Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C4orf48Q5BLP8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf48Q5BLP8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf48Q5BLP8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf48Q5BLP8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf48Q5BLP8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf48Q5BLP8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf48Q5BLP8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf48Q5BLP8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf48Q5BLP8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf48Q5BLP8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf48Q5BLP8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf48Q5BLP8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf48Q5BLP8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf48Q5BLP8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf48Q5BLP8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf48Q5BLP8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf48Q5BLP8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms