Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 AHT1YHR093W 549 nt10.78□□□□□ -0.68
TRM12Q04235 MIC10YCL057C-A 294 nt10.78□□□□□ -0.68
TRM12Q04235 YFL067WYFL067W 528 nt10.75□□□□□ -0.69
TRM12Q04235 AQY1YPR192W 918 nt10.75□□□□□ -0.69
TRM12Q04235 SNG1YGR197C 1644 nt10.75□□□□□ -0.69
TRM12Q04235 DDR2YOL052C-A 186 nt10.74□□□□□ -0.69
TRM12Q04235 STB1YNL309W 1263 nt10.73□□□□□ -0.69
TRM12Q04235 YPR064WYPR064W 420 nt10.73□□□□□ -0.69
TRM12Q04235 SWE1YJL187C 2460 nt10.72□□□□□ -0.69
TRM12Q04235 HEM12YDR047W 1089 nt10.72□□□□□ -0.69
TRM12Q04235 UBX6YJL048C 1191 nt10.72□□□□□ -0.69
TRM12Q04235 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.7□□□□□ -0.7
TRM12Q04235 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.7□□□□□ -0.7
TRM12Q04235 SPC25YER018C 666 nt10.7□□□□□ -0.7
TRM12Q04235 TAD3YLR316C 969 nt10.7□□□□□ -0.7
TRM12Q04235 ANP1YEL036C 1503 nt10.68□□□□□ -0.7
TRM12Q04235 YDR094WYDR094W 336 nt10.67□□□□□ -0.7
TRM12Q04235 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.66□□□□□ -0.7
TRM12Q04235 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.66□□□□□ -0.7
TRM12Q04235 BOR1YNL275W 1731 nt10.65□□□□□ -0.7
TRM12Q04235 CCT4YDL143W 1587 nt10.65□□□□□ -0.71
TRM12Q04235 VPS60YDR486C 690 nt10.64□□□□□ -0.71
TRM12Q04235 FEN2YCR028C 1539 nt10.63□□□□□ -0.71
TRM12Q04235 ALG3YBL082C 1377 nt10.63□□□□□ -0.71
TRM12Q04235 GPI16YHR188C 1833 nt10.63□□□□□ -0.71
TRM12Q04235 BDH1YAL060W 1149 nt10.6□□□□□ -0.71
TRM12Q04235 SWC5YBR231C 912 nt10.56□□□□□ -0.72
TRM12Q04235 YIR016WYIR016W 798 nt10.54□□□□□ -0.72
TRM12Q04235 RAX1YOR301W 1308 nt10.53□□□□□ -0.72
TRM12Q04235 YSP3YOR003W 1437 nt10.52□□□□□ -0.73
TRM12Q04235 HSP60YLR259C 1719 nt10.51□□□□□ -0.73
TRM12Q04235 YLR415CYLR415C 339 nt10.49□□□□□ -0.73
TRM12Q04235 PRE6YOL038W 765 nt10.49□□□□□ -0.73
TRM12Q04235 MIC12YBR262C 321 nt10.49□□□□□ -0.73
TRM12Q04235 YFR018CYFR018C 1092 nt10.48□□□□□ -0.73
TRM12Q04235 YFL066CYFL066C 1179 nt10.47□□□□□ -0.73
TRM12Q04235 BNA2YJR078W 1362 nt10.45□□□□□ -0.74
TRM12Q04235 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.45□□□□□ -0.74
TRM12Q04235 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.45□□□□□ -0.74
TRM12Q04235 CCA1YER168C 1641 nt10.44□□□□□ -0.74
TRM12Q04235 PEX25YPL112C 1185 nt10.44□□□□□ -0.74
TRM12Q04235 YNL115CYNL115C 1935 nt10.44□□□□□ -0.74
TRM12Q04235 GLK1YCL040W 1503 nt10.43□□□□□ -0.74
TRM12Q04235 FUR4YBR021W 1902 nt10.41□□□□□ -0.74
TRM12Q04235 RRT5YFR032C 870 nt10.4□□□□□ -0.74
TRM12Q04235 PAU16YKL224C 372 nt10.39□□□□□ -0.75
TRM12Q04235 AGP1YCL025C 1902 nt10.39□□□□□ -0.75
TRM12Q04235 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.37□□□□□ -0.75
TRM12Q04235 XDJ1YLR090W 1380 nt10.36□□□□□ -0.75
TRM12Q04235 HHO1YPL127C 777 nt10.35□□□□□ -0.75
TRM12Q04235 SHM2YLR058C 1410 nt10.33□□□□□ -0.76
TRM12Q04235 DUT1YBR252W 444 nt10.31□□□□□ -0.76
TRM12Q04235 YGR201CYGR201C 678 nt10.29□□□□□ -0.76
TRM12Q04235 GDH3YAL062W 1374 nt10.28□□□□□ -0.76
TRM12Q04235 TIM17YJL143W 477 nt10.28□□□□□ -0.76
TRM12Q04235 ALG12YNR030W 1656 nt10.27□□□□□ -0.77
TRM12Q04235 NIT1YIL164C 600 nt10.26□□□□□ -0.77
TRM12Q04235 VPS75YNL246W 795 nt10.26□□□□□ -0.77
TRM12Q04235 PRP4YPR178W 1398 nt10.26□□□□□ -0.77
TRM12Q04235 UME6YDR207C 2511 nt10.25□□□□□ -0.77
TRM12Q04235 AVT6YER119C 1347 nt10.23□□□□□ -0.77
TRM12Q04235 SGT2YOR007C 1041 nt10.21□□□□□ -0.77
TRM12Q04235 DPS1YLL018C 1674 nt10.19□□□□□ -0.78
TRM12Q04235 AAC1YMR056C 930 nt10.17□□□□□ -0.78
TRM12Q04235 MIR1YJR077C 936 nt10.16□□□□□ -0.78
TRM12Q04235 DUS1YML080W 1272 nt10.16□□□□□ -0.78
TRM12Q04235 YKR005CYKR005C 1578 nt10.15□□□□□ -0.78
TRM12Q04235 NAT4YMR069W 858 nt10.15□□□□□ -0.78
TRM12Q04235 GOR1YNL274C 1053 nt10.15□□□□□ -0.78
TRM12Q04235 YCL074WYCL074W 927 nt10.14□□□□□ -0.79
TRM12Q04235 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.12□□□□□ -0.79
TRM12Q04235 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.12□□□□□ -0.79
TRM12Q04235 BMT6YLR063W 1098 nt10.12□□□□□ -0.79
TRM12Q04235 DAT1YML113W 747 nt10.12□□□□□ -0.79
TRM12Q04235 MCH5YOR306C 1566 nt10.12□□□□□ -0.79
TRM12Q04235 PAU7YAR020C 168 nt10.11□□□□□ -0.79
TRM12Q04235 STR3YGL184C 1398 nt10.1□□□□□ -0.79
TRM12Q04235 YDR010CYDR010C 333 nt10.08□□□□□ -0.8
TRM12Q04235 THI74YDR438W 1113 nt10.08□□□□□ -0.8
TRM12Q04235 YGR259CYGR259C 441 nt10.07□□□□□ -0.8
TRM12Q04235 SHB17YKR043C 816 nt10.07□□□□□ -0.8
TRM12Q04235 MSF1YPR047W 1410 nt10.07□□□□□ -0.8
TRM12Q04235 SNF1YDR477W 1902 nt10.05□□□□□ -0.8
TRM12Q04235 AQY2YLL052C 450 nt10.04□□□□□ -0.8
TRM12Q04235 YCR102CYCR102C 1107 nt10.02□□□□□ -0.81
TRM12Q04235 BIO5YNR056C 1686 nt10.01□□□□□ -0.81
TRM12Q04235 UBA4YHR111W 1323 nt10.01□□□□□ -0.81
TRM12Q04235 NBP35YGL091C 987 nt10□□□□□ -0.81
TRM12Q04235 SBA1YKL117W 651 nt9.99□□□□□ -0.81
TRM12Q04235 NAR1YNL240C 1476 nt9.98□□□□□ -0.81
TRM12Q04235 IRC24YIR036C 792 nt9.98□□□□□ -0.81
TRM12Q04235 SHH4YLR164W 507 nt9.96□□□□□ -0.82
TRM12Q04235 RET2YFR051C 1641 nt9.94□□□□□ -0.82
TRM12Q04235 SFA1YDL168W 1161 nt9.93□□□□□ -0.82
TRM12Q04235 YSR3YKR053C 1215 nt9.93□□□□□ -0.82
TRM12Q04235 PHO89YBR296C 1725 nt9.92□□□□□ -0.82
TRM12Q04235 PBP1YGR178C 2169 nt9.9□□□□□ -0.82
TRM12Q04235 YGL034CYGL034C 366 nt9.9□□□□□ -0.82
TRM12Q04235 XYL2YLR070C 1071 nt9.89□□□□□ -0.83
TRM12Q04235 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.87□□□□□ -0.83
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