Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV70

Pdp1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp1Q3UV70 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdp1Q3UV70 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdp1Q3UV70 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdp1Q3UV70 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdp1Q3UV70 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp1Q3UV70 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdp1Q3UV70 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdp1Q3UV70 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdp1Q3UV70 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp1Q3UV70 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp1Q3UV70 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp1Q3UV70 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp1Q3UV70 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp1Q3UV70 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdp1Q3UV70 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdp1Q3UV70 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdp1Q3UV70 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp1Q3UV70 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdp1Q3UV70 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdp1Q3UV70 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdp1Q3UV70 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdp1Q3UV70 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdp1Q3UV70 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp1Q3UV70 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp1Q3UV70 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdp1Q3UV70 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdp1Q3UV70 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdp1Q3UV70 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdp1Q3UV70 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp1Q3UV70 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp1Q3UV70 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp1Q3UV70 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdp1Q3UV70 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdp1Q3UV70 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdp1Q3UV70 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdp1Q3UV70 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdp1Q3UV70 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdp1Q3UV70 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdp1Q3UV70 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdp1Q3UV70 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdp1Q3UV70 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdp1Q3UV70 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdp1Q3UV70 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdp1Q3UV70 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdp1Q3UV70 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdp1Q3UV70 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdp1Q3UV70 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdp1Q3UV70 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdp1Q3UV70 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdp1Q3UV70 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdp1Q3UV70 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdp1Q3UV70 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdp1Q3UV70 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdp1Q3UV70 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdp1Q3UV70 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdp1Q3UV70 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdp1Q3UV70 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdp1Q3UV70 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdp1Q3UV70 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdp1Q3UV70 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdp1Q3UV70 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdp1Q3UV70 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdp1Q3UV70 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdp1Q3UV70 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdp1Q3UV70 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdp1Q3UV70 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdp1Q3UV70 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdp1Q3UV70 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdp1Q3UV70 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdp1Q3UV70 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdp1Q3UV70 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdp1Q3UV70 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdp1Q3UV70 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdp1Q3UV70 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdp1Q3UV70 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms