Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3E1

Ubash3a, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3aQ3V3E1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ubash3aQ3V3E1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ubash3aQ3V3E1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ubash3aQ3V3E1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ubash3aQ3V3E1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ubash3aQ3V3E1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ubash3aQ3V3E1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ubash3aQ3V3E1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ubash3aQ3V3E1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ubash3aQ3V3E1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ubash3aQ3V3E1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ubash3aQ3V3E1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Ubash3aQ3V3E1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ubash3aQ3V3E1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ubash3aQ3V3E1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ubash3aQ3V3E1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ubash3aQ3V3E1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Ubash3aQ3V3E1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ubash3aQ3V3E1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ubash3aQ3V3E1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Ubash3aQ3V3E1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ubash3aQ3V3E1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Ubash3aQ3V3E1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ubash3aQ3V3E1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Ubash3aQ3V3E1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Ubash3aQ3V3E1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ubash3aQ3V3E1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ubash3aQ3V3E1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ubash3aQ3V3E1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ubash3aQ3V3E1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ubash3aQ3V3E1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ubash3aQ3V3E1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Ubash3aQ3V3E1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Ubash3aQ3V3E1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Ubash3aQ3V3E1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ubash3aQ3V3E1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Ubash3aQ3V3E1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ubash3aQ3V3E1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Ubash3aQ3V3E1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Ubash3aQ3V3E1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ubash3aQ3V3E1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ubash3aQ3V3E1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ubash3aQ3V3E1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ubash3aQ3V3E1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Ubash3aQ3V3E1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ubash3aQ3V3E1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ubash3aQ3V3E1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Ubash3aQ3V3E1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Ubash3aQ3V3E1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Ubash3aQ3V3E1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Ubash3aQ3V3E1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Ubash3aQ3V3E1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Ubash3aQ3V3E1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ubash3aQ3V3E1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ubash3aQ3V3E1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ubash3aQ3V3E1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ubash3aQ3V3E1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ubash3aQ3V3E1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ubash3aQ3V3E1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ubash3aQ3V3E1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Ubash3aQ3V3E1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Ubash3aQ3V3E1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Ubash3aQ3V3E1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ubash3aQ3V3E1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ubash3aQ3V3E1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ubash3aQ3V3E1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Ubash3aQ3V3E1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Ubash3aQ3V3E1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ubash3aQ3V3E1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ubash3aQ3V3E1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ubash3aQ3V3E1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Ubash3aQ3V3E1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ubash3aQ3V3E1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Ubash3aQ3V3E1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ubash3aQ3V3E1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Ubash3aQ3V3E1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Ubash3aQ3V3E1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Ubash3aQ3V3E1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ubash3aQ3V3E1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ubash3aQ3V3E1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Ubash3aQ3V3E1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Ubash3aQ3V3E1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Ubash3aQ3V3E1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Ubash3aQ3V3E1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ubash3aQ3V3E1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ubash3aQ3V3E1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ubash3aQ3V3E1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Ubash3aQ3V3E1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ubash3aQ3V3E1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ubash3aQ3V3E1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ubash3aQ3V3E1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ubash3aQ3V3E1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Ubash3aQ3V3E1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ubash3aQ3V3E1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ubash3aQ3V3E1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ubash3aQ3V3E1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Ubash3aQ3V3E1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Ubash3aQ3V3E1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Ubash3aQ3V3E1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ubash3aQ3V3E1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
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