Protein–RNA interactions for Protein: Q14C10

Vmn1r15, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r15Q14C10 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Vmn1r15Q14C10 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
Vmn1r15Q14C10 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Vmn1r15Q14C10 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Vmn1r15Q14C10 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Vmn1r15Q14C10 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Vmn1r15Q14C10 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Vmn1r15Q14C10 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Vmn1r15Q14C10 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Vmn1r15Q14C10 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Vmn1r15Q14C10 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Vmn1r15Q14C10 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Vmn1r15Q14C10 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,67■■□□□ 1,06
Vmn1r15Q14C10 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Vmn1r15Q14C10 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Vmn1r15Q14C10 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Vmn1r15Q14C10 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,64■■□□□ 1,06
Vmn1r15Q14C10 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Vmn1r15Q14C10 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Vmn1r15Q14C10 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Vmn1r15Q14C10 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Vmn1r15Q14C10 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Vmn1r15Q14C10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Vmn1r15Q14C10 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Vmn1r15Q14C10 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,6■■□□□ 1,05
Vmn1r15Q14C10 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Vmn1r15Q14C10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21,58■■□□□ 1,04
Vmn1r15Q14C10 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Vmn1r15Q14C10 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Vmn1r15Q14C10 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,04
Vmn1r15Q14C10 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,56■■□□□ 1,04
Vmn1r15Q14C10 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Vmn1r15Q14C10 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Vmn1r15Q14C10 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Vmn1r15Q14C10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Vmn1r15Q14C10 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Vmn1r15Q14C10 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Vmn1r15Q14C10 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
Vmn1r15Q14C10 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,5■■□□□ 1,03
Vmn1r15Q14C10 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Vmn1r15Q14C10 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Vmn1r15Q14C10 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Vmn1r15Q14C10 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Vmn1r15Q14C10 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Vmn1r15Q14C10 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Vmn1r15Q14C10 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Vmn1r15Q14C10 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Vmn1r15Q14C10 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Vmn1r15Q14C10 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Vmn1r15Q14C10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Vmn1r15Q14C10 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Vmn1r15Q14C10 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Vmn1r15Q14C10 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Vmn1r15Q14C10 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Vmn1r15Q14C10 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21,36■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Vmn1r15Q14C10 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21,33■■□□□ 1
Vmn1r15Q14C10 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Vmn1r15Q14C10 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Vmn1r15Q14C10 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Vmn1r15Q14C10 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Vmn1r15Q14C10 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Vmn1r15Q14C10 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
Vmn1r15Q14C10 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Vmn1r15Q14C10 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Vmn1r15Q14C10 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Vmn1r15Q14C10 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Vmn1r15Q14C10 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Vmn1r15Q14C10 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
Vmn1r15Q14C10 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Vmn1r15Q14C10 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Vmn1r15Q14C10 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Vmn1r15Q14C10 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Vmn1r15Q14C10 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Vmn1r15Q14C10 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21,23■□□□□ 0,99
Vmn1r15Q14C10 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Vmn1r15Q14C10 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Vmn1r15Q14C10 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Vmn1r15Q14C10 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Vmn1r15Q14C10 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Vmn1r15Q14C10 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Vmn1r15Q14C10 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Vmn1r15Q14C10 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Vmn1r15Q14C10 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Vmn1r15Q14C10 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Vmn1r15Q14C10 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Vmn1r15Q14C10 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Vmn1r15Q14C10 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms