Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc114Q3UX62 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc114Q3UX62 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc114Q3UX62 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc114Q3UX62 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc114Q3UX62 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc114Q3UX62 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc114Q3UX62 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc114Q3UX62 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc114Q3UX62 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc114Q3UX62 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc114Q3UX62 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc114Q3UX62 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc114Q3UX62 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc114Q3UX62 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc114Q3UX62 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc114Q3UX62 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc114Q3UX62 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc114Q3UX62 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc114Q3UX62 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc114Q3UX62 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc114Q3UX62 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc114Q3UX62 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc114Q3UX62 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc114Q3UX62 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc114Q3UX62 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc114Q3UX62 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc114Q3UX62 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc114Q3UX62 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc114Q3UX62 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc114Q3UX62 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc114Q3UX62 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc114Q3UX62 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc114Q3UX62 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc114Q3UX62 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc114Q3UX62 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc114Q3UX62 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc114Q3UX62 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc114Q3UX62 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc114Q3UX62 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc114Q3UX62 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc114Q3UX62 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc114Q3UX62 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc114Q3UX62 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc114Q3UX62 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc114Q3UX62 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc114Q3UX62 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc114Q3UX62 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc114Q3UX62 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc114Q3UX62 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc114Q3UX62 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc114Q3UX62 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc114Q3UX62 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc114Q3UX62 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc114Q3UX62 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc114Q3UX62 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc114Q3UX62 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc114Q3UX62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc114Q3UX62 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc114Q3UX62 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc114Q3UX62 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc114Q3UX62 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc114Q3UX62 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc114Q3UX62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc114Q3UX62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc114Q3UX62 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc114Q3UX62 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc114Q3UX62 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc114Q3UX62 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc114Q3UX62 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc114Q3UX62 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc114Q3UX62 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc114Q3UX62 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc114Q3UX62 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc114Q3UX62 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc114Q3UX62 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc114Q3UX62 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc114Q3UX62 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc114Q3UX62 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc114Q3UX62 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc114Q3UX62 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc114Q3UX62 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc114Q3UX62 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc114Q3UX62 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.5 ms