Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 UBX6YJL048C 1191 nt12.76□□□□□ -0.37
SSF2Q12153 CRR1YLR213C 1269 nt12.76□□□□□ -0.37
SSF2Q12153 STB1YNL309W 1263 nt12.72□□□□□ -0.37
SSF2Q12153 LYS4YDR234W 2082 nt12.7□□□□□ -0.38
SSF2Q12153 YDR094WYDR094W 336 nt12.7□□□□□ -0.38
SSF2Q12153 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.69□□□□□ -0.38
SSF2Q12153 SPC25YER018C 666 nt12.68□□□□□ -0.38
SSF2Q12153 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.67□□□□□ -0.38
SSF2Q12153 HEM12YDR047W 1089 nt12.67□□□□□ -0.38
SSF2Q12153 PTK1YKL198C 1989 nt12.67□□□□□ -0.38
SSF2Q12153 GPI16YHR188C 1833 nt12.65□□□□□ -0.38
SSF2Q12153 CCT4YDL143W 1587 nt12.64□□□□□ -0.39
SSF2Q12153 SNG1YGR197C 1644 nt12.63□□□□□ -0.39
SSF2Q12153 MIC10YCL057C-A 294 nt12.62□□□□□ -0.39
SSF2Q12153 SWC5YBR231C 912 nt12.6□□□□□ -0.39
SSF2Q12153 ANP1YEL036C 1503 nt12.59□□□□□ -0.39
SSF2Q12153 VPS60YDR486C 690 nt12.59□□□□□ -0.39
SSF2Q12153 FEN2YCR028C 1539 nt12.58□□□□□ -0.4
SSF2Q12153 BDH1YAL060W 1149 nt12.55□□□□□ -0.4
SSF2Q12153 YLR415CYLR415C 339 nt12.55□□□□□ -0.4
SSF2Q12153 YFR018CYFR018C 1092 nt12.54□□□□□ -0.4
SSF2Q12153 YFL054CYFL054C 1941 nt12.53□□□□□ -0.4
SSF2Q12153 ALG3YBL082C 1377 nt12.51□□□□□ -0.41
SSF2Q12153 YSP3YOR003W 1437 nt12.48□□□□□ -0.41
SSF2Q12153 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.48□□□□□ -0.41
SSF2Q12153 RRT5YFR032C 870 nt12.46□□□□□ -0.41
SSF2Q12153 YIR016WYIR016W 798 nt12.46□□□□□ -0.41
SSF2Q12153 PRE6YOL038W 765 nt12.46□□□□□ -0.41
SSF2Q12153 PEX25YPL112C 1185 nt12.46□□□□□ -0.41
SSF2Q12153 BNA2YJR078W 1362 nt12.44□□□□□ -0.42
SSF2Q12153 YFL066CYFL066C 1179 nt12.44□□□□□ -0.42
SSF2Q12153 YNL115CYNL115C 1935 nt12.43□□□□□ -0.42
SSF2Q12153 PAU16YKL224C 372 nt12.42□□□□□ -0.42
SSF2Q12153 RAX1YOR301W 1308 nt12.41□□□□□ -0.42
SSF2Q12153 SPT8YLR055C 1809 nt12.35□□□□□ -0.43
SSF2Q12153 MIC12YBR262C 321 nt12.33□□□□□ -0.44
SSF2Q12153 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.32□□□□□ -0.44
SSF2Q12153 TIM17YJL143W 477 nt12.3□□□□□ -0.44
SSF2Q12153 HHO1YPL127C 777 nt12.28□□□□□ -0.44
SSF2Q12153 VPS75YNL246W 795 nt12.27□□□□□ -0.45
SSF2Q12153 XDJ1YLR090W 1380 nt12.27□□□□□ -0.45
SSF2Q12153 SHM2YLR058C 1410 nt12.23□□□□□ -0.45
SSF2Q12153 SWE1YJL187C 2460 nt12.22□□□□□ -0.45
SSF2Q12153 YGR201CYGR201C 678 nt12.21□□□□□ -0.45
SSF2Q12153 GDH3YAL062W 1374 nt12.2□□□□□ -0.46
SSF2Q12153 CCA1YER168C 1641 nt12.19□□□□□ -0.46
SSF2Q12153 GLK1YCL040W 1503 nt12.17□□□□□ -0.46
SSF2Q12153 PAU7YAR020C 168 nt12.17□□□□□ -0.46
SSF2Q12153 NAT4YMR069W 858 nt12.16□□□□□ -0.46
SSF2Q12153 AVT6YER119C 1347 nt12.13□□□□□ -0.47
SSF2Q12153 MIR1YJR077C 936 nt12.12□□□□□ -0.47
SSF2Q12153 SGT2YOR007C 1041 nt12.1□□□□□ -0.47
SSF2Q12153 THI74YDR438W 1113 nt12.09□□□□□ -0.47
SSF2Q12153 NIT1YIL164C 600 nt12.09□□□□□ -0.47
SSF2Q12153 GOR1YNL274C 1053 nt12.09□□□□□ -0.47
SSF2Q12153 AGP1YCL025C 1902 nt12.08□□□□□ -0.48
SSF2Q12153 MSF1YPR047W 1410 nt12.05□□□□□ -0.48
SSF2Q12153 YJL225CYJL225C 5277 nt12.02□□□□□ -0.48
SSF2Q12153 DUS1YML080W 1272 nt12.02□□□□□ -0.49
SSF2Q12153 SHB17YKR043C 816 nt12.01□□□□□ -0.49
SSF2Q12153 DUT1YBR252W 444 nt12.01□□□□□ -0.49
SSF2Q12153 PAC11YDR488C 1602 nt12□□□□□ -0.49
SSF2Q12153 DAT1YML113W 747 nt11.98□□□□□ -0.49
SSF2Q12153 UBA4YHR111W 1323 nt11.97□□□□□ -0.49
SSF2Q12153 NVJ2YPR091C 2313 nt11.95□□□□□ -0.5
SSF2Q12153 YDR010CYDR010C 333 nt11.92□□□□□ -0.5
SSF2Q12153 YSR3YKR053C 1215 nt11.92□□□□□ -0.5
SSF2Q12153 YCR102CYCR102C 1107 nt11.91□□□□□ -0.5
SSF2Q12153 SBA1YKL117W 651 nt11.88□□□□□ -0.51
SSF2Q12153 YCL074WYCL074W 927 nt11.87□□□□□ -0.51
SSF2Q12153 YGL034CYGL034C 366 nt11.87□□□□□ -0.51
SSF2Q12153 AQY2YLL052C 450 nt11.87□□□□□ -0.51
SSF2Q12153 PHO89YBR296C 1725 nt11.86□□□□□ -0.51
SSF2Q12153 RET2YFR051C 1641 nt11.85□□□□□ -0.51
SSF2Q12153 FUR4YBR021W 1902 nt11.84□□□□□ -0.51
SSF2Q12153 RPM1RPM1 483 nt11.84□□□□□ -0.51
SSF2Q12153 NME1NME1 340 nt11.84□□□□□ -0.51
SSF2Q12153 STR3YGL184C 1398 nt11.83□□□□□ -0.52
SSF2Q12153 XYL2YLR070C 1071 nt11.82□□□□□ -0.52
SSF2Q12153 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.8□□□□□ -0.52
SSF2Q12153 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.8□□□□□ -0.52
SSF2Q12153 YCR087WYCR087W 516 nt11.78□□□□□ -0.52
SSF2Q12153 NBP35YGL091C 987 nt11.78□□□□□ -0.52
SSF2Q12153 MRP20YDR405W 792 nt11.73□□□□□ -0.53
SSF2Q12153 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.73□□□□□ -0.53
SSF2Q12153 RBG1YAL036C 1110 nt11.73□□□□□ -0.53
SSF2Q12153 SFA1YDL168W 1161 nt11.72□□□□□ -0.53
SSF2Q12153 TIR3YIL011W 810 nt11.71□□□□□ -0.53
SSF2Q12153 NDI1YML120C 1542 nt11.7□□□□□ -0.54
SSF2Q12153 AIM45YPR004C 1035 nt11.7□□□□□ -0.54
SSF2Q12153 SHH4YLR164W 507 nt11.69□□□□□ -0.54
SSF2Q12153 COQ2YNR041C 1119 nt11.69□□□□□ -0.54
SSF2Q12153 HSP60YLR259C 1719 nt11.65□□□□□ -0.54
SSF2Q12153 FRE6YLL051C 2139 nt11.64□□□□□ -0.55
SSF2Q12153 GLR1YPL091W 1452 nt11.63□□□□□ -0.55
SSF2Q12153 RTN2YDL204W 1182 nt11.61□□□□□ -0.55
SSF2Q12153 YKR005CYKR005C 1578 nt11.61□□□□□ -0.55
SSF2Q12153 TOM6YOR045W 186 nt11.6□□□□□ -0.55
SSF2Q12153 PRP4YPR178W 1398 nt11.59□□□□□ -0.55
SSF2Q12153 PRO1YDR300C 1287 nt11.59□□□□□ -0.55
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