Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM8

Hk3, Hexokinase-3, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hk3Q3TRM8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hk3Q3TRM8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hk3Q3TRM8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hk3Q3TRM8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hk3Q3TRM8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hk3Q3TRM8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hk3Q3TRM8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hk3Q3TRM8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hk3Q3TRM8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hk3Q3TRM8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hk3Q3TRM8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hk3Q3TRM8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hk3Q3TRM8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hk3Q3TRM8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hk3Q3TRM8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hk3Q3TRM8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hk3Q3TRM8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hk3Q3TRM8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hk3Q3TRM8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hk3Q3TRM8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hk3Q3TRM8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hk3Q3TRM8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hk3Q3TRM8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hk3Q3TRM8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hk3Q3TRM8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hk3Q3TRM8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hk3Q3TRM8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hk3Q3TRM8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hk3Q3TRM8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hk3Q3TRM8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hk3Q3TRM8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hk3Q3TRM8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hk3Q3TRM8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hk3Q3TRM8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hk3Q3TRM8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hk3Q3TRM8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hk3Q3TRM8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hk3Q3TRM8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hk3Q3TRM8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hk3Q3TRM8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hk3Q3TRM8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hk3Q3TRM8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hk3Q3TRM8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hk3Q3TRM8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hk3Q3TRM8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hk3Q3TRM8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hk3Q3TRM8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hk3Q3TRM8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hk3Q3TRM8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hk3Q3TRM8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hk3Q3TRM8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hk3Q3TRM8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hk3Q3TRM8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hk3Q3TRM8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hk3Q3TRM8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hk3Q3TRM8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hk3Q3TRM8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hk3Q3TRM8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hk3Q3TRM8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hk3Q3TRM8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hk3Q3TRM8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hk3Q3TRM8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hk3Q3TRM8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hk3Q3TRM8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hk3Q3TRM8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hk3Q3TRM8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hk3Q3TRM8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hk3Q3TRM8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hk3Q3TRM8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hk3Q3TRM8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hk3Q3TRM8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hk3Q3TRM8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hk3Q3TRM8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hk3Q3TRM8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hk3Q3TRM8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hk3Q3TRM8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hk3Q3TRM8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hk3Q3TRM8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hk3Q3TRM8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hk3Q3TRM8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hk3Q3TRM8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hk3Q3TRM8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hk3Q3TRM8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hk3Q3TRM8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms