Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DbpQ60925 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DbpQ60925 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DbpQ60925 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DbpQ60925 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DbpQ60925 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DbpQ60925 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DbpQ60925 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DbpQ60925 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DbpQ60925 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DbpQ60925 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DbpQ60925 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DbpQ60925 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DbpQ60925 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DbpQ60925 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DbpQ60925 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DbpQ60925 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DbpQ60925 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DbpQ60925 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DbpQ60925 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DbpQ60925 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DbpQ60925 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DbpQ60925 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DbpQ60925 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DbpQ60925 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DbpQ60925 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DbpQ60925 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DbpQ60925 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DbpQ60925 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DbpQ60925 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DbpQ60925 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DbpQ60925 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DbpQ60925 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DbpQ60925 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DbpQ60925 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DbpQ60925 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DbpQ60925 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DbpQ60925 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DbpQ60925 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DbpQ60925 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DbpQ60925 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DbpQ60925 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DbpQ60925 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DbpQ60925 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DbpQ60925 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DbpQ60925 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DbpQ60925 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DbpQ60925 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DbpQ60925 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DbpQ60925 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DbpQ60925 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DbpQ60925 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DbpQ60925 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DbpQ60925 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DbpQ60925 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DbpQ60925 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DbpQ60925 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DbpQ60925 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DbpQ60925 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DbpQ60925 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DbpQ60925 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DbpQ60925 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DbpQ60925 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DbpQ60925 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DbpQ60925 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DbpQ60925 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DbpQ60925 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DbpQ60925 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DbpQ60925 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DbpQ60925 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DbpQ60925 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DbpQ60925 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DbpQ60925 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DbpQ60925 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DbpQ60925 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DbpQ60925 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DbpQ60925 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DbpQ60925 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DbpQ60925 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DbpQ60925 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DbpQ60925 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DbpQ60925 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DbpQ60925 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DbpQ60925 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms