Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm14685Q52KH6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm14685Q52KH6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm14685Q52KH6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm14685Q52KH6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm14685Q52KH6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm14685Q52KH6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm14685Q52KH6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm14685Q52KH6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm14685Q52KH6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm14685Q52KH6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm14685Q52KH6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm14685Q52KH6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm14685Q52KH6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm14685Q52KH6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm14685Q52KH6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm14685Q52KH6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm14685Q52KH6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm14685Q52KH6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm14685Q52KH6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm14685Q52KH6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm14685Q52KH6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm14685Q52KH6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm14685Q52KH6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm14685Q52KH6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm14685Q52KH6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm14685Q52KH6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm14685Q52KH6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm14685Q52KH6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm14685Q52KH6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm14685Q52KH6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm14685Q52KH6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm14685Q52KH6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm14685Q52KH6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm14685Q52KH6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm14685Q52KH6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm14685Q52KH6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm14685Q52KH6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm14685Q52KH6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm14685Q52KH6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm14685Q52KH6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm14685Q52KH6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm14685Q52KH6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm14685Q52KH6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm14685Q52KH6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm14685Q52KH6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm14685Q52KH6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm14685Q52KH6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm14685Q52KH6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm14685Q52KH6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm14685Q52KH6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm14685Q52KH6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm14685Q52KH6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm14685Q52KH6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm14685Q52KH6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm14685Q52KH6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm14685Q52KH6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm14685Q52KH6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm14685Q52KH6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm14685Q52KH6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm14685Q52KH6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm14685Q52KH6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm14685Q52KH6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm14685Q52KH6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm14685Q52KH6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm14685Q52KH6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm14685Q52KH6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm14685Q52KH6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm14685Q52KH6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm14685Q52KH6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm14685Q52KH6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm14685Q52KH6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm14685Q52KH6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm14685Q52KH6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm14685Q52KH6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm14685Q52KH6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm14685Q52KH6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm14685Q52KH6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm14685Q52KH6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm14685Q52KH6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm14685Q52KH6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm14685Q52KH6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm14685Q52KH6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm14685Q52KH6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm14685Q52KH6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm14685Q52KH6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm14685Q52KH6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm14685Q52KH6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms