Protein–RNA interactions for Protein: Q12242

RUP1, UBA domain-containing protein RUP1, yeastyeast

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUP1Q12242 RTG1YOL067C 534 nt10.76□□□□□ -0.69
RUP1Q12242 PTH1YHR189W 573 nt10.75□□□□□ -0.69
RUP1Q12242 DPS1YLL018C 1674 nt10.74□□□□□ -0.69
RUP1Q12242 MRPL8YJL063C 717 nt10.74□□□□□ -0.69
RUP1Q12242 YLR235CYLR235C 399 nt10.74□□□□□ -0.69
RUP1Q12242 YLL053CYLL053C 459 nt10.72□□□□□ -0.69
RUP1Q12242 MIC10YCL057C-A 294 nt10.72□□□□□ -0.69
RUP1Q12242 RNQ1YCL028W 1218 nt10.71□□□□□ -0.69
RUP1Q12242 ATF2YGR177C 1608 nt10.7□□□□□ -0.7
RUP1Q12242 DIC1YLR348C 897 nt10.7□□□□□ -0.7
RUP1Q12242 YFL067WYFL067W 528 nt10.69□□□□□ -0.7
RUP1Q12242 SNG1YGR197C 1644 nt10.69□□□□□ -0.7
RUP1Q12242 NAR1YNL240C 1476 nt10.68□□□□□ -0.7
RUP1Q12242 BMT6YLR063W 1098 nt10.66□□□□□ -0.7
RUP1Q12242 YKL030WYKL030W 606 nt10.65□□□□□ -0.7
RUP1Q12242 ADO1YJR105W 1023 nt10.64□□□□□ -0.71
RUP1Q12242 YKR005CYKR005C 1578 nt10.62□□□□□ -0.71
RUP1Q12242 FTR1YER145C 1215 nt10.62□□□□□ -0.71
RUP1Q12242 TIM23YNR017W 669 nt10.62□□□□□ -0.71
RUP1Q12242 WSC2YNL283C 1512 nt10.6□□□□□ -0.71
RUP1Q12242 BIO5YNR056C 1686 nt10.6□□□□□ -0.71
RUP1Q12242 SNF1YDR477W 1902 nt10.57□□□□□ -0.72
RUP1Q12242 DDR2YOL052C-A 186 nt10.57□□□□□ -0.72
RUP1Q12242 GAL1YBR020W 1587 nt10.56□□□□□ -0.72
RUP1Q12242 PBP1YGR178C 2169 nt10.56□□□□□ -0.72
RUP1Q12242 HUA1YGR268C 597 nt10.56□□□□□ -0.72
RUP1Q12242 TRM5YHR070W 1500 nt10.55□□□□□ -0.72
RUP1Q12242 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.55□□□□□ -0.72
RUP1Q12242 YLR179CYLR179C 606 nt10.55□□□□□ -0.72
RUP1Q12242 CYT2YKL087C 675 nt10.53□□□□□ -0.72
RUP1Q12242 BNA2YJR078W 1362 nt10.52□□□□□ -0.72
RUP1Q12242 ANP1YEL036C 1503 nt10.52□□□□□ -0.73
RUP1Q12242 YCL074WYCL074W 927 nt10.51□□□□□ -0.73
RUP1Q12242 IRC24YIR036C 792 nt10.51□□□□□ -0.73
RUP1Q12242 AQY1YPR192W 918 nt10.51□□□□□ -0.73
RUP1Q12242 MIC12YBR262C 321 nt10.51□□□□□ -0.73
RUP1Q12242 YGR259CYGR259C 441 nt10.5□□□□□ -0.73
RUP1Q12242 AGP1YCL025C 1902 nt10.48□□□□□ -0.73
RUP1Q12242 AHT1YHR093W 549 nt10.47□□□□□ -0.73
RUP1Q12242 YPR064WYPR064W 420 nt10.46□□□□□ -0.73
RUP1Q12242 DUS1YML080W 1272 nt10.45□□□□□ -0.74
RUP1Q12242 TAD3YLR316C 969 nt10.41□□□□□ -0.74
RUP1Q12242 SPC25YER018C 666 nt10.4□□□□□ -0.74
RUP1Q12242 STB1YNL309W 1263 nt10.4□□□□□ -0.74
RUP1Q12242 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.39□□□□□ -0.75
RUP1Q12242 HHO1YPL127C 777 nt10.38□□□□□ -0.75
RUP1Q12242 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.37□□□□□ -0.75
RUP1Q12242 FEN2YCR028C 1539 nt10.37□□□□□ -0.75
RUP1Q12242 GPI16YHR188C 1833 nt10.35□□□□□ -0.75
RUP1Q12242 CMP2YML057W 1815 nt10.34□□□□□ -0.75
RUP1Q12242 CCT4YDL143W 1587 nt10.33□□□□□ -0.76
RUP1Q12242 YGR201CYGR201C 678 nt10.31□□□□□ -0.76
RUP1Q12242 YIR016WYIR016W 798 nt10.3□□□□□ -0.76
RUP1Q12242 XDJ1YLR090W 1380 nt10.29□□□□□ -0.76
RUP1Q12242 VPS60YDR486C 690 nt10.29□□□□□ -0.76
RUP1Q12242 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
RUP1Q12242 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.28□□□□□ -0.76
RUP1Q12242 STR3YGL184C 1398 nt10.27□□□□□ -0.76
RUP1Q12242 YDR094WYDR094W 336 nt10.26□□□□□ -0.77
RUP1Q12242 BDH1YAL060W 1149 nt10.26□□□□□ -0.77
RUP1Q12242 SWC5YBR231C 912 nt10.26□□□□□ -0.77
RUP1Q12242 ALG3YBL082C 1377 nt10.24□□□□□ -0.77
RUP1Q12242 UBX6YJL048C 1191 nt10.22□□□□□ -0.77
RUP1Q12242 YLR415CYLR415C 339 nt10.22□□□□□ -0.77
RUP1Q12242 HSL7YBR133C 2484 nt10.22□□□□□ -0.77
RUP1Q12242 YAT1YAR035W 2064 nt10.2□□□□□ -0.78
RUP1Q12242 NDI1YML120C 1542 nt10.2□□□□□ -0.78
RUP1Q12242 YSP3YOR003W 1437 nt10.19□□□□□ -0.78
RUP1Q12242 YFR018CYFR018C 1092 nt10.19□□□□□ -0.78
RUP1Q12242 RTN2YDL204W 1182 nt10.18□□□□□ -0.78
RUP1Q12242 DUT1YBR252W 444 nt10.16□□□□□ -0.78
RUP1Q12242 PEX25YPL112C 1185 nt10.15□□□□□ -0.78
RUP1Q12242 AQY2YLL052C 450 nt10.13□□□□□ -0.79
RUP1Q12242 GDH3YAL062W 1374 nt10.12□□□□□ -0.79
RUP1Q12242 GOR1YNL274C 1053 nt10.11□□□□□ -0.79
RUP1Q12242 YNL115CYNL115C 1935 nt10.11□□□□□ -0.79
RUP1Q12242 PRE6YOL038W 765 nt10.09□□□□□ -0.79
RUP1Q12242 AVT6YER119C 1347 nt10.08□□□□□ -0.8
RUP1Q12242 YFL066CYFL066C 1179 nt10.08□□□□□ -0.8
RUP1Q12242 SPT20YOL148C 1815 nt10.07□□□□□ -0.8
RUP1Q12242 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.07□□□□□ -0.8
RUP1Q12242 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.07□□□□□ -0.8
RUP1Q12242 RRT5YFR032C 870 nt10.05□□□□□ -0.8
RUP1Q12242 TIM17YJL143W 477 nt10.03□□□□□ -0.8
RUP1Q12242 PAU16YKL224C 372 nt10.02□□□□□ -0.81
RUP1Q12242 VPS75YNL246W 795 nt10.01□□□□□ -0.81
RUP1Q12242 SHM2YLR058C 1410 nt10□□□□□ -0.81
RUP1Q12242 INA1YLR413W 2028 nt10□□□□□ -0.81
RUP1Q12242 RPC82YPR190C 1965 nt9.98□□□□□ -0.81
RUP1Q12242 HIF1YLL022C 1158 nt9.96□□□□□ -0.82
RUP1Q12242 ALD4YOR374W 1560 nt9.94□□□□□ -0.82
RUP1Q12242 PLB1YMR008C 1995 nt9.94□□□□□ -0.82
RUP1Q12242 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.93□□□□□ -0.82
RUP1Q12242 ARP6YLR085C 1317 nt9.92□□□□□ -0.82
RUP1Q12242 NIT1YIL164C 600 nt9.91□□□□□ -0.82
RUP1Q12242 DAT1YML113W 747 nt9.9□□□□□ -0.82
RUP1Q12242 PRM5YIL117C 957 nt9.88□□□□□ -0.83
RUP1Q12242 SGT2YOR007C 1041 nt9.88□□□□□ -0.83
RUP1Q12242 NBP35YGL091C 987 nt9.87□□□□□ -0.83
RUP1Q12242 MIR1YJR077C 936 nt9.86□□□□□ -0.83
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