Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 YLR235CYLR235C 399 nt12.52□□□□□ -0.41
HRQ1Q05549 YLR179CYLR179C 606 nt12.5□□□□□ -0.41
HRQ1Q05549 ANP1YEL036C 1503 nt12.49□□□□□ -0.41
HRQ1Q05549 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.46□□□□□ -0.41
HRQ1Q05549 STB1YNL309W 1263 nt12.46□□□□□ -0.41
HRQ1Q05549 HSP60YLR259C 1719 nt12.45□□□□□ -0.42
HRQ1Q05549 AQY1YPR192W 918 nt12.44□□□□□ -0.42
HRQ1Q05549 SPC25YER018C 666 nt12.42□□□□□ -0.42
HRQ1Q05549 WSC2YNL283C 1512 nt12.42□□□□□ -0.42
HRQ1Q05549 YKL030WYKL030W 606 nt12.41□□□□□ -0.42
HRQ1Q05549 FEN2YCR028C 1539 nt12.41□□□□□ -0.42
HRQ1Q05549 FUR4YBR021W 1902 nt12.41□□□□□ -0.42
HRQ1Q05549 AHT1YHR093W 549 nt12.37□□□□□ -0.43
HRQ1Q05549 BNA2YJR078W 1362 nt12.36□□□□□ -0.43
HRQ1Q05549 VPS60YDR486C 690 nt12.36□□□□□ -0.43
HRQ1Q05549 GLK1YCL040W 1503 nt12.36□□□□□ -0.43
HRQ1Q05549 GPI16YHR188C 1833 nt12.34□□□□□ -0.43
HRQ1Q05549 MIC12YBR262C 321 nt12.34□□□□□ -0.43
HRQ1Q05549 CCT4YDL143W 1587 nt12.34□□□□□ -0.43
HRQ1Q05549 AGP1YCL025C 1902 nt12.33□□□□□ -0.44
HRQ1Q05549 ALG3YBL082C 1377 nt12.32□□□□□ -0.44
HRQ1Q05549 YIR016WYIR016W 798 nt12.31□□□□□ -0.44
HRQ1Q05549 RTG1YOL067C 534 nt12.29□□□□□ -0.44
HRQ1Q05549 YPR064WYPR064W 420 nt12.27□□□□□ -0.45
HRQ1Q05549 HHO1YPL127C 777 nt12.25□□□□□ -0.45
HRQ1Q05549 SWC5YBR231C 912 nt12.25□□□□□ -0.45
HRQ1Q05549 TAD3YLR316C 969 nt12.22□□□□□ -0.45
HRQ1Q05549 DUS1YML080W 1272 nt12.19□□□□□ -0.46
HRQ1Q05549 DUT1YBR252W 444 nt12.17□□□□□ -0.46
HRQ1Q05549 PRP4YPR178W 1398 nt12.17□□□□□ -0.46
HRQ1Q05549 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.14□□□□□ -0.47
HRQ1Q05549 YEL076CYEL076C 651 nt12.14□□□□□ -0.47
HRQ1Q05549 YLR464WYLR464W 651 nt12.14□□□□□ -0.47
HRQ1Q05549 XDJ1YLR090W 1380 nt12.14□□□□□ -0.47
HRQ1Q05549 BDH1YAL060W 1149 nt12.12□□□□□ -0.47
HRQ1Q05549 DPS1YLL018C 1674 nt12.1□□□□□ -0.47
HRQ1Q05549 YCL074WYCL074W 927 nt12.1□□□□□ -0.47
HRQ1Q05549 YGR201CYGR201C 678 nt12.09□□□□□ -0.47
HRQ1Q05549 YKR005CYKR005C 1578 nt12.08□□□□□ -0.48
HRQ1Q05549 ALG12YNR030W 1656 nt12.07□□□□□ -0.48
HRQ1Q05549 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.07□□□□□ -0.48
HRQ1Q05549 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.07□□□□□ -0.48
HRQ1Q05549 GDH3YAL062W 1374 nt12.04□□□□□ -0.48
HRQ1Q05549 AVT6YER119C 1347 nt12.03□□□□□ -0.48
HRQ1Q05549 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.02□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 YLR415CYLR415C 339 nt12.02□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 UME6YDR207C 2511 nt12.02□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 STR3YGL184C 1398 nt12.02□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 AAC1YMR056C 930 nt12□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 HUA1YGR268C 597 nt11.99□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 SNF1YDR477W 1902 nt11.98□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 SHM2YLR058C 1410 nt11.98□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 YGR259CYGR259C 441 nt11.98□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 YSP3YOR003W 1437 nt11.97□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 AQY2YLL052C 450 nt11.96□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 BMT6YLR063W 1098 nt11.96□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 GOR1YNL274C 1053 nt11.96□□□□□ -0.49
HRQ1Q05549 MCH5YOR306C 1566 nt11.92□□□□□ -0.5
HRQ1Q05549 BIO5YNR056C 1686 nt11.91□□□□□ -0.5
HRQ1Q05549 NIT1YIL164C 600 nt11.87□□□□□ -0.51
HRQ1Q05549 TIM17YJL143W 477 nt11.87□□□□□ -0.51
HRQ1Q05549 YNL115CYNL115C 1935 nt11.86□□□□□ -0.51
HRQ1Q05549 MRPL8YJL063C 717 nt11.86□□□□□ -0.51
HRQ1Q05549 YFL066CYFL066C 1179 nt11.83□□□□□ -0.52
HRQ1Q05549 ADO1YJR105W 1023 nt11.83□□□□□ -0.52
HRQ1Q05549 IRC24YIR036C 792 nt11.81□□□□□ -0.52
HRQ1Q05549 SGT2YOR007C 1041 nt11.8□□□□□ -0.52
HRQ1Q05549 NAR1YNL240C 1476 nt11.79□□□□□ -0.52
HRQ1Q05549 PEX25YPL112C 1185 nt11.78□□□□□ -0.52
HRQ1Q05549 DAT1YML113W 747 nt11.75□□□□□ -0.53
HRQ1Q05549 RTN2YDL204W 1182 nt11.73□□□□□ -0.53
HRQ1Q05549 YJL225CYJL225C 5277 nt11.72□□□□□ -0.53
HRQ1Q05549 NBP35YGL091C 987 nt11.72□□□□□ -0.53
HRQ1Q05549 PBP1YGR178C 2169 nt11.71□□□□□ -0.53
HRQ1Q05549 YCR102CYCR102C 1107 nt11.69□□□□□ -0.54
HRQ1Q05549 PRE6YOL038W 765 nt11.68□□□□□ -0.54
HRQ1Q05549 PLB1YMR008C 1995 nt11.66□□□□□ -0.54
HRQ1Q05549 VPS75YNL246W 795 nt11.65□□□□□ -0.54
HRQ1Q05549 YFR018CYFR018C 1092 nt11.63□□□□□ -0.55
HRQ1Q05549 CYT2YKL087C 675 nt11.61□□□□□ -0.55
HRQ1Q05549 ARP6YLR085C 1317 nt11.59□□□□□ -0.55
HRQ1Q05549 SHH4YLR164W 507 nt11.58□□□□□ -0.56
HRQ1Q05549 PRM5YIL117C 957 nt11.54□□□□□ -0.56
HRQ1Q05549 PAU7YAR020C 168 nt11.5□□□□□ -0.57
HRQ1Q05549 YDR010CYDR010C 333 nt11.48□□□□□ -0.57
HRQ1Q05549 TIR3YIL011W 810 nt11.48□□□□□ -0.57
HRQ1Q05549 UTR1YJR049C 1593 nt11.48□□□□□ -0.57
HRQ1Q05549 PRO1YDR300C 1287 nt11.47□□□□□ -0.57
HRQ1Q05549 SHB17YKR043C 816 nt11.46□□□□□ -0.57
HRQ1Q05549 HIF1YLL022C 1158 nt11.46□□□□□ -0.57
HRQ1Q05549 YAT1YAR035W 2064 nt11.46□□□□□ -0.57
HRQ1Q05549 YDR094WYDR094W 336 nt11.44□□□□□ -0.58
HRQ1Q05549 GAP1YKR039W 1809 nt11.44□□□□□ -0.58
HRQ1Q05549 SFA1YDL168W 1161 nt11.43□□□□□ -0.58
HRQ1Q05549 MIR1YJR077C 936 nt11.41□□□□□ -0.58
HRQ1Q05549 POM34YLR018C 900 nt11.41□□□□□ -0.58
HRQ1Q05549 ALD4YOR374W 1560 nt11.41□□□□□ -0.58
HRQ1Q05549 LSC2YGR244C 1284 nt11.4□□□□□ -0.58
HRQ1Q05549 RRT5YFR032C 870 nt11.39□□□□□ -0.59
HRQ1Q05549 PAU16YKL224C 372 nt11.39□□□□□ -0.59
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