Protein–RNA interactions for Protein: Q12408

NPC2, Phosphatidylglycerol/phosphatidylinositol transfer protein, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NPC2Q12408 WSC2YNL283C 1512 nt10.03□□□□□ -0.8
NPC2Q12408 AQY1YPR192W 918 nt10.02□□□□□ -0.81
NPC2Q12408 HUA1YGR268C 597 nt10.01□□□□□ -0.81
NPC2Q12408 AHT1YHR093W 549 nt10.01□□□□□ -0.81
NPC2Q12408 YFL067WYFL067W 528 nt10□□□□□ -0.81
NPC2Q12408 MIC10YCL057C-A 294 nt9.97□□□□□ -0.81
NPC2Q12408 YFL054CYFL054C 1941 nt9.97□□□□□ -0.81
NPC2Q12408 DDR2YOL052C-A 186 nt9.96□□□□□ -0.82
NPC2Q12408 SNG1YGR197C 1644 nt9.96□□□□□ -0.82
NPC2Q12408 SPC25YER018C 666 nt9.95□□□□□ -0.82
NPC2Q12408 STB1YNL309W 1263 nt9.95□□□□□ -0.82
NPC2Q12408 YPR064WYPR064W 420 nt9.95□□□□□ -0.82
NPC2Q12408 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.94□□□□□ -0.82
NPC2Q12408 HEM12YDR047W 1089 nt9.94□□□□□ -0.82
NPC2Q12408 TAD3YLR316C 969 nt9.92□□□□□ -0.82
NPC2Q12408 ANP1YEL036C 1503 nt9.92□□□□□ -0.82
NPC2Q12408 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.91□□□□□ -0.82
NPC2Q12408 NVJ2YPR091C 2313 nt9.89□□□□□ -0.83
NPC2Q12408 SPT8YLR055C 1809 nt9.89□□□□□ -0.83
NPC2Q12408 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.88□□□□□ -0.83
NPC2Q12408 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.88□□□□□ -0.83
NPC2Q12408 CCT4YDL143W 1587 nt9.88□□□□□ -0.83
NPC2Q12408 GPI16YHR188C 1833 nt9.87□□□□□ -0.83
NPC2Q12408 FEN2YCR028C 1539 nt9.86□□□□□ -0.83
NPC2Q12408 VPS60YDR486C 690 nt9.85□□□□□ -0.83
NPC2Q12408 ALG3YBL082C 1377 nt9.83□□□□□ -0.84
NPC2Q12408 BDH1YAL060W 1149 nt9.82□□□□□ -0.84
NPC2Q12408 SWC5YBR231C 912 nt9.78□□□□□ -0.84
NPC2Q12408 SWE1YJL187C 2460 nt9.78□□□□□ -0.84
NPC2Q12408 RAX1YOR301W 1308 nt9.78□□□□□ -0.84
NPC2Q12408 YIR016WYIR016W 798 nt9.77□□□□□ -0.85
NPC2Q12408 MIC12YBR262C 321 nt9.75□□□□□ -0.85
NPC2Q12408 YSP3YOR003W 1437 nt9.74□□□□□ -0.85
NPC2Q12408 YDR094WYDR094W 336 nt9.74□□□□□ -0.85
NPC2Q12408 YLR415CYLR415C 339 nt9.73□□□□□ -0.85
NPC2Q12408 UBX6YJL048C 1191 nt9.72□□□□□ -0.85
NPC2Q12408 YFR018CYFR018C 1092 nt9.71□□□□□ -0.86
NPC2Q12408 BNA2YJR078W 1362 nt9.7□□□□□ -0.86
NPC2Q12408 CCA1YER168C 1641 nt9.67□□□□□ -0.86
NPC2Q12408 PEX25YPL112C 1185 nt9.67□□□□□ -0.86
NPC2Q12408 YNL115CYNL115C 1935 nt9.65□□□□□ -0.86
NPC2Q12408 YFL066CYFL066C 1179 nt9.65□□□□□ -0.86
NPC2Q12408 PRE6YOL038W 765 nt9.65□□□□□ -0.86
NPC2Q12408 AGP1YCL025C 1902 nt9.61□□□□□ -0.87
NPC2Q12408 HHO1YPL127C 777 nt9.61□□□□□ -0.87
NPC2Q12408 XDJ1YLR090W 1380 nt9.6□□□□□ -0.87
NPC2Q12408 YGR201CYGR201C 678 nt9.59□□□□□ -0.87
NPC2Q12408 SHM2YLR058C 1410 nt9.56□□□□□ -0.88
NPC2Q12408 TIM17YJL143W 477 nt9.54□□□□□ -0.88
NPC2Q12408 PAU16YKL224C 372 nt9.54□□□□□ -0.88
NPC2Q12408 GDH3YAL062W 1374 nt9.53□□□□□ -0.88
NPC2Q12408 VPS75YNL246W 795 nt9.53□□□□□ -0.88
NPC2Q12408 RRT5YFR032C 870 nt9.51□□□□□ -0.89
NPC2Q12408 NIT1YIL164C 600 nt9.5□□□□□ -0.89
NPC2Q12408 DUT1YBR252W 444 nt9.5□□□□□ -0.89
NPC2Q12408 AVT6YER119C 1347 nt9.47□□□□□ -0.89
NPC2Q12408 FUR4YBR021W 1902 nt9.46□□□□□ -0.9
NPC2Q12408 BOR1YNL275W 1731 nt9.45□□□□□ -0.9
NPC2Q12408 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.45□□□□□ -0.9
NPC2Q12408 SGT2YOR007C 1041 nt9.45□□□□□ -0.9
NPC2Q12408 DAT1YML113W 747 nt9.42□□□□□ -0.9
NPC2Q12408 GOR1YNL274C 1053 nt9.42□□□□□ -0.9
NPC2Q12408 MIR1YJR077C 936 nt9.41□□□□□ -0.9
NPC2Q12408 DUS1YML080W 1272 nt9.4□□□□□ -0.9
NPC2Q12408 YCL074WYCL074W 927 nt9.39□□□□□ -0.91
NPC2Q12408 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.38□□□□□ -0.91
NPC2Q12408 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.38□□□□□ -0.91
NPC2Q12408 STR3YGL184C 1398 nt9.37□□□□□ -0.91
NPC2Q12408 HSP60YLR259C 1719 nt9.37□□□□□ -0.91
NPC2Q12408 CSM2YIL132C 642 nt9.37□□□□□ -0.91
NPC2Q12408 GLK1YCL040W 1503 nt9.35□□□□□ -0.91
NPC2Q12408 YDR010CYDR010C 333 nt9.32□□□□□ -0.92
NPC2Q12408 PAU7YAR020C 168 nt9.32□□□□□ -0.92
NPC2Q12408 YCR102CYCR102C 1107 nt9.31□□□□□ -0.92
NPC2Q12408 THI74YDR438W 1113 nt9.31□□□□□ -0.92
NPC2Q12408 SHB17YKR043C 816 nt9.31□□□□□ -0.92
NPC2Q12408 NBP35YGL091C 987 nt9.29□□□□□ -0.92
NPC2Q12408 NAT4YMR069W 858 nt9.29□□□□□ -0.92
NPC2Q12408 AQY2YLL052C 450 nt9.28□□□□□ -0.92
NPC2Q12408 MSF1YPR047W 1410 nt9.27□□□□□ -0.93
NPC2Q12408 UBA4YHR111W 1323 nt9.26□□□□□ -0.93
NPC2Q12408 YKR005CYKR005C 1578 nt9.24□□□□□ -0.93
NPC2Q12408 PRP4YPR178W 1398 nt9.24□□□□□ -0.93
NPC2Q12408 RET2YFR051C 1641 nt9.23□□□□□ -0.93
NPC2Q12408 UME6YDR207C 2511 nt9.21□□□□□ -0.94
NPC2Q12408 YGR259CYGR259C 441 nt9.2□□□□□ -0.94
NPC2Q12408 SHH4YLR164W 507 nt9.2□□□□□ -0.94
NPC2Q12408 DPS1YLL018C 1674 nt9.2□□□□□ -0.94
NPC2Q12408 SFA1YDL168W 1161 nt9.19□□□□□ -0.94
NPC2Q12408 RTN2YDL204W 1182 nt9.17□□□□□ -0.94
NPC2Q12408 TIR3YIL011W 810 nt9.17□□□□□ -0.94
NPC2Q12408 YSR3YKR053C 1215 nt9.17□□□□□ -0.94
NPC2Q12408 PHO89YBR296C 1725 nt9.17□□□□□ -0.94
NPC2Q12408 ARP6YLR085C 1317 nt9.16□□□□□ -0.94
NPC2Q12408 YGL034CYGL034C 366 nt9.15□□□□□ -0.94
NPC2Q12408 XYL2YLR070C 1071 nt9.13□□□□□ -0.95
NPC2Q12408 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.12□□□□□ -0.95
NPC2Q12408 LSC2YGR244C 1284 nt9.11□□□□□ -0.95
NPC2Q12408 BMT6YLR063W 1098 nt9.11□□□□□ -0.95
NPC2Q12408 ALG12YNR030W 1656 nt9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.1 ms