Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIA2

Arhgap17, Rho GTPase-activating protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap17Q3UIA2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Arhgap17Q3UIA2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgap17Q3UIA2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgap17Q3UIA2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgap17Q3UIA2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Arhgap17Q3UIA2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgap17Q3UIA2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgap17Q3UIA2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgap17Q3UIA2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgap17Q3UIA2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgap17Q3UIA2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgap17Q3UIA2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Arhgap17Q3UIA2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgap17Q3UIA2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgap17Q3UIA2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arhgap17Q3UIA2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgap17Q3UIA2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arhgap17Q3UIA2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgap17Q3UIA2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgap17Q3UIA2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arhgap17Q3UIA2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgap17Q3UIA2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgap17Q3UIA2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgap17Q3UIA2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgap17Q3UIA2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgap17Q3UIA2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgap17Q3UIA2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Arhgap17Q3UIA2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgap17Q3UIA2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arhgap17Q3UIA2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgap17Q3UIA2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgap17Q3UIA2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgap17Q3UIA2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgap17Q3UIA2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgap17Q3UIA2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgap17Q3UIA2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgap17Q3UIA2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgap17Q3UIA2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgap17Q3UIA2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arhgap17Q3UIA2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arhgap17Q3UIA2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arhgap17Q3UIA2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgap17Q3UIA2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgap17Q3UIA2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgap17Q3UIA2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgap17Q3UIA2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Arhgap17Q3UIA2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgap17Q3UIA2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgap17Q3UIA2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgap17Q3UIA2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgap17Q3UIA2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgap17Q3UIA2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgap17Q3UIA2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgap17Q3UIA2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arhgap17Q3UIA2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arhgap17Q3UIA2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgap17Q3UIA2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgap17Q3UIA2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arhgap17Q3UIA2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgap17Q3UIA2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgap17Q3UIA2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgap17Q3UIA2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgap17Q3UIA2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arhgap17Q3UIA2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgap17Q3UIA2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgap17Q3UIA2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgap17Q3UIA2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgap17Q3UIA2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgap17Q3UIA2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgap17Q3UIA2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgap17Q3UIA2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgap17Q3UIA2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgap17Q3UIA2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgap17Q3UIA2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgap17Q3UIA2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgap17Q3UIA2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgap17Q3UIA2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgap17Q3UIA2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgap17Q3UIA2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arhgap17Q3UIA2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arhgap17Q3UIA2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgap17Q3UIA2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgap17Q3UIA2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arhgap17Q3UIA2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgap17Q3UIA2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgap17Q3UIA2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgap17Q3UIA2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms