Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbbp7Q60973 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbbp7Q60973 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbbp7Q60973 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbbp7Q60973 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbbp7Q60973 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbbp7Q60973 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp7Q60973 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp7Q60973 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbbp7Q60973 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbbp7Q60973 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbbp7Q60973 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp7Q60973 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbbp7Q60973 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbbp7Q60973 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbbp7Q60973 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbbp7Q60973 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbbp7Q60973 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbbp7Q60973 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbbp7Q60973 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbbp7Q60973 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbbp7Q60973 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbbp7Q60973 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbbp7Q60973 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbbp7Q60973 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbbp7Q60973 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbbp7Q60973 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbbp7Q60973 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbbp7Q60973 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbbp7Q60973 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbbp7Q60973 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbbp7Q60973 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp7Q60973 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp7Q60973 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp7Q60973 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp7Q60973 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbbp7Q60973 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp7Q60973 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbbp7Q60973 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp7Q60973 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbbp7Q60973 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp7Q60973 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbbp7Q60973 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp7Q60973 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp7Q60973 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp7Q60973 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp7Q60973 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbbp7Q60973 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbbp7Q60973 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp7Q60973 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp7Q60973 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbbp7Q60973 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbbp7Q60973 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp7Q60973 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbbp7Q60973 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbbp7Q60973 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbbp7Q60973 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbbp7Q60973 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbbp7Q60973 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp7Q60973 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbbp7Q60973 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp7Q60973 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbbp7Q60973 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp7Q60973 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbbp7Q60973 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp7Q60973 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp7Q60973 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbbp7Q60973 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbbp7Q60973 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbbp7Q60973 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbbp7Q60973 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbbp7Q60973 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp7Q60973 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbbp7Q60973 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbbp7Q60973 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbbp7Q60973 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbbp7Q60973 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp7Q60973 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp7Q60973 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbbp7Q60973 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbbp7Q60973 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbbp7Q60973 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbbp7Q60973 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbbp7Q60973 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbbp7Q60973 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbbp7Q60973 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbbp7Q60973 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbbp7Q60973 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbbp7Q60973 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbbp7Q60973 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbbp7Q60973 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbbp7Q60973 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp7Q60973 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp7Q60973 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbbp7Q60973 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbbp7Q60973 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbbp7Q60973 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbbp7Q60973 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbbp7Q60973 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbbp7Q60973 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms