Protein–RNA interactions for Protein: Q12006

PFA4, Palmitoyltransferase PFA4, yeastyeast

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4Q12006 BDH1YAL060W 1149 nt10.53□□□□□ -0.72
PFA4Q12006 ERF2YLR246W 1080 nt10.53□□□□□ -0.72
PFA4Q12006 STB1YNL309W 1263 nt10.53□□□□□ -0.72
PFA4Q12006 CRR1YLR213C 1269 nt10.52□□□□□ -0.73
PFA4Q12006 SPC25YER018C 666 nt10.51□□□□□ -0.73
PFA4Q12006 RRT5YFR032C 870 nt10.51□□□□□ -0.73
PFA4Q12006 YFL066CYFL066C 1179 nt10.5□□□□□ -0.73
PFA4Q12006 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.49□□□□□ -0.73
PFA4Q12006 PEX25YPL112C 1185 nt10.49□□□□□ -0.73
PFA4Q12006 YSP3YOR003W 1437 nt10.49□□□□□ -0.73
PFA4Q12006 CCT4YDL143W 1587 nt10.48□□□□□ -0.73
PFA4Q12006 YFL067WYFL067W 528 nt10.47□□□□□ -0.73
PFA4Q12006 DDR2YOL052C-A 186 nt10.47□□□□□ -0.73
PFA4Q12006 PIB2YGL023C 1908 nt10.46□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 LYS4YDR234W 2082 nt10.45□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 GPI16YHR188C 1833 nt10.44□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.44□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 VPS60YDR486C 690 nt10.44□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 YLR415CYLR415C 339 nt10.44□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 YNL115CYNL115C 1935 nt10.43□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 BOP3YNL042W 1191 nt10.43□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 RTF1YGL244W 1677 nt10.43□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 PAC11YDR488C 1602 nt10.43□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 ALG3YBL082C 1377 nt10.42□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 ANP1YEL036C 1503 nt10.42□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 SNG1YGR197C 1644 nt10.41□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 MIC10YCL057C-A 294 nt10.41□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 SWC5YBR231C 912 nt10.4□□□□□ -0.74
PFA4Q12006 FEN2YCR028C 1539 nt10.38□□□□□ -0.75
PFA4Q12006 HEM12YDR047W 1089 nt10.37□□□□□ -0.75
PFA4Q12006 SBA1YKL117W 651 nt10.34□□□□□ -0.75
PFA4Q12006 PTK1YKL198C 1989 nt10.29□□□□□ -0.76
PFA4Q12006 YIR016WYIR016W 798 nt10.29□□□□□ -0.76
PFA4Q12006 SPT8YLR055C 1809 nt10.28□□□□□ -0.76
PFA4Q12006 VPS75YNL246W 795 nt10.27□□□□□ -0.77
PFA4Q12006 NVJ2YPR091C 2313 nt10.26□□□□□ -0.77
PFA4Q12006 MIR1YJR077C 936 nt10.26□□□□□ -0.77
PFA4Q12006 NAT4YMR069W 858 nt10.25□□□□□ -0.77
PFA4Q12006 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.24□□□□□ -0.77
PFA4Q12006 GLK1YCL040W 1503 nt10.22□□□□□ -0.77
PFA4Q12006 MSF1YPR047W 1410 nt10.18□□□□□ -0.78
PFA4Q12006 THI74YDR438W 1113 nt10.18□□□□□ -0.78
PFA4Q12006 TIM17YJL143W 477 nt10.17□□□□□ -0.78
PFA4Q12006 MIC12YBR262C 321 nt10.17□□□□□ -0.78
PFA4Q12006 SHM2YLR058C 1410 nt10.16□□□□□ -0.78
PFA4Q12006 XDJ1YLR090W 1380 nt10.14□□□□□ -0.79
PFA4Q12006 BNA2YJR078W 1362 nt10.13□□□□□ -0.79
PFA4Q12006 RAX1YOR301W 1308 nt10.11□□□□□ -0.79
PFA4Q12006 YFL054CYFL054C 1941 nt10.11□□□□□ -0.79
PFA4Q12006 NIT1YIL164C 600 nt10.09□□□□□ -0.79
PFA4Q12006 DAT1YML113W 747 nt10.09□□□□□ -0.79
PFA4Q12006 PAU7YAR020C 168 nt10.08□□□□□ -0.8
PFA4Q12006 SGT2YOR007C 1041 nt10.07□□□□□ -0.8
PFA4Q12006 SHB17YKR043C 816 nt10.06□□□□□ -0.8
PFA4Q12006 UBA4YHR111W 1323 nt10.05□□□□□ -0.8
PFA4Q12006 GDH3YAL062W 1374 nt10.04□□□□□ -0.8
PFA4Q12006 YDR010CYDR010C 333 nt10.03□□□□□ -0.8
PFA4Q12006 YGR201CYGR201C 678 nt10.03□□□□□ -0.8
PFA4Q12006 HHO1YPL127C 777 nt10.03□□□□□ -0.8
PFA4Q12006 YGL034CYGL034C 366 nt9.99□□□□□ -0.81
PFA4Q12006 YSR3YKR053C 1215 nt9.97□□□□□ -0.81
PFA4Q12006 AGP1YCL025C 1902 nt9.97□□□□□ -0.81
PFA4Q12006 CCA1YER168C 1641 nt9.96□□□□□ -0.82
PFA4Q12006 AVT6YER119C 1347 nt9.95□□□□□ -0.82
PFA4Q12006 SWE1YJL187C 2460 nt9.93□□□□□ -0.82
PFA4Q12006 XYL2YLR070C 1071 nt9.93□□□□□ -0.82
PFA4Q12006 DUT1YBR252W 444 nt9.93□□□□□ -0.82
PFA4Q12006 RET2YFR051C 1641 nt9.93□□□□□ -0.82
PFA4Q12006 YMR244WYMR244W 1068 nt9.92□□□□□ -0.82
PFA4Q12006 PHO89YBR296C 1725 nt9.9□□□□□ -0.83
PFA4Q12006 GOR1YNL274C 1053 nt9.87□□□□□ -0.83
PFA4Q12006 GLR1YPL091W 1452 nt9.86□□□□□ -0.83
PFA4Q12006 RBG1YAL036C 1110 nt9.86□□□□□ -0.83
PFA4Q12006 NDI1YML120C 1542 nt9.85□□□□□ -0.83
PFA4Q12006 YCR087WYCR087W 516 nt9.83□□□□□ -0.84
PFA4Q12006 YCR102CYCR102C 1107 nt9.82□□□□□ -0.84
PFA4Q12006 AIM45YPR004C 1035 nt9.82□□□□□ -0.84
PFA4Q12006 SFA1YDL168W 1161 nt9.81□□□□□ -0.84
PFA4Q12006 COQ2YNR041C 1119 nt9.8□□□□□ -0.84
PFA4Q12006 MRP20YDR405W 792 nt9.74□□□□□ -0.85
PFA4Q12006 NBP35YGL091C 987 nt9.74□□□□□ -0.85
PFA4Q12006 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.74□□□□□ -0.85
PFA4Q12006 SHH4YLR164W 507 nt9.74□□□□□ -0.85
PFA4Q12006 RBG2YGR173W 1107 nt9.73□□□□□ -0.85
PFA4Q12006 DUS1YML080W 1272 nt9.72□□□□□ -0.85
PFA4Q12006 STR3YGL184C 1398 nt9.7□□□□□ -0.86
PFA4Q12006 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.7□□□□□ -0.86
PFA4Q12006 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.7□□□□□ -0.86
PFA4Q12006 TIR3YIL011W 810 nt9.68□□□□□ -0.86
PFA4Q12006 AQY2YLL052C 450 nt9.66□□□□□ -0.86
PFA4Q12006 YCL074WYCL074W 927 nt9.65□□□□□ -0.86
PFA4Q12006 RPL4BYDR012W 1089 nt9.63□□□□□ -0.87
PFA4Q12006 TOM6YOR045W 186 nt9.63□□□□□ -0.87
PFA4Q12006 RPL4AYBR031W 1089 nt9.63□□□□□ -0.87
PFA4Q12006 RPS14BYJL191W 417 nt9.62□□□□□ -0.87
PFA4Q12006 POM34YLR018C 900 nt9.61□□□□□ -0.87
PFA4Q12006 YMR226CYMR226C 804 nt9.6□□□□□ -0.87
PFA4Q12006 YJL225CYJL225C 5277 nt9.59□□□□□ -0.87
PFA4Q12006 FUR4YBR021W 1902 nt9.58□□□□□ -0.88
PFA4Q12006 PRO1YDR300C 1287 nt9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.1 ms