Protein–RNA interactions for Protein: Q12505

SKS1, Serine/threonine-protein kinase SKS1, yeastyeast

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKS1Q12505 YLR179CYLR179C 606 nt10.3□□□□□ -0.76
SKS1Q12505 YFL067WYFL067W 528 nt10.29□□□□□ -0.76
SKS1Q12505 WSC2YNL283C 1512 nt10.28□□□□□ -0.76
SKS1Q12505 AHT1YHR093W 549 nt10.27□□□□□ -0.77
SKS1Q12505 YFL054CYFL054C 1941 nt10.26□□□□□ -0.77
SKS1Q12505 HUA1YGR268C 597 nt10.24□□□□□ -0.77
SKS1Q12505 HEM12YDR047W 1089 nt10.23□□□□□ -0.77
SKS1Q12505 SPC25YER018C 666 nt10.23□□□□□ -0.77
SKS1Q12505 DDR2YOL052C-A 186 nt10.23□□□□□ -0.77
SKS1Q12505 MIC10YCL057C-A 294 nt10.23□□□□□ -0.77
SKS1Q12505 SNG1YGR197C 1644 nt10.22□□□□□ -0.77
SKS1Q12505 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.22□□□□□ -0.77
SKS1Q12505 STB1YNL309W 1263 nt10.21□□□□□ -0.77
SKS1Q12505 YPR064WYPR064W 420 nt10.2□□□□□ -0.78
SKS1Q12505 SPT8YLR055C 1809 nt10.19□□□□□ -0.78
SKS1Q12505 ANP1YEL036C 1503 nt10.19□□□□□ -0.78
SKS1Q12505 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.17□□□□□ -0.78
SKS1Q12505 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.17□□□□□ -0.78
SKS1Q12505 TAD3YLR316C 969 nt10.17□□□□□ -0.78
SKS1Q12505 GPI16YHR188C 1833 nt10.14□□□□□ -0.79
SKS1Q12505 CCT4YDL143W 1587 nt10.14□□□□□ -0.79
SKS1Q12505 FRE6YLL051C 2139 nt10.12□□□□□ -0.79
SKS1Q12505 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.12□□□□□ -0.79
SKS1Q12505 FEN2YCR028C 1539 nt10.12□□□□□ -0.79
SKS1Q12505 BOR1YNL275W 1731 nt10.11□□□□□ -0.79
SKS1Q12505 VPS60YDR486C 690 nt10.1□□□□□ -0.79
SKS1Q12505 SWE1YJL187C 2460 nt10.08□□□□□ -0.8
SKS1Q12505 ALG3YBL082C 1377 nt10.07□□□□□ -0.8
SKS1Q12505 RAX1YOR301W 1308 nt10.07□□□□□ -0.8
SKS1Q12505 BDH1YAL060W 1149 nt10.06□□□□□ -0.8
SKS1Q12505 MIC12YBR262C 321 nt10.04□□□□□ -0.8
SKS1Q12505 YIR016WYIR016W 798 nt10.03□□□□□ -0.8
SKS1Q12505 SWC5YBR231C 912 nt10.02□□□□□ -0.81
SKS1Q12505 YSP3YOR003W 1437 nt9.99□□□□□ -0.81
SKS1Q12505 YLR415CYLR415C 339 nt9.98□□□□□ -0.81
SKS1Q12505 BNA2YJR078W 1362 nt9.98□□□□□ -0.81
SKS1Q12505 UBX6YJL048C 1191 nt9.97□□□□□ -0.81
SKS1Q12505 UME6YDR207C 2511 nt9.96□□□□□ -0.82
SKS1Q12505 YDR094WYDR094W 336 nt9.95□□□□□ -0.82
SKS1Q12505 CCA1YER168C 1641 nt9.95□□□□□ -0.82
SKS1Q12505 YFR018CYFR018C 1092 nt9.93□□□□□ -0.82
SKS1Q12505 PEX25YPL112C 1185 nt9.9□□□□□ -0.82
SKS1Q12505 YGR201CYGR201C 678 nt9.87□□□□□ -0.83
SKS1Q12505 HHO1YPL127C 777 nt9.87□□□□□ -0.83
SKS1Q12505 YNL115CYNL115C 1935 nt9.87□□□□□ -0.83
SKS1Q12505 AGP1YCL025C 1902 nt9.86□□□□□ -0.83
SKS1Q12505 XDJ1YLR090W 1380 nt9.85□□□□□ -0.83
SKS1Q12505 YFL066CYFL066C 1179 nt9.84□□□□□ -0.83
SKS1Q12505 PRE6YOL038W 765 nt9.82□□□□□ -0.84
SKS1Q12505 SHM2YLR058C 1410 nt9.81□□□□□ -0.84
SKS1Q12505 TIM17YJL143W 477 nt9.79□□□□□ -0.84
SKS1Q12505 GDH3YAL062W 1374 nt9.78□□□□□ -0.84
SKS1Q12505 VPS75YNL246W 795 nt9.78□□□□□ -0.84
SKS1Q12505 NIT1YIL164C 600 nt9.75□□□□□ -0.85
SKS1Q12505 FUR4YBR021W 1902 nt9.74□□□□□ -0.85
SKS1Q12505 RRT5YFR032C 870 nt9.73□□□□□ -0.85
SKS1Q12505 DUT1YBR252W 444 nt9.73□□□□□ -0.85
SKS1Q12505 AVT6YER119C 1347 nt9.73□□□□□ -0.85
SKS1Q12505 PAU16YKL224C 372 nt9.72□□□□□ -0.85
SKS1Q12505 DAT1YML113W 747 nt9.69□□□□□ -0.86
SKS1Q12505 MCH5YOR306C 1566 nt9.69□□□□□ -0.86
SKS1Q12505 GOR1YNL274C 1053 nt9.68□□□□□ -0.86
SKS1Q12505 SGT2YOR007C 1041 nt9.68□□□□□ -0.86
SKS1Q12505 HSP60YLR259C 1719 nt9.68□□□□□ -0.86
SKS1Q12505 YCL074WYCL074W 927 nt9.67□□□□□ -0.86
SKS1Q12505 ALG12YNR030W 1656 nt9.65□□□□□ -0.86
SKS1Q12505 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.65□□□□□ -0.86
SKS1Q12505 DUS1YML080W 1272 nt9.65□□□□□ -0.86
SKS1Q12505 GLK1YCL040W 1503 nt9.65□□□□□ -0.86
SKS1Q12505 STR3YGL184C 1398 nt9.63□□□□□ -0.87
SKS1Q12505 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.62□□□□□ -0.87
SKS1Q12505 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.62□□□□□ -0.87
SKS1Q12505 MIR1YJR077C 936 nt9.62□□□□□ -0.87
SKS1Q12505 YCR102CYCR102C 1107 nt9.57□□□□□ -0.88
SKS1Q12505 YDR010CYDR010C 333 nt9.55□□□□□ -0.88
SKS1Q12505 NBP35YGL091C 987 nt9.55□□□□□ -0.88
SKS1Q12505 BSP1YPR171W 1731 nt9.54□□□□□ -0.88
SKS1Q12505 PRP4YPR178W 1398 nt9.54□□□□□ -0.88
SKS1Q12505 PAU7YAR020C 168 nt9.54□□□□□ -0.88
SKS1Q12505 YKR005CYKR005C 1578 nt9.54□□□□□ -0.88
SKS1Q12505 SHB17YKR043C 816 nt9.53□□□□□ -0.88
SKS1Q12505 AQY2YLL052C 450 nt9.52□□□□□ -0.89
SKS1Q12505 THI74YDR438W 1113 nt9.51□□□□□ -0.89
SKS1Q12505 NAT4YMR069W 858 nt9.49□□□□□ -0.89
SKS1Q12505 YGR259CYGR259C 441 nt9.48□□□□□ -0.89
SKS1Q12505 UBA4YHR111W 1323 nt9.48□□□□□ -0.89
SKS1Q12505 DPS1YLL018C 1674 nt9.48□□□□□ -0.89
SKS1Q12505 MSF1YPR047W 1410 nt9.47□□□□□ -0.89
SKS1Q12505 RET2YFR051C 1641 nt9.46□□□□□ -0.89
SKS1Q12505 RTN2YDL204W 1182 nt9.46□□□□□ -0.9
SKS1Q12505 ARP6YLR085C 1317 nt9.45□□□□□ -0.9
SKS1Q12505 SSN3YPL042C 1668 nt9.45□□□□□ -0.9
SKS1Q12505 TIR3YIL011W 810 nt9.44□□□□□ -0.9
SKS1Q12505 BMT6YLR063W 1098 nt9.42□□□□□ -0.9
SKS1Q12505 SHH4YLR164W 507 nt9.42□□□□□ -0.9
SKS1Q12505 SFA1YDL168W 1161 nt9.41□□□□□ -0.9
SKS1Q12505 LSC2YGR244C 1284 nt9.39□□□□□ -0.91
SKS1Q12505 AAC1YMR056C 930 nt9.39□□□□□ -0.91
SKS1Q12505 YSR3YKR053C 1215 nt9.38□□□□□ -0.91
SKS1Q12505 PHO89YBR296C 1725 nt9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 88.6 ms