Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 GAL1YBR020W 1587 nt13.37□□□□□ -0.27
CTI6Q08923 THI74YDR438W 1113 nt13.36□□□□□ -0.27
CTI6Q08923 BIO4YNR057C 714 nt13.36□□□□□ -0.27
CTI6Q08923 PCH2YBR186W 1695 nt13.35□□□□□ -0.27
CTI6Q08923 GUT2YIL155C 1950 nt13.35□□□□□ -0.27
CTI6Q08923 PIB2YGL023C 1908 nt13.33□□□□□ -0.28
CTI6Q08923 YHL050CYHL050C 2094 nt13.33□□□□□ -0.28
CTI6Q08923 SPC25YER018C 666 nt13.32□□□□□ -0.28
CTI6Q08923 TRM5YHR070W 1500 nt13.3□□□□□ -0.28
CTI6Q08923 CCT4YDL143W 1587 nt13.3□□□□□ -0.28
CTI6Q08923 STB1YNL309W 1263 nt13.3□□□□□ -0.28
CTI6Q08923 RRT12YCR045C 1476 nt13.28□□□□□ -0.28
CTI6Q08923 YNL195CYNL195C 786 nt13.27□□□□□ -0.29
CTI6Q08923 VPS75YNL246W 795 nt13.27□□□□□ -0.29
CTI6Q08923 SIM1YIL123W 1431 nt13.24□□□□□ -0.29
CTI6Q08923 SEC11YIR022W 504 nt13.21□□□□□ -0.29
CTI6Q08923 DAT1YML113W 747 nt13.21□□□□□ -0.29
CTI6Q08923 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.2□□□□□ -0.3
CTI6Q08923 GLR1YPL091W 1452 nt13.19□□□□□ -0.3
CTI6Q08923 VPS60YDR486C 690 nt13.19□□□□□ -0.3
CTI6Q08923 ATF2YGR177C 1608 nt13.19□□□□□ -0.3
CTI6Q08923 GPI16YHR188C 1833 nt13.18□□□□□ -0.3
CTI6Q08923 ALG3YBL082C 1377 nt13.17□□□□□ -0.3
CTI6Q08923 SPT8YLR055C 1809 nt13.13□□□□□ -0.31
CTI6Q08923 DDR2YOL052C-A 186 nt13.13□□□□□ -0.31
CTI6Q08923 SWC5YBR231C 912 nt13.13□□□□□ -0.31
CTI6Q08923 YGL034CYGL034C 366 nt13.11□□□□□ -0.31
CTI6Q08923 RBG2YGR173W 1107 nt13.11□□□□□ -0.31
CTI6Q08923 YFL067WYFL067W 528 nt13.1□□□□□ -0.31
CTI6Q08923 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.08□□□□□ -0.32
CTI6Q08923 FEN2YCR028C 1539 nt13.08□□□□□ -0.32
CTI6Q08923 ANP1YEL036C 1503 nt13.06□□□□□ -0.32
CTI6Q08923 UBA4YHR111W 1323 nt13.06□□□□□ -0.32
CTI6Q08923 ERF2YLR246W 1080 nt13.05□□□□□ -0.32
CTI6Q08923 CRR1YLR213C 1269 nt13.01□□□□□ -0.33
CTI6Q08923 PAC11YDR488C 1602 nt13.01□□□□□ -0.33
CTI6Q08923 NCP1YHR042W 2076 nt13□□□□□ -0.33
CTI6Q08923 PAU7YAR020C 168 nt12.99□□□□□ -0.33
CTI6Q08923 RTF1YGL244W 1677 nt12.99□□□□□ -0.33
CTI6Q08923 NDI1YML120C 1542 nt12.98□□□□□ -0.33
CTI6Q08923 YIR016WYIR016W 798 nt12.97□□□□□ -0.33
CTI6Q08923 SHB17YKR043C 816 nt12.97□□□□□ -0.33
CTI6Q08923 PTK1YKL198C 1989 nt12.97□□□□□ -0.33
CTI6Q08923 SNG1YGR197C 1644 nt12.94□□□□□ -0.34
CTI6Q08923 YSR3YKR053C 1215 nt12.93□□□□□ -0.34
CTI6Q08923 XYL2YLR070C 1071 nt12.93□□□□□ -0.34
CTI6Q08923 YDR010CYDR010C 333 nt12.92□□□□□ -0.34
CTI6Q08923 RBG1YAL036C 1110 nt12.91□□□□□ -0.34
CTI6Q08923 TIM17YJL143W 477 nt12.9□□□□□ -0.34
CTI6Q08923 MIC10YCL057C-A 294 nt12.88□□□□□ -0.35
CTI6Q08923 LYS4YDR234W 2082 nt12.85□□□□□ -0.35
CTI6Q08923 SHM2YLR058C 1410 nt12.85□□□□□ -0.35
CTI6Q08923 HEM12YDR047W 1089 nt12.84□□□□□ -0.35
CTI6Q08923 BOP3YNL042W 1191 nt12.84□□□□□ -0.35
CTI6Q08923 YMR226CYMR226C 804 nt12.81□□□□□ -0.36
CTI6Q08923 NIT1YIL164C 600 nt12.8□□□□□ -0.36
CTI6Q08923 SAM1YLR180W 1149 nt12.79□□□□□ -0.36
CTI6Q08923 RET2YFR051C 1641 nt12.79□□□□□ -0.36
CTI6Q08923 SGT2YOR007C 1041 nt12.76□□□□□ -0.37
CTI6Q08923 Q0182Q0182 405 nt12.75□□□□□ -0.37
CTI6Q08923 AIM45YPR004C 1035 nt12.75□□□□□ -0.37
CTI6Q08923 PHO89YBR296C 1725 nt12.75□□□□□ -0.37
CTI6Q08923 XDJ1YLR090W 1380 nt12.74□□□□□ -0.37
CTI6Q08923 YCR087WYCR087W 516 nt12.73□□□□□ -0.37
CTI6Q08923 RAD51YER095W 1203 nt12.71□□□□□ -0.37
CTI6Q08923 MIC12YBR262C 321 nt12.65□□□□□ -0.38
CTI6Q08923 GDH3YAL062W 1374 nt12.63□□□□□ -0.39
CTI6Q08923 COQ2YNR041C 1119 nt12.62□□□□□ -0.39
CTI6Q08923 NVJ2YPR091C 2313 nt12.61□□□□□ -0.39
CTI6Q08923 MRP20YDR405W 792 nt12.57□□□□□ -0.4
CTI6Q08923 RPM1RPM1 483 nt12.57□□□□□ -0.4
CTI6Q08923 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.55□□□□□ -0.4
CTI6Q08923 YFL054CYFL054C 1941 nt12.53□□□□□ -0.4
CTI6Q08923 SFA1YDL168W 1161 nt12.53□□□□□ -0.4
CTI6Q08923 BNA2YJR078W 1362 nt12.53□□□□□ -0.4
CTI6Q08923 YLR111WYLR111W 333 nt12.51□□□□□ -0.41
CTI6Q08923 YGR201CYGR201C 678 nt12.49□□□□□ -0.41
CTI6Q08923 YNR029CYNR029C 1290 nt12.48□□□□□ -0.41
CTI6Q08923 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.46□□□□□ -0.41
CTI6Q08923 YLR349WYLR349W 507 nt12.45□□□□□ -0.42
CTI6Q08923 HHO1YPL127C 777 nt12.45□□□□□ -0.42
CTI6Q08923 CAB5YDR196C 726 nt12.44□□□□□ -0.42
CTI6Q08923 RAX1YOR301W 1308 nt12.43□□□□□ -0.42
CTI6Q08923 RPL4BYDR012W 1089 nt12.41□□□□□ -0.42
CTI6Q08923 STE4YOR212W 1272 nt12.41□□□□□ -0.42
CTI6Q08923 RPL4AYBR031W 1089 nt12.41□□□□□ -0.42
CTI6Q08923 AVT6YER119C 1347 nt12.4□□□□□ -0.42
CTI6Q08923 RAD23YEL037C 1197 nt12.39□□□□□ -0.43
CTI6Q08923 RPS14BYJL191W 417 nt12.39□□□□□ -0.43
CTI6Q08923 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.38□□□□□ -0.43
CTI6Q08923 YCR102CYCR102C 1107 nt12.36□□□□□ -0.43
CTI6Q08923 SWE1YJL187C 2460 nt12.32□□□□□ -0.44
CTI6Q08923 FUN14YAL008W 597 nt12.32□□□□□ -0.44
CTI6Q08923 SDH5YOL071W 489 nt12.32□□□□□ -0.44
CTI6Q08923 DUT1YBR252W 444 nt12.32□□□□□ -0.44
CTI6Q08923 CLB6YGR109C 1143 nt12.3□□□□□ -0.44
CTI6Q08923 GOR1YNL274C 1053 nt12.3□□□□□ -0.44
CTI6Q08923 SHH4YLR164W 507 nt12.29□□□□□ -0.44
CTI6Q08923 RIB3YDR487C 627 nt12.28□□□□□ -0.44
CTI6Q08923 AGP1YCL025C 1902 nt12.25□□□□□ -0.45
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