Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ppp1r12cQ3UMT1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ppp1r12cQ3UMT1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ppp1r12cQ3UMT1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ppp1r12cQ3UMT1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ppp1r12cQ3UMT1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ppp1r12cQ3UMT1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ppp1r12cQ3UMT1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ppp1r12cQ3UMT1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ppp1r12cQ3UMT1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Ppp1r12cQ3UMT1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ppp1r12cQ3UMT1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ppp1r12cQ3UMT1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Ppp1r12cQ3UMT1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ppp1r12cQ3UMT1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ppp1r12cQ3UMT1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ppp1r12cQ3UMT1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ppp1r12cQ3UMT1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,08
Ppp1r12cQ3UMT1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ppp1r12cQ3UMT1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ppp1r12cQ3UMT1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Ppp1r12cQ3UMT1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Ppp1r12cQ3UMT1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ppp1r12cQ3UMT1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ppp1r12cQ3UMT1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ppp1r12cQ3UMT1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Ppp1r12cQ3UMT1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Ppp1r12cQ3UMT1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ppp1r12cQ3UMT1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ppp1r12cQ3UMT1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ppp1r12cQ3UMT1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Ppp1r12cQ3UMT1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,05
Ppp1r12cQ3UMT1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ppp1r12cQ3UMT1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ppp1r12cQ3UMT1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ppp1r12cQ3UMT1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ppp1r12cQ3UMT1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Ppp1r12cQ3UMT1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ppp1r12cQ3UMT1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ppp1r12cQ3UMT1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ppp1r12cQ3UMT1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ppp1r12cQ3UMT1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ppp1r12cQ3UMT1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ppp1r12cQ3UMT1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,76■■■□□ 2,04
Ppp1r12cQ3UMT1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ppp1r12cQ3UMT1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ppp1r12cQ3UMT1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Ppp1r12cQ3UMT1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ppp1r12cQ3UMT1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ppp1r12cQ3UMT1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ppp1r12cQ3UMT1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ppp1r12cQ3UMT1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ppp1r12cQ3UMT1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ppp1r12cQ3UMT1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ppp1r12cQ3UMT1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,64■■■□□ 2,02
Ppp1r12cQ3UMT1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ppp1r12cQ3UMT1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ppp1r12cQ3UMT1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ppp1r12cQ3UMT1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ppp1r12cQ3UMT1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ppp1r12cQ3UMT1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ppp1r12cQ3UMT1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ppp1r12cQ3UMT1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Ppp1r12cQ3UMT1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ppp1r12cQ3UMT1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ppp1r12cQ3UMT1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Ppp1r12cQ3UMT1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ppp1r12cQ3UMT1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ppp1r12cQ3UMT1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ppp1r12cQ3UMT1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ppp1r12cQ3UMT1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ppp1r12cQ3UMT1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Ppp1r12cQ3UMT1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ppp1r12cQ3UMT1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ppp1r12cQ3UMT1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Ppp1r12cQ3UMT1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ppp1r12cQ3UMT1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,8 ms