Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 YSP3YOR003W 1437 nt11.97□□□□□ -0.49
RTP1Q12751 RTF1YGL244W 1677 nt11.97□□□□□ -0.49
RTP1Q12751 BDH1YAL060W 1149 nt11.96□□□□□ -0.49
RTP1Q12751 YLL053CYLL053C 459 nt11.96□□□□□ -0.49
RTP1Q12751 YNL195CYNL195C 786 nt11.96□□□□□ -0.49
RTP1Q12751 YNL115CYNL115C 1935 nt11.96□□□□□ -0.5
RTP1Q12751 YLR415CYLR415C 339 nt11.94□□□□□ -0.5
RTP1Q12751 FTR1YER145C 1215 nt11.93□□□□□ -0.5
RTP1Q12751 MSF1YPR047W 1410 nt11.93□□□□□ -0.5
RTP1Q12751 GAL1YBR020W 1587 nt11.88□□□□□ -0.51
RTP1Q12751 BIO4YNR057C 714 nt11.88□□□□□ -0.51
RTP1Q12751 THI74YDR438W 1113 nt11.87□□□□□ -0.51
RTP1Q12751 MIR1YJR077C 936 nt11.85□□□□□ -0.51
RTP1Q12751 PTK1YKL198C 1989 nt11.85□□□□□ -0.51
RTP1Q12751 BOP3YNL042W 1191 nt11.84□□□□□ -0.51
RTP1Q12751 STB1YNL309W 1263 nt11.84□□□□□ -0.51
RTP1Q12751 RRT12YCR045C 1476 nt11.83□□□□□ -0.52
RTP1Q12751 TRM5YHR070W 1500 nt11.83□□□□□ -0.52
RTP1Q12751 SPC25YER018C 666 nt11.83□□□□□ -0.52
RTP1Q12751 SIM1YIL123W 1431 nt11.83□□□□□ -0.52
RTP1Q12751 CCT4YDL143W 1587 nt11.83□□□□□ -0.52
RTP1Q12751 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.82□□□□□ -0.52
RTP1Q12751 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.82□□□□□ -0.52
RTP1Q12751 YMR244WYMR244W 1068 nt11.82□□□□□ -0.52
RTP1Q12751 VPS75YNL246W 795 nt11.81□□□□□ -0.52
RTP1Q12751 GPI16YHR188C 1833 nt11.79□□□□□ -0.52
RTP1Q12751 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.77□□□□□ -0.53
RTP1Q12751 SWC5YBR231C 912 nt11.76□□□□□ -0.53
RTP1Q12751 DDR2YOL052C-A 186 nt11.75□□□□□ -0.53
RTP1Q12751 VPS60YDR486C 690 nt11.72□□□□□ -0.53
RTP1Q12751 YFL067WYFL067W 528 nt11.72□□□□□ -0.53
RTP1Q12751 GLR1YPL091W 1452 nt11.7□□□□□ -0.54
RTP1Q12751 ATF2YGR177C 1608 nt11.69□□□□□ -0.54
RTP1Q12751 DAT1YML113W 747 nt11.69□□□□□ -0.54
RTP1Q12751 NCP1YHR042W 2076 nt11.68□□□□□ -0.54
RTP1Q12751 ERF2YLR246W 1080 nt11.68□□□□□ -0.54
RTP1Q12751 SPT8YLR055C 1809 nt11.67□□□□□ -0.54
RTP1Q12751 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.66□□□□□ -0.54
RTP1Q12751 PAU7YAR020C 168 nt11.66□□□□□ -0.54
RTP1Q12751 ALG3YBL082C 1377 nt11.65□□□□□ -0.55
RTP1Q12751 YGL034CYGL034C 366 nt11.63□□□□□ -0.55
RTP1Q12751 FEN2YCR028C 1539 nt11.63□□□□□ -0.55
RTP1Q12751 ANP1YEL036C 1503 nt11.6□□□□□ -0.55
RTP1Q12751 RBG2YGR173W 1107 nt11.59□□□□□ -0.55
RTP1Q12751 CRR1YLR213C 1269 nt11.59□□□□□ -0.55
RTP1Q12751 UBA4YHR111W 1323 nt11.59□□□□□ -0.55
RTP1Q12751 TIM17YJL143W 477 nt11.55□□□□□ -0.56
RTP1Q12751 NDI1YML120C 1542 nt11.55□□□□□ -0.56
RTP1Q12751 YSR3YKR053C 1215 nt11.53□□□□□ -0.56
RTP1Q12751 UME6YDR207C 2511 nt11.52□□□□□ -0.56
RTP1Q12751 YIR016WYIR016W 798 nt11.52□□□□□ -0.57
RTP1Q12751 SHB17YKR043C 816 nt11.52□□□□□ -0.57
RTP1Q12751 BOR1YNL275W 1731 nt11.52□□□□□ -0.57
RTP1Q12751 SNG1YGR197C 1644 nt11.49□□□□□ -0.57
RTP1Q12751 YFL054CYFL054C 1941 nt11.48□□□□□ -0.57
RTP1Q12751 HEM12YDR047W 1089 nt11.48□□□□□ -0.57
RTP1Q12751 RBG1YAL036C 1110 nt11.47□□□□□ -0.57
RTP1Q12751 XYL2YLR070C 1071 nt11.46□□□□□ -0.57
RTP1Q12751 YMR226CYMR226C 804 nt11.42□□□□□ -0.58
RTP1Q12751 MIC10YCL057C-A 294 nt11.42□□□□□ -0.58
RTP1Q12751 SHM2YLR058C 1410 nt11.42□□□□□ -0.58
RTP1Q12751 YCR087WYCR087W 516 nt11.41□□□□□ -0.58
RTP1Q12751 YDR010CYDR010C 333 nt11.41□□□□□ -0.58
RTP1Q12751 RPM1RPM1 483 nt11.4□□□□□ -0.58
RTP1Q12751 RET2YFR051C 1641 nt11.36□□□□□ -0.59
RTP1Q12751 LYS4YDR234W 2082 nt11.36□□□□□ -0.59
RTP1Q12751 AIM45YPR004C 1035 nt11.35□□□□□ -0.59
RTP1Q12751 XDJ1YLR090W 1380 nt11.35□□□□□ -0.59
RTP1Q12751 PHO89YBR296C 1725 nt11.35□□□□□ -0.59
RTP1Q12751 SGT2YOR007C 1041 nt11.34□□□□□ -0.59
RTP1Q12751 NIT1YIL164C 600 nt11.32□□□□□ -0.6
RTP1Q12751 SAM1YLR180W 1149 nt11.32□□□□□ -0.6
RTP1Q12751 BNA2YJR078W 1362 nt11.28□□□□□ -0.6
RTP1Q12751 GDH3YAL062W 1374 nt11.27□□□□□ -0.61
RTP1Q12751 SWE1YJL187C 2460 nt11.26□□□□□ -0.61
RTP1Q12751 MRP20YDR405W 792 nt11.25□□□□□ -0.61
RTP1Q12751 HSP60YLR259C 1719 nt11.24□□□□□ -0.61
RTP1Q12751 MIC12YBR262C 321 nt11.24□□□□□ -0.61
RTP1Q12751 YLR111WYLR111W 333 nt11.21□□□□□ -0.61
RTP1Q12751 YGR201CYGR201C 678 nt11.18□□□□□ -0.62
RTP1Q12751 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.18□□□□□ -0.62
RTP1Q12751 ALG12YNR030W 1656 nt11.17□□□□□ -0.62
RTP1Q12751 COQ2YNR041C 1119 nt11.17□□□□□ -0.62
RTP1Q12751 MCH5YOR306C 1566 nt11.15□□□□□ -0.62
RTP1Q12751 HHO1YPL127C 777 nt11.14□□□□□ -0.63
RTP1Q12751 RAX1YOR301W 1308 nt11.13□□□□□ -0.63
RTP1Q12751 FRE6YLL051C 2139 nt11.12□□□□□ -0.63
RTP1Q12751 AVT6YER119C 1347 nt11.09□□□□□ -0.63
RTP1Q12751 RAD51YER095W 1203 nt11.09□□□□□ -0.63
RTP1Q12751 RPL4BYDR012W 1089 nt11.08□□□□□ -0.64
RTP1Q12751 RPL4AYBR031W 1089 nt11.08□□□□□ -0.64
RTP1Q12751 SFA1YDL168W 1161 nt11.07□□□□□ -0.64
RTP1Q12751 YCR102CYCR102C 1107 nt11.05□□□□□ -0.64
RTP1Q12751 SDH5YOL071W 489 nt11.05□□□□□ -0.64
RTP1Q12751 GOR1YNL274C 1053 nt11.04□□□□□ -0.64
RTP1Q12751 RAD23YEL037C 1197 nt11.03□□□□□ -0.64
RTP1Q12751 CLB6YGR109C 1143 nt11.03□□□□□ -0.64
RTP1Q12751 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.02□□□□□ -0.65
RTP1Q12751 RPS14BYJL191W 417 nt10.99□□□□□ -0.65
RTP1Q12751 STE4YOR212W 1272 nt10.98□□□□□ -0.65
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