Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp1r12cQ3UMT1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp1r12cQ3UMT1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppp1r12cQ3UMT1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp1r12cQ3UMT1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ppp1r12cQ3UMT1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp1r12cQ3UMT1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp1r12cQ3UMT1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppp1r12cQ3UMT1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppp1r12cQ3UMT1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp1r12cQ3UMT1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp1r12cQ3UMT1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp1r12cQ3UMT1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp1r12cQ3UMT1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ppp1r12cQ3UMT1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp1r12cQ3UMT1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp1r12cQ3UMT1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp1r12cQ3UMT1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ppp1r12cQ3UMT1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r12cQ3UMT1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp1r12cQ3UMT1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp1r12cQ3UMT1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ppp1r12cQ3UMT1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp1r12cQ3UMT1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp1r12cQ3UMT1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp1r12cQ3UMT1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp1r12cQ3UMT1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ppp1r12cQ3UMT1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ppp1r12cQ3UMT1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp1r12cQ3UMT1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp1r12cQ3UMT1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp1r12cQ3UMT1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp1r12cQ3UMT1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp1r12cQ3UMT1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp1r12cQ3UMT1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r12cQ3UMT1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Ppp1r12cQ3UMT1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp1r12cQ3UMT1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppp1r12cQ3UMT1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp1r12cQ3UMT1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppp1r12cQ3UMT1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp1r12cQ3UMT1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp1r12cQ3UMT1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppp1r12cQ3UMT1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp1r12cQ3UMT1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp1r12cQ3UMT1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r12cQ3UMT1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r12cQ3UMT1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r12cQ3UMT1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r12cQ3UMT1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppp1r12cQ3UMT1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ppp1r12cQ3UMT1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppp1r12cQ3UMT1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp1r12cQ3UMT1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp1r12cQ3UMT1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppp1r12cQ3UMT1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms