61656 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx5Q61656 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx5Q61656 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx5Q61656 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx5Q61656 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx5Q61656 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx5Q61656 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx5Q61656 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx5Q61656 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx5Q61656 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx5Q61656 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx5Q61656 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx5Q61656 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx5Q61656 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx5Q61656 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx5Q61656 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx5Q61656 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx5Q61656 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx5Q61656 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx5Q61656 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx5Q61656 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx5Q61656 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx5Q61656 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx5Q61656 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx5Q61656 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms