Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.44□□□□□ -0.26
CSI1Q04368 MIC10YCL057C-A 294 nt13.43□□□□□ -0.26
CSI1Q04368 YFL067WYFL067W 528 nt13.42□□□□□ -0.26
CSI1Q04368 STB1YNL309W 1263 nt13.42□□□□□ -0.26
CSI1Q04368 DDR2YOL052C-A 186 nt13.42□□□□□ -0.26
CSI1Q04368 SNG1YGR197C 1644 nt13.39□□□□□ -0.27
CSI1Q04368 YDR094WYDR094W 336 nt13.39□□□□□ -0.27
CSI1Q04368 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.39□□□□□ -0.27
CSI1Q04368 SPC25YER018C 666 nt13.39□□□□□ -0.27
CSI1Q04368 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.36□□□□□ -0.27
CSI1Q04368 HEM12YDR047W 1089 nt13.35□□□□□ -0.27
CSI1Q04368 CCT4YDL143W 1587 nt13.33□□□□□ -0.28
CSI1Q04368 ANP1YEL036C 1503 nt13.33□□□□□ -0.28
CSI1Q04368 VPS60YDR486C 690 nt13.31□□□□□ -0.28
CSI1Q04368 BDH1YAL060W 1149 nt13.31□□□□□ -0.28
CSI1Q04368 GPI16YHR188C 1833 nt13.29□□□□□ -0.28
CSI1Q04368 ALG3YBL082C 1377 nt13.29□□□□□ -0.28
CSI1Q04368 FEN2YCR028C 1539 nt13.29□□□□□ -0.28
CSI1Q04368 YFL054CYFL054C 1941 nt13.27□□□□□ -0.29
CSI1Q04368 PRE6YOL038W 765 nt13.26□□□□□ -0.29
CSI1Q04368 YFR018CYFR018C 1092 nt13.24□□□□□ -0.29
CSI1Q04368 YSP3YOR003W 1437 nt13.23□□□□□ -0.29
CSI1Q04368 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.22□□□□□ -0.29
CSI1Q04368 SWC5YBR231C 912 nt13.22□□□□□ -0.29
CSI1Q04368 YFL066CYFL066C 1179 nt13.21□□□□□ -0.29
CSI1Q04368 YLR415CYLR415C 339 nt13.19□□□□□ -0.3
CSI1Q04368 YIR016WYIR016W 798 nt13.17□□□□□ -0.3
CSI1Q04368 YNL115CYNL115C 1935 nt13.14□□□□□ -0.31
CSI1Q04368 PEX25YPL112C 1185 nt13.14□□□□□ -0.31
CSI1Q04368 PAU16YKL224C 372 nt13.13□□□□□ -0.31
CSI1Q04368 SPT8YLR055C 1809 nt13.12□□□□□ -0.31
CSI1Q04368 RAX1YOR301W 1308 nt13.09□□□□□ -0.31
CSI1Q04368 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.08□□□□□ -0.32
CSI1Q04368 MIC12YBR262C 321 nt13.06□□□□□ -0.32
CSI1Q04368 RRT5YFR032C 870 nt13.04□□□□□ -0.32
CSI1Q04368 BNA2YJR078W 1362 nt13.03□□□□□ -0.32
CSI1Q04368 SWE1YJL187C 2460 nt13□□□□□ -0.33
CSI1Q04368 XDJ1YLR090W 1380 nt12.95□□□□□ -0.34
CSI1Q04368 CCA1YER168C 1641 nt12.95□□□□□ -0.34
CSI1Q04368 SHM2YLR058C 1410 nt12.93□□□□□ -0.34
CSI1Q04368 HHO1YPL127C 777 nt12.91□□□□□ -0.34
CSI1Q04368 VPS75YNL246W 795 nt12.9□□□□□ -0.34
CSI1Q04368 AGP1YCL025C 1902 nt12.9□□□□□ -0.35
CSI1Q04368 TIM17YJL143W 477 nt12.89□□□□□ -0.35
CSI1Q04368 GDH3YAL062W 1374 nt12.87□□□□□ -0.35
CSI1Q04368 YGR201CYGR201C 678 nt12.84□□□□□ -0.35
CSI1Q04368 NIT1YIL164C 600 nt12.84□□□□□ -0.35
CSI1Q04368 MIR1YJR077C 936 nt12.83□□□□□ -0.36
CSI1Q04368 DUT1YBR252W 444 nt12.83□□□□□ -0.36
CSI1Q04368 SGT2YOR007C 1041 nt12.79□□□□□ -0.36
CSI1Q04368 AVT6YER119C 1347 nt12.78□□□□□ -0.36
CSI1Q04368 PAC11YDR488C 1602 nt12.77□□□□□ -0.37
CSI1Q04368 GLK1YCL040W 1503 nt12.73□□□□□ -0.37
CSI1Q04368 NAT4YMR069W 858 nt12.73□□□□□ -0.37
CSI1Q04368 THI74YDR438W 1113 nt12.72□□□□□ -0.37
CSI1Q04368 PAU7YAR020C 168 nt12.71□□□□□ -0.37
CSI1Q04368 MSF1YPR047W 1410 nt12.68□□□□□ -0.38
CSI1Q04368 SHB17YKR043C 816 nt12.67□□□□□ -0.38
CSI1Q04368 GOR1YNL274C 1053 nt12.67□□□□□ -0.38
CSI1Q04368 YDR010CYDR010C 333 nt12.66□□□□□ -0.38
CSI1Q04368 DAT1YML113W 747 nt12.64□□□□□ -0.39
CSI1Q04368 SBA1YKL117W 651 nt12.62□□□□□ -0.39
CSI1Q04368 DUS1YML080W 1272 nt12.62□□□□□ -0.39
CSI1Q04368 UBA4YHR111W 1323 nt12.62□□□□□ -0.39
CSI1Q04368 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.57□□□□□ -0.4
CSI1Q04368 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.57□□□□□ -0.4
CSI1Q04368 FUR4YBR021W 1902 nt12.56□□□□□ -0.4
CSI1Q04368 STR3YGL184C 1398 nt12.55□□□□□ -0.4
CSI1Q04368 YCR102CYCR102C 1107 nt12.53□□□□□ -0.4
CSI1Q04368 YCL074WYCL074W 927 nt12.52□□□□□ -0.41
CSI1Q04368 YSR3YKR053C 1215 nt12.51□□□□□ -0.41
CSI1Q04368 YGL034CYGL034C 366 nt12.5□□□□□ -0.41
CSI1Q04368 RET2YFR051C 1641 nt12.5□□□□□ -0.41
CSI1Q04368 NBP35YGL091C 987 nt12.49□□□□□ -0.41
CSI1Q04368 AQY2YLL052C 450 nt12.49□□□□□ -0.41
CSI1Q04368 XYL2YLR070C 1071 nt12.49□□□□□ -0.41
CSI1Q04368 PHO89YBR296C 1725 nt12.48□□□□□ -0.41
CSI1Q04368 SHH4YLR164W 507 nt12.46□□□□□ -0.41
CSI1Q04368 SFA1YDL168W 1161 nt12.45□□□□□ -0.42
CSI1Q04368 HSP60YLR259C 1719 nt12.39□□□□□ -0.43
CSI1Q04368 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.37□□□□□ -0.43
CSI1Q04368 COQ2YNR041C 1119 nt12.37□□□□□ -0.43
CSI1Q04368 TIR3YIL011W 810 nt12.34□□□□□ -0.43
CSI1Q04368 RBG1YAL036C 1110 nt12.34□□□□□ -0.43
CSI1Q04368 YCR087WYCR087W 516 nt12.31□□□□□ -0.44
CSI1Q04368 AIM45YPR004C 1035 nt12.31□□□□□ -0.44
CSI1Q04368 YKR005CYKR005C 1578 nt12.3□□□□□ -0.44
CSI1Q04368 NDI1YML120C 1542 nt12.29□□□□□ -0.44
CSI1Q04368 TOM6YOR045W 186 nt12.28□□□□□ -0.44
CSI1Q04368 MRP20YDR405W 792 nt12.27□□□□□ -0.45
CSI1Q04368 POM34YLR018C 900 nt12.27□□□□□ -0.45
CSI1Q04368 PRO1YDR300C 1287 nt12.26□□□□□ -0.45
CSI1Q04368 PRP4YPR178W 1398 nt12.26□□□□□ -0.45
CSI1Q04368 YGR259CYGR259C 441 nt12.24□□□□□ -0.45
CSI1Q04368 ARP6YLR085C 1317 nt12.24□□□□□ -0.45
CSI1Q04368 BOR1YNL275W 1731 nt12.23□□□□□ -0.45
CSI1Q04368 RTN2YDL204W 1182 nt12.22□□□□□ -0.45
CSI1Q04368 YMR244WYMR244W 1068 nt12.22□□□□□ -0.45
CSI1Q04368 PLB1YMR008C 1995 nt12.21□□□□□ -0.46
CSI1Q04368 PEX2YJL210W 816 nt12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.4 ms