Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cacna2d4Q5RJF7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cacna2d4Q5RJF7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cacna2d4Q5RJF7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Cacna2d4Q5RJF7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Cacna2d4Q5RJF7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Cacna2d4Q5RJF7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cacna2d4Q5RJF7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Cacna2d4Q5RJF7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cacna2d4Q5RJF7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Cacna2d4Q5RJF7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Cacna2d4Q5RJF7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Cacna2d4Q5RJF7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Cacna2d4Q5RJF7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cacna2d4Q5RJF7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Cacna2d4Q5RJF7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Cacna2d4Q5RJF7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Cacna2d4Q5RJF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Cacna2d4Q5RJF7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Cacna2d4Q5RJF7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Cacna2d4Q5RJF7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Cacna2d4Q5RJF7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Cacna2d4Q5RJF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Cacna2d4Q5RJF7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Cacna2d4Q5RJF7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Cacna2d4Q5RJF7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Cacna2d4Q5RJF7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Cacna2d4Q5RJF7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Cacna2d4Q5RJF7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Cacna2d4Q5RJF7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Cacna2d4Q5RJF7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Cacna2d4Q5RJF7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Cacna2d4Q5RJF7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Cacna2d4Q5RJF7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Cacna2d4Q5RJF7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Cacna2d4Q5RJF7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Cacna2d4Q5RJF7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Cacna2d4Q5RJF7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Cacna2d4Q5RJF7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Cacna2d4Q5RJF7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Cacna2d4Q5RJF7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Cacna2d4Q5RJF7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Cacna2d4Q5RJF7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Cacna2d4Q5RJF7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cacna2d4Q5RJF7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Cacna2d4Q5RJF7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Cacna2d4Q5RJF7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cacna2d4Q5RJF7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cacna2d4Q5RJF7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cacna2d4Q5RJF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Cacna2d4Q5RJF7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Cacna2d4Q5RJF7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Cacna2d4Q5RJF7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Cacna2d4Q5RJF7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Cacna2d4Q5RJF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Cacna2d4Q5RJF7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Cacna2d4Q5RJF7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Cacna2d4Q5RJF7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Cacna2d4Q5RJF7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Cacna2d4Q5RJF7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cacna2d4Q5RJF7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cacna2d4Q5RJF7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cacna2d4Q5RJF7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cacna2d4Q5RJF7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Cacna2d4Q5RJF7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Cacna2d4Q5RJF7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Cacna2d4Q5RJF7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Cacna2d4Q5RJF7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Cacna2d4Q5RJF7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Cacna2d4Q5RJF7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cacna2d4Q5RJF7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cacna2d4Q5RJF7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Cacna2d4Q5RJF7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Cacna2d4Q5RJF7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Cacna2d4Q5RJF7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cacna2d4Q5RJF7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Cacna2d4Q5RJF7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cacna2d4Q5RJF7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cacna2d4Q5RJF7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cacna2d4Q5RJF7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cacna2d4Q5RJF7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cacna2d4Q5RJF7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Cacna2d4Q5RJF7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Cacna2d4Q5RJF7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Cacna2d4Q5RJF7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Cacna2d4Q5RJF7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Cacna2d4Q5RJF7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Cacna2d4Q5RJF7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53,9 ms