Protein–RNA interactions for Protein: Q61081

Cdc37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc37Q61081 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Cdc37Q61081 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Cdc37Q61081 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Cdc37Q61081 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cdc37Q61081 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cdc37Q61081 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cdc37Q61081 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cdc37Q61081 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Cdc37Q61081 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Cdc37Q61081 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Cdc37Q61081 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cdc37Q61081 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Cdc37Q61081 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Cdc37Q61081 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Cdc37Q61081 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Cdc37Q61081 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Cdc37Q61081 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cdc37Q61081 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Cdc37Q61081 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Cdc37Q61081 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Cdc37Q61081 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Cdc37Q61081 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cdc37Q61081 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cdc37Q61081 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Cdc37Q61081 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cdc37Q61081 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Cdc37Q61081 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cdc37Q61081 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Cdc37Q61081 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cdc37Q61081 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cdc37Q61081 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cdc37Q61081 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Cdc37Q61081 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Cdc37Q61081 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cdc37Q61081 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cdc37Q61081 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cdc37Q61081 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cdc37Q61081 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cdc37Q61081 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Cdc37Q61081 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Cdc37Q61081 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Cdc37Q61081 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Cdc37Q61081 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Cdc37Q61081 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Cdc37Q61081 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Cdc37Q61081 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Cdc37Q61081 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Cdc37Q61081 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Cdc37Q61081 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Cdc37Q61081 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Cdc37Q61081 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Cdc37Q61081 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Cdc37Q61081 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Cdc37Q61081 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Cdc37Q61081 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Cdc37Q61081 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Cdc37Q61081 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Cdc37Q61081 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Cdc37Q61081 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Cdc37Q61081 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Cdc37Q61081 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Cdc37Q61081 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Cdc37Q61081 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Cdc37Q61081 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Cdc37Q61081 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Cdc37Q61081 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Cdc37Q61081 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Cdc37Q61081 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Cdc37Q61081 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Cdc37Q61081 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cdc37Q61081 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cdc37Q61081 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Cdc37Q61081 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cdc37Q61081 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Cdc37Q61081 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,16
Cdc37Q61081 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Cdc37Q61081 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Cdc37Q61081 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Cdc37Q61081 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Cdc37Q61081 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Cdc37Q61081 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Cdc37Q61081 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Cdc37Q61081 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Cdc37Q61081 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Cdc37Q61081 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Cdc37Q61081 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Cdc37Q61081 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Cdc37Q61081 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cdc37Q61081 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Cdc37Q61081 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Cdc37Q61081 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Cdc37Q61081 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cdc37Q61081 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Cdc37Q61081 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Cdc37Q61081 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Cdc37Q61081 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Cdc37Q61081 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cdc37Q61081 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cdc37Q61081 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cdc37Q61081 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms