Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 YMR090WYMR090W 684 nt13.9□□□□□ -0.18
MSB4Q12317 GLK1YCL040W 1503 nt13.89□□□□□ -0.19
MSB4Q12317 YIH1YCR059C 777 nt13.85□□□□□ -0.19
MSB4Q12317 YBR220CYBR220C 1683 nt13.84□□□□□ -0.19
MSB4Q12317 Q0010Q0010 387 nt13.81□□□□□ -0.2
MSB4Q12317 MSF1YPR047W 1410 nt13.8□□□□□ -0.2
MSB4Q12317 YNL115CYNL115C 1935 nt13.79□□□□□ -0.2
MSB4Q12317 YSP3YOR003W 1437 nt13.77□□□□□ -0.21
MSB4Q12317 BDH1YAL060W 1149 nt13.75□□□□□ -0.21
MSB4Q12317 YMR244WYMR244W 1068 nt13.75□□□□□ -0.21
MSB4Q12317 SCC4YER147C 1875 nt13.72□□□□□ -0.21
MSB4Q12317 THI74YDR438W 1113 nt13.72□□□□□ -0.21
MSB4Q12317 YSC84YHR016C 1407 nt13.72□□□□□ -0.21
MSB4Q12317 YLR415CYLR415C 339 nt13.71□□□□□ -0.21
MSB4Q12317 AQY1YPR192W 918 nt13.71□□□□□ -0.21
MSB4Q12317 YLL053CYLL053C 459 nt13.7□□□□□ -0.22
MSB4Q12317 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt13.69□□□□□ -0.22
MSB4Q12317 AI5_BETAQ0075 1065 nt13.68□□□□□ -0.22
MSB4Q12317 SDH1YKL148C 1923 nt13.67□□□□□ -0.22
MSB4Q12317 MIR1YJR077C 936 nt13.67□□□□□ -0.22
MSB4Q12317 SRN2YLR119W 642 nt13.67□□□□□ -0.22
MSB4Q12317 FTR1YER145C 1215 nt13.64□□□□□ -0.23
MSB4Q12317 GAL1YBR020W 1587 nt13.62□□□□□ -0.23
MSB4Q12317 GLR1YPL091W 1452 nt13.6□□□□□ -0.23
MSB4Q12317 YNL195CYNL195C 786 nt13.59□□□□□ -0.23
MSB4Q12317 Q0255Q0255 1419 nt13.58□□□□□ -0.24
MSB4Q12317 BIO4YNR057C 714 nt13.57□□□□□ -0.24
MSB4Q12317 VPS75YNL246W 795 nt13.56□□□□□ -0.24
MSB4Q12317 STB1YNL309W 1263 nt13.56□□□□□ -0.24
MSB4Q12317 CCT4YDL143W 1587 nt13.56□□□□□ -0.24
MSB4Q12317 TRM5YHR070W 1500 nt13.55□□□□□ -0.24
MSB4Q12317 SPC25YER018C 666 nt13.53□□□□□ -0.24
MSB4Q12317 DAT1YML113W 747 nt13.52□□□□□ -0.25
MSB4Q12317 SIM1YIL123W 1431 nt13.52□□□□□ -0.25
MSB4Q12317 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.49□□□□□ -0.25
MSB4Q12317 SWC5YBR231C 912 nt13.49□□□□□ -0.25
MSB4Q12317 RBG2YGR173W 1107 nt13.47□□□□□ -0.25
MSB4Q12317 GPI16YHR188C 1833 nt13.47□□□□□ -0.25
MSB4Q12317 AI3Q0060 1248 nt13.46□□□□□ -0.25
MSB4Q12317 YGL034CYGL034C 366 nt13.45□□□□□ -0.26
MSB4Q12317 DDR2YOL052C-A 186 nt13.45□□□□□ -0.26
MSB4Q12317 VPS60YDR486C 690 nt13.44□□□□□ -0.26
MSB4Q12317 YGL188CYGL188C 174 nt13.44□□□□□ -0.26
MSB4Q12317 PAU7YAR020C 168 nt13.44□□□□□ -0.26
MSB4Q12317 ARP10YDR106W 855 nt13.43□□□□□ -0.26
MSB4Q12317 RRT12YCR045C 1476 nt13.42□□□□□ -0.26
MSB4Q12317 PCH2YBR186W 1695 nt13.42□□□□□ -0.26
MSB4Q12317 YCR099CYCR099C 468 nt13.41□□□□□ -0.26
MSB4Q12317 YOR169CYOR169C 465 nt13.41□□□□□ -0.26
MSB4Q12317 PAC11YDR488C 1602 nt13.39□□□□□ -0.27
MSB4Q12317 GUT2YIL155C 1950 nt13.39□□□□□ -0.27
MSB4Q12317 SPT8YLR055C 1809 nt13.39□□□□□ -0.27
MSB4Q12317 ATF2YGR177C 1608 nt13.38□□□□□ -0.27
MSB4Q12317 NDI1YML120C 1542 nt13.38□□□□□ -0.27
MSB4Q12317 ALG3YBL082C 1377 nt13.37□□□□□ -0.27
MSB4Q12317 YFL067WYFL067W 528 nt13.37□□□□□ -0.27
MSB4Q12317 UBA4YHR111W 1323 nt13.37□□□□□ -0.27
MSB4Q12317 ARA2YMR041C 1008 nt13.35□□□□□ -0.27
MSB4Q12317 SEC11YIR022W 504 nt13.34□□□□□ -0.27
MSB4Q12317 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.32□□□□□ -0.28
MSB4Q12317 FEN2YCR028C 1539 nt13.32□□□□□ -0.28
MSB4Q12317 YSR3YKR053C 1215 nt13.31□□□□□ -0.28
MSB4Q12317 ERF2YLR246W 1080 nt13.3□□□□□ -0.28
MSB4Q12317 RBG1YAL036C 1110 nt13.29□□□□□ -0.28
MSB4Q12317 PET20YPL159C 762 nt13.29□□□□□ -0.28
MSB4Q12317 SHB17YKR043C 816 nt13.27□□□□□ -0.29
MSB4Q12317 PIB2YGL023C 1908 nt13.25□□□□□ -0.29
MSB4Q12317 XYL2YLR070C 1071 nt13.25□□□□□ -0.29
MSB4Q12317 ANP1YEL036C 1503 nt13.24□□□□□ -0.29
MSB4Q12317 TIM17YJL143W 477 nt13.24□□□□□ -0.29
MSB4Q12317 ATP6Q0085 780 nt13.23□□□□□ -0.29
MSB4Q12317 YHL050CYHL050C 2094 nt13.22□□□□□ -0.29
MSB4Q12317 YIR016WYIR016W 798 nt13.19□□□□□ -0.3
MSB4Q12317 CRR1YLR213C 1269 nt13.19□□□□□ -0.3
MSB4Q12317 YMR226CYMR226C 804 nt13.19□□□□□ -0.3
MSB4Q12317 SAM1YLR180W 1149 nt13.16□□□□□ -0.3
MSB4Q12317 ABZ2YMR289W 1125 nt13.14□□□□□ -0.31
MSB4Q12317 AIR1YIL079C 1083 nt13.13□□□□□ -0.31
MSB4Q12317 SNG1YGR197C 1644 nt13.13□□□□□ -0.31
MSB4Q12317 YDR010CYDR010C 333 nt13.12□□□□□ -0.31
MSB4Q12317 YCR087WYCR087W 516 nt13.11□□□□□ -0.31
MSB4Q12317 SHM2YLR058C 1410 nt13.1□□□□□ -0.31
MSB4Q12317 HEM12YDR047W 1089 nt13.09□□□□□ -0.31
MSB4Q12317 PHO89YBR296C 1725 nt13.09□□□□□ -0.31
MSB4Q12317 AIM45YPR004C 1035 nt13.08□□□□□ -0.32
MSB4Q12317 YLR122CYLR122C 378 nt13.06□□□□□ -0.32
MSB4Q12317 MIC10YCL057C-A 294 nt13.05□□□□□ -0.32
MSB4Q12317 RET2YFR051C 1641 nt13.05□□□□□ -0.32
MSB4Q12317 RTF1YGL244W 1677 nt13.05□□□□□ -0.32
MSB4Q12317 SGT2YOR007C 1041 nt13.03□□□□□ -0.32
MSB4Q12317 YNR068CYNR068C 819 nt13.02□□□□□ -0.33
MSB4Q12317 snR78snR78 87 nt13.01□□□□□ -0.33
MSB4Q12317 XDJ1YLR090W 1380 nt13□□□□□ -0.33
MSB4Q12317 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt13□□□□□ -0.33
MSB4Q12317 RPM1RPM1 483 nt12.99□□□□□ -0.33
MSB4Q12317 RAD51YER095W 1203 nt12.98□□□□□ -0.33
MSB4Q12317 NIT1YIL164C 600 nt12.97□□□□□ -0.33
MSB4Q12317 YLR111WYLR111W 333 nt12.96□□□□□ -0.33
MSB4Q12317 MRP20YDR405W 792 nt12.95□□□□□ -0.34
MSB4Q12317 UTP6YDR449C 1323 nt12.94□□□□□ -0.34
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