Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cnnm3Q32NY4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cnnm3Q32NY4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Cnnm3Q32NY4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cnnm3Q32NY4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cnnm3Q32NY4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cnnm3Q32NY4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cnnm3Q32NY4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cnnm3Q32NY4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cnnm3Q32NY4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Cnnm3Q32NY4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cnnm3Q32NY4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Cnnm3Q32NY4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cnnm3Q32NY4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Cnnm3Q32NY4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cnnm3Q32NY4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cnnm3Q32NY4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cnnm3Q32NY4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cnnm3Q32NY4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cnnm3Q32NY4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cnnm3Q32NY4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cnnm3Q32NY4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cnnm3Q32NY4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cnnm3Q32NY4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cnnm3Q32NY4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cnnm3Q32NY4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cnnm3Q32NY4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cnnm3Q32NY4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cnnm3Q32NY4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cnnm3Q32NY4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cnnm3Q32NY4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cnnm3Q32NY4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cnnm3Q32NY4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cnnm3Q32NY4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cnnm3Q32NY4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Cnnm3Q32NY4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cnnm3Q32NY4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cnnm3Q32NY4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cnnm3Q32NY4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cnnm3Q32NY4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Cnnm3Q32NY4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cnnm3Q32NY4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cnnm3Q32NY4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cnnm3Q32NY4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cnnm3Q32NY4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cnnm3Q32NY4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cnnm3Q32NY4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cnnm3Q32NY4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cnnm3Q32NY4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cnnm3Q32NY4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cnnm3Q32NY4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cnnm3Q32NY4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cnnm3Q32NY4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cnnm3Q32NY4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cnnm3Q32NY4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cnnm3Q32NY4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cnnm3Q32NY4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cnnm3Q32NY4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cnnm3Q32NY4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cnnm3Q32NY4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cnnm3Q32NY4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cnnm3Q32NY4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cnnm3Q32NY4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cnnm3Q32NY4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cnnm3Q32NY4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cnnm3Q32NY4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cnnm3Q32NY4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cnnm3Q32NY4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cnnm3Q32NY4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cnnm3Q32NY4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cnnm3Q32NY4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cnnm3Q32NY4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cnnm3Q32NY4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnnm3Q32NY4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cnnm3Q32NY4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cnnm3Q32NY4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cnnm3Q32NY4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cnnm3Q32NY4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cnnm3Q32NY4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cnnm3Q32NY4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cnnm3Q32NY4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cnnm3Q32NY4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cnnm3Q32NY4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnnm3Q32NY4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnnm3Q32NY4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Cnnm3Q32NY4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cnnm3Q32NY4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cnnm3Q32NY4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cnnm3Q32NY4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cnnm3Q32NY4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnnm3Q32NY4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnnm3Q32NY4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnnm3Q32NY4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnnm3Q32NY4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnnm3Q32NY4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cnnm3Q32NY4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cnnm3Q32NY4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cnnm3Q32NY4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cnnm3Q32NY4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cnnm3Q32NY4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms