Protein–RNA interactions for Protein: Q06070

YLR407W, Uncharacterized protein YLR407W, yeastyeast

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR407WQ06070 HUA1YGR268C 597 nt12.51□□□□□ -0.41
YLR407WQ06070 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.49□□□□□ -0.41
YLR407WQ06070 STB1YNL309W 1263 nt12.49□□□□□ -0.41
YLR407WQ06070 AQY1YPR192W 918 nt12.49□□□□□ -0.41
YLR407WQ06070 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.48□□□□□ -0.41
YLR407WQ06070 AHT1YHR093W 549 nt12.48□□□□□ -0.41
YLR407WQ06070 YPR064WYPR064W 420 nt12.48□□□□□ -0.41
YLR407WQ06070 SPT8YLR055C 1809 nt12.48□□□□□ -0.41
YLR407WQ06070 ADO1YJR105W 1023 nt12.46□□□□□ -0.41
YLR407WQ06070 PAC11YDR488C 1602 nt12.44□□□□□ -0.42
YLR407WQ06070 SPC25YER018C 666 nt12.43□□□□□ -0.42
YLR407WQ06070 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.42□□□□□ -0.42
YLR407WQ06070 ANP1YEL036C 1503 nt12.42□□□□□ -0.42
YLR407WQ06070 TAD3YLR316C 969 nt12.41□□□□□ -0.42
YLR407WQ06070 VPS60YDR486C 690 nt12.4□□□□□ -0.42
YLR407WQ06070 FEN2YCR028C 1539 nt12.4□□□□□ -0.42
YLR407WQ06070 CCT4YDL143W 1587 nt12.39□□□□□ -0.43
YLR407WQ06070 GPI16YHR188C 1833 nt12.37□□□□□ -0.43
YLR407WQ06070 ALG3YBL082C 1377 nt12.35□□□□□ -0.43
YLR407WQ06070 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.34□□□□□ -0.43
YLR407WQ06070 SWE1YJL187C 2460 nt12.33□□□□□ -0.44
YLR407WQ06070 SWC5YBR231C 912 nt12.33□□□□□ -0.44
YLR407WQ06070 RAX1YOR301W 1308 nt12.32□□□□□ -0.44
YLR407WQ06070 YIR016WYIR016W 798 nt12.29□□□□□ -0.44
YLR407WQ06070 BNA2YJR078W 1362 nt12.28□□□□□ -0.44
YLR407WQ06070 BDH1YAL060W 1149 nt12.27□□□□□ -0.45
YLR407WQ06070 CCA1YER168C 1641 nt12.22□□□□□ -0.45
YLR407WQ06070 YLR415CYLR415C 339 nt12.2□□□□□ -0.46
YLR407WQ06070 MIC12YBR262C 321 nt12.19□□□□□ -0.46
YLR407WQ06070 YSP3YOR003W 1437 nt12.17□□□□□ -0.46
YLR407WQ06070 YFL066CYFL066C 1179 nt12.14□□□□□ -0.47
YLR407WQ06070 HHO1YPL127C 777 nt12.14□□□□□ -0.47
YLR407WQ06070 UBX6YJL048C 1191 nt12.12□□□□□ -0.47
YLR407WQ06070 YNL115CYNL115C 1935 nt12.11□□□□□ -0.47
YLR407WQ06070 AGP1YCL025C 1902 nt12.11□□□□□ -0.47
YLR407WQ06070 PRE6YOL038W 765 nt12.1□□□□□ -0.47
YLR407WQ06070 XDJ1YLR090W 1380 nt12.08□□□□□ -0.48
YLR407WQ06070 YDR094WYDR094W 336 nt12.07□□□□□ -0.48
YLR407WQ06070 PEX25YPL112C 1185 nt12.06□□□□□ -0.48
YLR407WQ06070 YFR018CYFR018C 1092 nt12.04□□□□□ -0.48
YLR407WQ06070 DUT1YBR252W 444 nt12.04□□□□□ -0.48
YLR407WQ06070 GDH3YAL062W 1374 nt12.03□□□□□ -0.48
YLR407WQ06070 SHM2YLR058C 1410 nt12.03□□□□□ -0.48
YLR407WQ06070 YGR201CYGR201C 678 nt12□□□□□ -0.49
YLR407WQ06070 DUS1YML080W 1272 nt11.99□□□□□ -0.49
YLR407WQ06070 AVT6YER119C 1347 nt11.98□□□□□ -0.49
YLR407WQ06070 TIM17YJL143W 477 nt11.97□□□□□ -0.49
YLR407WQ06070 FUR4YBR021W 1902 nt11.96□□□□□ -0.5
YLR407WQ06070 PAU16YKL224C 372 nt11.92□□□□□ -0.5
YLR407WQ06070 GOR1YNL274C 1053 nt11.91□□□□□ -0.5
YLR407WQ06070 RRT5YFR032C 870 nt11.9□□□□□ -0.5
YLR407WQ06070 NIT1YIL164C 600 nt11.9□□□□□ -0.5
YLR407WQ06070 SGT2YOR007C 1041 nt11.89□□□□□ -0.51
YLR407WQ06070 VPS75YNL246W 795 nt11.87□□□□□ -0.51
YLR407WQ06070 HSP60YLR259C 1719 nt11.86□□□□□ -0.51
YLR407WQ06070 GLK1YCL040W 1503 nt11.84□□□□□ -0.51
YLR407WQ06070 BOR1YNL275W 1731 nt11.83□□□□□ -0.52
YLR407WQ06070 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.83□□□□□ -0.52
YLR407WQ06070 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.83□□□□□ -0.52
YLR407WQ06070 YCL074WYCL074W 927 nt11.82□□□□□ -0.52
YLR407WQ06070 AQY2YLL052C 450 nt11.81□□□□□ -0.52
YLR407WQ06070 STR3YGL184C 1398 nt11.8□□□□□ -0.52
YLR407WQ06070 PAU7YAR020C 168 nt11.78□□□□□ -0.52
YLR407WQ06070 DAT1YML113W 747 nt11.73□□□□□ -0.53
YLR407WQ06070 MIR1YJR077C 936 nt11.72□□□□□ -0.53
YLR407WQ06070 NVJ2YPR091C 2313 nt11.71□□□□□ -0.53
YLR407WQ06070 PRP4YPR178W 1398 nt11.7□□□□□ -0.54
YLR407WQ06070 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.69□□□□□ -0.54
YLR407WQ06070 SHB17YKR043C 816 nt11.69□□□□□ -0.54
YLR407WQ06070 YKR005CYKR005C 1578 nt11.68□□□□□ -0.54
YLR407WQ06070 YCR102CYCR102C 1107 nt11.68□□□□□ -0.54
YLR407WQ06070 YDR010CYDR010C 333 nt11.65□□□□□ -0.54
YLR407WQ06070 THI74YDR438W 1113 nt11.64□□□□□ -0.55
YLR407WQ06070 NBP35YGL091C 987 nt11.64□□□□□ -0.55
YLR407WQ06070 DPS1YLL018C 1674 nt11.63□□□□□ -0.55
YLR407WQ06070 NAT4YMR069W 858 nt11.63□□□□□ -0.55
YLR407WQ06070 YGR259CYGR259C 441 nt11.62□□□□□ -0.55
YLR407WQ06070 UBA4YHR111W 1323 nt11.6□□□□□ -0.55
YLR407WQ06070 SHH4YLR164W 507 nt11.59□□□□□ -0.55
YLR407WQ06070 MSF1YPR047W 1410 nt11.57□□□□□ -0.56
YLR407WQ06070 BMT6YLR063W 1098 nt11.55□□□□□ -0.56
YLR407WQ06070 PHO89YBR296C 1725 nt11.54□□□□□ -0.56
YLR407WQ06070 YSR3YKR053C 1215 nt11.53□□□□□ -0.56
YLR407WQ06070 RET2YFR051C 1641 nt11.51□□□□□ -0.57
YLR407WQ06070 SFA1YDL168W 1161 nt11.51□□□□□ -0.57
YLR407WQ06070 RTN2YDL204W 1182 nt11.5□□□□□ -0.57
YLR407WQ06070 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.5□□□□□ -0.57
YLR407WQ06070 AAC1YMR056C 930 nt11.5□□□□□ -0.57
YLR407WQ06070 XYL2YLR070C 1071 nt11.49□□□□□ -0.57
YLR407WQ06070 SNF1YDR477W 1902 nt11.48□□□□□ -0.57
YLR407WQ06070 PLB1YMR008C 1995 nt11.48□□□□□ -0.57
YLR407WQ06070 TIR3YIL011W 810 nt11.47□□□□□ -0.57
YLR407WQ06070 YGL034CYGL034C 366 nt11.46□□□□□ -0.57
YLR407WQ06070 PRO1YDR300C 1287 nt11.44□□□□□ -0.58
YLR407WQ06070 ARP6YLR085C 1317 nt11.43□□□□□ -0.58
YLR407WQ06070 TOM6YOR045W 186 nt11.43□□□□□ -0.58
YLR407WQ06070 POM34YLR018C 900 nt11.41□□□□□ -0.58
YLR407WQ06070 COQ2YNR041C 1119 nt11.41□□□□□ -0.58
YLR407WQ06070 IRC24YIR036C 792 nt11.39□□□□□ -0.59
YLR407WQ06070 ALG12YNR030W 1656 nt11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.4 ms