Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc45a4Q0P5V9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc45a4Q0P5V9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc45a4Q0P5V9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc45a4Q0P5V9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc45a4Q0P5V9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc45a4Q0P5V9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc45a4Q0P5V9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc45a4Q0P5V9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc45a4Q0P5V9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc45a4Q0P5V9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc45a4Q0P5V9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc45a4Q0P5V9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc45a4Q0P5V9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc45a4Q0P5V9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc45a4Q0P5V9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc45a4Q0P5V9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc45a4Q0P5V9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc45a4Q0P5V9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc45a4Q0P5V9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc45a4Q0P5V9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc45a4Q0P5V9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc45a4Q0P5V9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc45a4Q0P5V9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc45a4Q0P5V9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc45a4Q0P5V9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc45a4Q0P5V9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc45a4Q0P5V9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc45a4Q0P5V9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc45a4Q0P5V9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc45a4Q0P5V9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc45a4Q0P5V9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc45a4Q0P5V9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc45a4Q0P5V9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc45a4Q0P5V9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc45a4Q0P5V9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc45a4Q0P5V9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc45a4Q0P5V9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc45a4Q0P5V9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc45a4Q0P5V9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc45a4Q0P5V9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc45a4Q0P5V9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc45a4Q0P5V9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc45a4Q0P5V9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc45a4Q0P5V9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slc45a4Q0P5V9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc45a4Q0P5V9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc45a4Q0P5V9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc45a4Q0P5V9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc45a4Q0P5V9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc45a4Q0P5V9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc45a4Q0P5V9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc45a4Q0P5V9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc45a4Q0P5V9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc45a4Q0P5V9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc45a4Q0P5V9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc45a4Q0P5V9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc45a4Q0P5V9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc45a4Q0P5V9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc45a4Q0P5V9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc45a4Q0P5V9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc45a4Q0P5V9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc45a4Q0P5V9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc45a4Q0P5V9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc45a4Q0P5V9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc45a4Q0P5V9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc45a4Q0P5V9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc45a4Q0P5V9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc45a4Q0P5V9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc45a4Q0P5V9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc45a4Q0P5V9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc45a4Q0P5V9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc45a4Q0P5V9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms