Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 AQY1YPR192W 918 nt10.51□□□□□ -0.73
RPN6Q12377 TIM23YNR017W 669 nt10.49□□□□□ -0.73
RPN6Q12377 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.48□□□□□ -0.73
RPN6Q12377 RAX1YOR301W 1308 nt10.47□□□□□ -0.73
RPN6Q12377 YLR179CYLR179C 606 nt10.45□□□□□ -0.74
RPN6Q12377 ANP1YEL036C 1503 nt10.44□□□□□ -0.74
RPN6Q12377 Q0182Q0182 405 nt10.43□□□□□ -0.74
RPN6Q12377 YKL030WYKL030W 606 nt10.43□□□□□ -0.74
RPN6Q12377 SPC25YER018C 666 nt10.42□□□□□ -0.74
RPN6Q12377 STB1YNL309W 1263 nt10.42□□□□□ -0.74
RPN6Q12377 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.41□□□□□ -0.74
RPN6Q12377 CCA1YER168C 1641 nt10.38□□□□□ -0.75
RPN6Q12377 AHT1YHR093W 549 nt10.38□□□□□ -0.75
RPN6Q12377 WSC2YNL283C 1512 nt10.38□□□□□ -0.75
RPN6Q12377 GPI16YHR188C 1833 nt10.37□□□□□ -0.75
RPN6Q12377 FEN2YCR028C 1539 nt10.36□□□□□ -0.75
RPN6Q12377 BNA2YJR078W 1362 nt10.35□□□□□ -0.75
RPN6Q12377 HSP60YLR259C 1719 nt10.35□□□□□ -0.75
RPN6Q12377 MIC12YBR262C 321 nt10.33□□□□□ -0.76
RPN6Q12377 YPR064WYPR064W 420 nt10.32□□□□□ -0.76
RPN6Q12377 CCT4YDL143W 1587 nt10.31□□□□□ -0.76
RPN6Q12377 VPS60YDR486C 690 nt10.31□□□□□ -0.76
RPN6Q12377 RTG1YOL067C 534 nt10.31□□□□□ -0.76
RPN6Q12377 FUR4YBR021W 1902 nt10.28□□□□□ -0.76
RPN6Q12377 MCH5YOR306C 1566 nt10.27□□□□□ -0.76
RPN6Q12377 YIR016WYIR016W 798 nt10.27□□□□□ -0.77
RPN6Q12377 ALG12YNR030W 1656 nt10.27□□□□□ -0.77
RPN6Q12377 GLK1YCL040W 1503 nt10.25□□□□□ -0.77
RPN6Q12377 TAD3YLR316C 969 nt10.25□□□□□ -0.77
RPN6Q12377 SWC5YBR231C 912 nt10.25□□□□□ -0.77
RPN6Q12377 ALG3YBL082C 1377 nt10.25□□□□□ -0.77
RPN6Q12377 AGP1YCL025C 1902 nt10.21□□□□□ -0.77
RPN6Q12377 HHO1YPL127C 777 nt10.21□□□□□ -0.77
RPN6Q12377 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.17□□□□□ -0.78
RPN6Q12377 YEL076CYEL076C 651 nt10.17□□□□□ -0.78
RPN6Q12377 YGR201CYGR201C 678 nt10.17□□□□□ -0.78
RPN6Q12377 YLR464WYLR464W 651 nt10.17□□□□□ -0.78
RPN6Q12377 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.14□□□□□ -0.79
RPN6Q12377 HUA1YGR268C 597 nt10.14□□□□□ -0.79
RPN6Q12377 BDH1YAL060W 1149 nt10.13□□□□□ -0.79
RPN6Q12377 MRPL8YJL063C 717 nt10.12□□□□□ -0.79
RPN6Q12377 DUS1YML080W 1272 nt10.12□□□□□ -0.79
RPN6Q12377 XDJ1YLR090W 1380 nt10.11□□□□□ -0.79
RPN6Q12377 PRP4YPR178W 1398 nt10.11□□□□□ -0.79
RPN6Q12377 YCL074WYCL074W 927 nt10.1□□□□□ -0.79
RPN6Q12377 YLR415CYLR415C 339 nt10.1□□□□□ -0.79
RPN6Q12377 ADO1YJR105W 1023 nt10.06□□□□□ -0.8
RPN6Q12377 DPS1YLL018C 1674 nt10.04□□□□□ -0.8
RPN6Q12377 YKR005CYKR005C 1578 nt10.04□□□□□ -0.8
RPN6Q12377 GDH3YAL062W 1374 nt10.03□□□□□ -0.8
RPN6Q12377 YSP3YOR003W 1437 nt10.03□□□□□ -0.8
RPN6Q12377 DUT1YBR252W 444 nt10.02□□□□□ -0.81
RPN6Q12377 AVT6YER119C 1347 nt10.02□□□□□ -0.81
RPN6Q12377 BMT6YLR063W 1098 nt10□□□□□ -0.81
RPN6Q12377 AAC1YMR056C 930 nt10□□□□□ -0.81
RPN6Q12377 GOR1YNL274C 1053 nt10□□□□□ -0.81
RPN6Q12377 SHM2YLR058C 1410 nt9.99□□□□□ -0.81
RPN6Q12377 STR3YGL184C 1398 nt9.99□□□□□ -0.81
RPN6Q12377 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.98□□□□□ -0.81
RPN6Q12377 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.98□□□□□ -0.81
RPN6Q12377 YGR259CYGR259C 441 nt9.97□□□□□ -0.81
RPN6Q12377 TIM17YJL143W 477 nt9.97□□□□□ -0.81
RPN6Q12377 NAR1YNL240C 1476 nt9.97□□□□□ -0.81
RPN6Q12377 YNL115CYNL115C 1935 nt9.92□□□□□ -0.82
RPN6Q12377 AQY2YLL052C 450 nt9.91□□□□□ -0.82
RPN6Q12377 PEX25YPL112C 1185 nt9.91□□□□□ -0.82
RPN6Q12377 NIT1YIL164C 600 nt9.9□□□□□ -0.82
RPN6Q12377 DAT1YML113W 747 nt9.9□□□□□ -0.82
RPN6Q12377 SNF1YDR477W 1902 nt9.88□□□□□ -0.83
RPN6Q12377 IRC24YIR036C 792 nt9.88□□□□□ -0.83
RPN6Q12377 RTN2YDL204W 1182 nt9.85□□□□□ -0.83
RPN6Q12377 SGT2YOR007C 1041 nt9.84□□□□□ -0.83
RPN6Q12377 VPS75YNL246W 795 nt9.83□□□□□ -0.84
RPN6Q12377 BIO5YNR056C 1686 nt9.83□□□□□ -0.84
RPN6Q12377 YCR102CYCR102C 1107 nt9.81□□□□□ -0.84
RPN6Q12377 YFL066CYFL066C 1179 nt9.81□□□□□ -0.84
RPN6Q12377 YFR018CYFR018C 1092 nt9.81□□□□□ -0.84
RPN6Q12377 PBP1YGR178C 2169 nt9.78□□□□□ -0.84
RPN6Q12377 NBP35YGL091C 987 nt9.78□□□□□ -0.84
RPN6Q12377 RPM1RPM1 483 nt9.78□□□□□ -0.84
RPN6Q12377 CYT2YKL087C 675 nt9.77□□□□□ -0.85
RPN6Q12377 ARP6YLR085C 1317 nt9.72□□□□□ -0.85
RPN6Q12377 PRE6YOL038W 765 nt9.71□□□□□ -0.86
RPN6Q12377 PLB1YMR008C 1995 nt9.69□□□□□ -0.86
RPN6Q12377 YDR094WYDR094W 336 nt9.68□□□□□ -0.86
RPN6Q12377 CMP2YML057W 1815 nt9.68□□□□□ -0.86
RPN6Q12377 PAU7YAR020C 168 nt9.66□□□□□ -0.86
RPN6Q12377 TIR3YIL011W 810 nt9.65□□□□□ -0.86
RPN6Q12377 RRT5YFR032C 870 nt9.64□□□□□ -0.87
RPN6Q12377 LSC2YGR244C 1284 nt9.62□□□□□ -0.87
RPN6Q12377 YDR010CYDR010C 333 nt9.59□□□□□ -0.87
RPN6Q12377 SHB17YKR043C 816 nt9.59□□□□□ -0.87
RPN6Q12377 SHH4YLR164W 507 nt9.59□□□□□ -0.87
RPN6Q12377 MIR1YJR077C 936 nt9.57□□□□□ -0.88
RPN6Q12377 PRM5YIL117C 957 nt9.56□□□□□ -0.88
RPN6Q12377 GAP1YKR039W 1809 nt9.56□□□□□ -0.88
RPN6Q12377 PRO1YDR300C 1287 nt9.55□□□□□ -0.88
RPN6Q12377 PAU16YKL224C 372 nt9.55□□□□□ -0.88
RPN6Q12377 POM34YLR018C 900 nt9.54□□□□□ -0.88
RPN6Q12377 UTR1YJR049C 1593 nt9.54□□□□□ -0.88
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