Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gp49aQ61450 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gp49aQ61450 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gp49aQ61450 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gp49aQ61450 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gp49aQ61450 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gp49aQ61450 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gp49aQ61450 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gp49aQ61450 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gp49aQ61450 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gp49aQ61450 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gp49aQ61450 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gp49aQ61450 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gp49aQ61450 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gp49aQ61450 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gp49aQ61450 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gp49aQ61450 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gp49aQ61450 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gp49aQ61450 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gp49aQ61450 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gp49aQ61450 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gp49aQ61450 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gp49aQ61450 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gp49aQ61450 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gp49aQ61450 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gp49aQ61450 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gp49aQ61450 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gp49aQ61450 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gp49aQ61450 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gp49aQ61450 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gp49aQ61450 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gp49aQ61450 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gp49aQ61450 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gp49aQ61450 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gp49aQ61450 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gp49aQ61450 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gp49aQ61450 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gp49aQ61450 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gp49aQ61450 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gp49aQ61450 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gp49aQ61450 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gp49aQ61450 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gp49aQ61450 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp49aQ61450 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp49aQ61450 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp49aQ61450 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gp49aQ61450 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp49aQ61450 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp49aQ61450 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gp49aQ61450 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gp49aQ61450 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gp49aQ61450 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gp49aQ61450 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gp49aQ61450 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gp49aQ61450 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gp49aQ61450 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gp49aQ61450 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gp49aQ61450 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gp49aQ61450 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gp49aQ61450 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gp49aQ61450 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gp49aQ61450 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gp49aQ61450 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp49aQ61450 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gp49aQ61450 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gp49aQ61450 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gp49aQ61450 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gp49aQ61450 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gp49aQ61450 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gp49aQ61450 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gp49aQ61450 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gp49aQ61450 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gp49aQ61450 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gp49aQ61450 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gp49aQ61450 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gp49aQ61450 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gp49aQ61450 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gp49aQ61450 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gp49aQ61450 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp49aQ61450 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp49aQ61450 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gp49aQ61450 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp49aQ61450 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gp49aQ61450 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gp49aQ61450 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms