Protein–RNA interactions for Protein: Q12463

TRM11, tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM11Q12463 BDH1YAL060W 1149 nt12.09□□□□□ -0.47
TRM11Q12463 NAT4YMR069W 858 nt12.09□□□□□ -0.47
TRM11Q12463 YSP3YOR003W 1437 nt12.09□□□□□ -0.47
TRM11Q12463 SIM1YIL123W 1431 nt12.08□□□□□ -0.48
TRM11Q12463 GAL1YBR020W 1587 nt12.08□□□□□ -0.48
TRM11Q12463 YNL115CYNL115C 1935 nt12.06□□□□□ -0.48
TRM11Q12463 YLR415CYLR415C 339 nt12.04□□□□□ -0.48
TRM11Q12463 TRM5YHR070W 1500 nt12.04□□□□□ -0.48
TRM11Q12463 GLK1YCL040W 1503 nt12.02□□□□□ -0.48
TRM11Q12463 Q0182Q0182 405 nt12.02□□□□□ -0.49
TRM11Q12463 STB1YNL309W 1263 nt12.01□□□□□ -0.49
TRM11Q12463 SPC25YER018C 666 nt11.99□□□□□ -0.49
TRM11Q12463 CCT4YDL143W 1587 nt11.99□□□□□ -0.49
TRM11Q12463 MSF1YPR047W 1410 nt11.95□□□□□ -0.5
TRM11Q12463 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.95□□□□□ -0.5
TRM11Q12463 RTF1YGL244W 1677 nt11.94□□□□□ -0.5
TRM11Q12463 DDR2YOL052C-A 186 nt11.94□□□□□ -0.5
TRM11Q12463 GPI16YHR188C 1833 nt11.93□□□□□ -0.5
TRM11Q12463 ATF2YGR177C 1608 nt11.92□□□□□ -0.5
TRM11Q12463 THI74YDR438W 1113 nt11.91□□□□□ -0.5
TRM11Q12463 MIR1YJR077C 936 nt11.91□□□□□ -0.5
TRM11Q12463 SWC5YBR231C 912 nt11.91□□□□□ -0.5
TRM11Q12463 VPS60YDR486C 690 nt11.9□□□□□ -0.5
TRM11Q12463 YFL067WYFL067W 528 nt11.9□□□□□ -0.5
TRM11Q12463 VPS75YNL246W 795 nt11.89□□□□□ -0.51
TRM11Q12463 ERF2YLR246W 1080 nt11.88□□□□□ -0.51
TRM11Q12463 NVJ2YPR091C 2313 nt11.88□□□□□ -0.51
TRM11Q12463 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.85□□□□□ -0.51
TRM11Q12463 ALG3YBL082C 1377 nt11.84□□□□□ -0.51
TRM11Q12463 PTK1YKL198C 1989 nt11.83□□□□□ -0.52
TRM11Q12463 FEN2YCR028C 1539 nt11.82□□□□□ -0.52
TRM11Q12463 BOP3YNL042W 1191 nt11.82□□□□□ -0.52
TRM11Q12463 CRR1YLR213C 1269 nt11.81□□□□□ -0.52
TRM11Q12463 SPT8YLR055C 1809 nt11.8□□□□□ -0.52
TRM11Q12463 YMR244WYMR244W 1068 nt11.79□□□□□ -0.52
TRM11Q12463 ANP1YEL036C 1503 nt11.79□□□□□ -0.52
TRM11Q12463 DAT1YML113W 747 nt11.76□□□□□ -0.53
TRM11Q12463 PAU7YAR020C 168 nt11.74□□□□□ -0.53
TRM11Q12463 NCP1YHR042W 2076 nt11.74□□□□□ -0.53
TRM11Q12463 SNG1YGR197C 1644 nt11.72□□□□□ -0.53
TRM11Q12463 YIR016WYIR016W 798 nt11.71□□□□□ -0.53
TRM11Q12463 HEM12YDR047W 1089 nt11.7□□□□□ -0.54
TRM11Q12463 GLR1YPL091W 1452 nt11.7□□□□□ -0.54
TRM11Q12463 YGL034CYGL034C 366 nt11.68□□□□□ -0.54
TRM11Q12463 TIM17YJL143W 477 nt11.68□□□□□ -0.54
TRM11Q12463 MIC10YCL057C-A 294 nt11.68□□□□□ -0.54
TRM11Q12463 UBA4YHR111W 1323 nt11.66□□□□□ -0.54
TRM11Q12463 LYS4YDR234W 2082 nt11.63□□□□□ -0.55
TRM11Q12463 SHB17YKR043C 816 nt11.62□□□□□ -0.55
TRM11Q12463 YSR3YKR053C 1215 nt11.6□□□□□ -0.55
TRM11Q12463 SHM2YLR058C 1410 nt11.59□□□□□ -0.55
TRM11Q12463 NDI1YML120C 1542 nt11.58□□□□□ -0.56
TRM11Q12463 RBG2YGR173W 1107 nt11.56□□□□□ -0.56
TRM11Q12463 XYL2YLR070C 1071 nt11.56□□□□□ -0.56
TRM11Q12463 YFL054CYFL054C 1941 nt11.54□□□□□ -0.56
TRM11Q12463 RBG1YAL036C 1110 nt11.54□□□□□ -0.56
TRM11Q12463 XDJ1YLR090W 1380 nt11.54□□□□□ -0.56
TRM11Q12463 YDR010CYDR010C 333 nt11.52□□□□□ -0.57
TRM11Q12463 SGT2YOR007C 1041 nt11.5□□□□□ -0.57
TRM11Q12463 NIT1YIL164C 600 nt11.49□□□□□ -0.57
TRM11Q12463 BNA2YJR078W 1362 nt11.49□□□□□ -0.57
TRM11Q12463 PHO89YBR296C 1725 nt11.46□□□□□ -0.58
TRM11Q12463 GDH3YAL062W 1374 nt11.45□□□□□ -0.58
TRM11Q12463 MIC12YBR262C 321 nt11.45□□□□□ -0.58
TRM11Q12463 RET2YFR051C 1641 nt11.45□□□□□ -0.58
TRM11Q12463 YCR087WYCR087W 516 nt11.44□□□□□ -0.58
TRM11Q12463 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.43□□□□□ -0.58
TRM11Q12463 AIM45YPR004C 1035 nt11.41□□□□□ -0.58
TRM11Q12463 YMR226CYMR226C 804 nt11.38□□□□□ -0.59
TRM11Q12463 RAX1YOR301W 1308 nt11.36□□□□□ -0.59
TRM11Q12463 YGR201CYGR201C 678 nt11.35□□□□□ -0.59
TRM11Q12463 HHO1YPL127C 777 nt11.35□□□□□ -0.59
TRM11Q12463 MRP20YDR405W 792 nt11.33□□□□□ -0.6
TRM11Q12463 BOR1YNL275W 1731 nt11.32□□□□□ -0.6
TRM11Q12463 AVT6YER119C 1347 nt11.3□□□□□ -0.6
TRM11Q12463 COQ2YNR041C 1119 nt11.29□□□□□ -0.6
TRM11Q12463 SWE1YJL187C 2460 nt11.28□□□□□ -0.6
TRM11Q12463 SAM1YLR180W 1149 nt11.27□□□□□ -0.61
TRM11Q12463 YLR111WYLR111W 333 nt11.23□□□□□ -0.61
TRM11Q12463 GOR1YNL274C 1053 nt11.23□□□□□ -0.61
TRM11Q12463 SFA1YDL168W 1161 nt11.22□□□□□ -0.61
TRM11Q12463 YCR102CYCR102C 1107 nt11.2□□□□□ -0.62
TRM11Q12463 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.18□□□□□ -0.62
TRM11Q12463 RPL4BYDR012W 1089 nt11.15□□□□□ -0.62
TRM11Q12463 RPL4AYBR031W 1089 nt11.15□□□□□ -0.62
TRM11Q12463 DUT1YBR252W 444 nt11.14□□□□□ -0.63
TRM11Q12463 HSP60YLR259C 1719 nt11.14□□□□□ -0.63
TRM11Q12463 UME6YDR207C 2511 nt11.13□□□□□ -0.63
TRM11Q12463 SDH5YOL071W 489 nt11.12□□□□□ -0.63
TRM11Q12463 AGP1YCL025C 1902 nt11.1□□□□□ -0.63
TRM11Q12463 CLB6YGR109C 1143 nt11.1□□□□□ -0.63
TRM11Q12463 RPS14BYJL191W 417 nt11.09□□□□□ -0.63
TRM11Q12463 RAD51YER095W 1203 nt11.07□□□□□ -0.64
TRM11Q12463 RAD23YEL037C 1197 nt11.06□□□□□ -0.64
TRM11Q12463 CCA1YER168C 1641 nt11.06□□□□□ -0.64
TRM11Q12463 SHH4YLR164W 507 nt11.05□□□□□ -0.64
TRM11Q12463 TIR3YIL011W 810 nt11.03□□□□□ -0.64
TRM11Q12463 NBP35YGL091C 987 nt11.02□□□□□ -0.65
TRM11Q12463 UTH1YKR042W 1098 nt11.02□□□□□ -0.65
TRM11Q12463 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.3 ms