Protein–RNA interactions for Protein: Q07527

TRM3, tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM3Q07527 NDI1YML120C 1542 nt15.93■□□□□ 0.14
TRM3Q07527 BIO4YNR057C 714 nt15.92■□□□□ 0.14
TRM3Q07527 GAL1YBR020W 1587 nt15.91■□□□□ 0.14
TRM3Q07527 YGL034CYGL034C 366 nt15.9■□□□□ 0.14
TRM3Q07527 TRM5YHR070W 1500 nt15.88■□□□□ 0.13
TRM3Q07527 SPT5YML010W 3192 nt15.87■□□□□ 0.13
TRM3Q07527 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt15.86■□□□□ 0.13
TRM3Q07527 CCT4YDL143W 1587 nt15.86■□□□□ 0.13
TRM3Q07527 SCC4YER147C 1875 nt15.85■□□□□ 0.13
TRM3Q07527 STB1YNL309W 1263 nt15.85■□□□□ 0.13
TRM3Q07527 GPI16YHR188C 1833 nt15.81■□□□□ 0.12
TRM3Q07527 RBG1YAL036C 1110 nt15.81■□□□□ 0.12
TRM3Q07527 YNL195CYNL195C 786 nt15.78■□□□□ 0.12
TRM3Q07527 UBA4YHR111W 1323 nt15.78■□□□□ 0.12
TRM3Q07527 VPS60YDR486C 690 nt15.77■□□□□ 0.11
TRM3Q07527 YSR3YKR053C 1215 nt15.77■□□□□ 0.11
TRM3Q07527 SDH1YKL148C 1923 nt15.76■□□□□ 0.11
TRM3Q07527 SPC25YER018C 666 nt15.76■□□□□ 0.11
TRM3Q07527 SIM1YIL123W 1431 nt15.75■□□□□ 0.11
TRM3Q07527 SHB17YKR043C 816 nt15.75■□□□□ 0.11
TRM3Q07527 SPT8YLR055C 1809 nt15.71■□□□□ 0.11
TRM3Q07527 ALG3YBL082C 1377 nt15.7■□□□□ 0.1
TRM3Q07527 SAM1YLR180W 1149 nt15.69■□□□□ 0.1
TRM3Q07527 XYL2YLR070C 1071 nt15.68■□□□□ 0.1
TRM3Q07527 DDR2YOL052C-A 186 nt15.68■□□□□ 0.1
TRM3Q07527 RPM1RPM1 483 nt15.66■□□□□ 0.1
TRM3Q07527 RAD51YER095W 1203 nt15.65■□□□□ 0.1
TRM3Q07527 TIM17YJL143W 477 nt15.63■□□□□ 0.09
TRM3Q07527 ATF2YGR177C 1608 nt15.63■□□□□ 0.09
TRM3Q07527 SSA4YER103W 1929 nt15.56■□□□□ 0.08
TRM3Q07527 ERF2YLR246W 1080 nt15.52■□□□□ 0.08
TRM3Q07527 YCR087WYCR087W 516 nt15.51■□□□□ 0.07
TRM3Q07527 YFL067WYFL067W 528 nt15.51■□□□□ 0.07
TRM3Q07527 YMR226CYMR226C 804 nt15.51■□□□□ 0.07
TRM3Q07527 AIM45YPR004C 1035 nt15.51■□□□□ 0.07
TRM3Q07527 RRT12YCR045C 1476 nt15.5■□□□□ 0.07
TRM3Q07527 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt15.5■□□□□ 0.07
TRM3Q07527 YLR111WYLR111W 333 nt15.5■□□□□ 0.07
TRM3Q07527 PHO89YBR296C 1725 nt15.49■□□□□ 0.07
TRM3Q07527 CRR1YLR213C 1269 nt15.49■□□□□ 0.07
TRM3Q07527 FEN2YCR028C 1539 nt15.48■□□□□ 0.07
TRM3Q07527 YBR220CYBR220C 1683 nt15.48■□□□□ 0.07
TRM3Q07527 YDR010CYDR010C 333 nt15.45■□□□□ 0.06
TRM3Q07527 ANP1YEL036C 1503 nt15.43■□□□□ 0.06
TRM3Q07527 SGT2YOR007C 1041 nt15.42■□□□□ 0.06
TRM3Q07527 RET2YFR051C 1641 nt15.39■□□□□ 0.05
TRM3Q07527 YNR029CYNR029C 1290 nt15.37■□□□□ 0.05
TRM3Q07527 SHM2YLR058C 1410 nt15.37■□□□□ 0.05
TRM3Q07527 ADH7YCR105W 1086 nt15.34■□□□□ 0.05
TRM3Q07527 SDH5YOL071W 489 nt15.32■□□□□ 0.04
TRM3Q07527 SNG1YGR197C 1644 nt15.31■□□□□ 0.04
TRM3Q07527 STE4YOR212W 1272 nt15.29■□□□□ 0.04
TRM3Q07527 XDJ1YLR090W 1380 nt15.28■□□□□ 0.04
TRM3Q07527 YIR016WYIR016W 798 nt15.28■□□□□ 0.04
TRM3Q07527 MIC10YCL057C-A 294 nt15.27■□□□□ 0.04
TRM3Q07527 MRP20YDR405W 792 nt15.26■□□□□ 0.03
TRM3Q07527 HEM12YDR047W 1089 nt15.26■□□□□ 0.03
TRM3Q07527 YLR349WYLR349W 507 nt15.24■□□□□ 0.03
TRM3Q07527 YHL050CYHL050C 2094 nt15.23■□□□□ 0.03
TRM3Q07527 NIT1YIL164C 600 nt15.19■□□□□ 0.02
TRM3Q07527 PAU15YIR041W 375 nt15.19■□□□□ 0.02
TRM3Q07527 COQ2YNR041C 1119 nt15.17■□□□□ 0.02
TRM3Q07527 YLR279WYLR279W 390 nt15.14■□□□□ 0.01
TRM3Q07527 BNA2YJR078W 1362 nt15.04■□□□□ -0
TRM3Q07527 GDH3YAL062W 1374 nt15.03■□□□□ -0
TRM3Q07527 RPL4BYDR012W 1089 nt14.99□□□□□ -0.01
TRM3Q07527 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt14.99□□□□□ -0.01
TRM3Q07527 RPL4AYBR031W 1089 nt14.99□□□□□ -0.01
TRM3Q07527 BDF1YLR399C 2061 nt14.95□□□□□ -0.02
TRM3Q07527 RAD23YEL037C 1197 nt14.94□□□□□ -0.02
TRM3Q07527 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt14.93□□□□□ -0.02
TRM3Q07527 SFA1YDL168W 1161 nt14.92□□□□□ -0.02
TRM3Q07527 CAB5YDR196C 726 nt14.92□□□□□ -0.02
TRM3Q07527 FUN14YAL008W 597 nt14.92□□□□□ -0.02
TRM3Q07527 RPS14BYJL191W 417 nt14.92□□□□□ -0.02
TRM3Q07527 GPN2YOR262W 1044 nt14.92□□□□□ -0.02
TRM3Q07527 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt14.91□□□□□ -0.02
TRM3Q07527 YGR201CYGR201C 678 nt14.89□□□□□ -0.03
TRM3Q07527 AVT6YER119C 1347 nt14.89□□□□□ -0.03
TRM3Q07527 YJL195CYJL195C 702 nt14.88□□□□□ -0.03
TRM3Q07527 MIC12YBR262C 321 nt14.86□□□□□ -0.03
TRM3Q07527 YGR012WYGR012W 1182 nt14.85□□□□□ -0.03
TRM3Q07527 CLB6YGR109C 1143 nt14.85□□□□□ -0.03
TRM3Q07527 LYS4YDR234W 2082 nt14.85□□□□□ -0.03
TRM3Q07527 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt14.81□□□□□ -0.04
TRM3Q07527 TAT1YBR069C 1860 nt14.78□□□□□ -0.04
TRM3Q07527 UTH1YKR042W 1098 nt14.78□□□□□ -0.04
TRM3Q07527 TSC10YBR265W 963 nt14.78□□□□□ -0.04
TRM3Q07527 SEC11YIR022W 504 nt14.76□□□□□ -0.05
TRM3Q07527 HHO1YPL127C 777 nt14.76□□□□□ -0.05
TRM3Q07527 ESS1YJR017C 513 nt14.75□□□□□ -0.05
TRM3Q07527 CPD1YGR247W 720 nt14.74□□□□□ -0.05
TRM3Q07527 YCR102CYCR102C 1107 nt14.69□□□□□ -0.06
TRM3Q07527 RIB3YDR487C 627 nt14.67□□□□□ -0.06
TRM3Q07527 GOR1YNL274C 1053 nt14.66□□□□□ -0.06
TRM3Q07527 PEX2YJL210W 816 nt14.66□□□□□ -0.06
TRM3Q07527 ADH1YOL086C 1047 nt14.66□□□□□ -0.06
TRM3Q07527 NCP1YHR042W 2076 nt14.64□□□□□ -0.07
TRM3Q07527 NAP1YKR048C 1254 nt14.64□□□□□ -0.07
TRM3Q07527 SEN2YLR105C 1134 nt14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms