Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 ERF2YLR246W 1080 nt11.81□□□□□ -0.52
CEF1Q03654 CRR1YLR213C 1269 nt11.8□□□□□ -0.52
CEF1Q03654 PTK1YKL198C 1989 nt11.79□□□□□ -0.52
CEF1Q03654 ATF2YGR177C 1608 nt11.78□□□□□ -0.52
CEF1Q03654 YPR064WYPR064W 420 nt11.78□□□□□ -0.52
CEF1Q03654 TRM5YHR070W 1500 nt11.76□□□□□ -0.53
CEF1Q03654 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.76□□□□□ -0.53
CEF1Q03654 TAD3YLR316C 969 nt11.75□□□□□ -0.53
CEF1Q03654 YDR094WYDR094W 336 nt11.74□□□□□ -0.53
CEF1Q03654 UBX6YJL048C 1191 nt11.74□□□□□ -0.53
CEF1Q03654 SPC25YER018C 666 nt11.73□□□□□ -0.53
CEF1Q03654 YFL067WYFL067W 528 nt11.73□□□□□ -0.53
CEF1Q03654 STB1YNL309W 1263 nt11.69□□□□□ -0.54
CEF1Q03654 ANP1YEL036C 1503 nt11.65□□□□□ -0.54
CEF1Q03654 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.65□□□□□ -0.54
CEF1Q03654 DDR2YOL052C-A 186 nt11.65□□□□□ -0.54
CEF1Q03654 SNG1YGR197C 1644 nt11.64□□□□□ -0.55
CEF1Q03654 YFR018CYFR018C 1092 nt11.63□□□□□ -0.55
CEF1Q03654 BDH1YAL060W 1149 nt11.63□□□□□ -0.55
CEF1Q03654 CCT4YDL143W 1587 nt11.62□□□□□ -0.55
CEF1Q03654 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.62□□□□□ -0.55
CEF1Q03654 GPI16YHR188C 1833 nt11.61□□□□□ -0.55
CEF1Q03654 HEM12YDR047W 1089 nt11.61□□□□□ -0.55
CEF1Q03654 MIC10YCL057C-A 294 nt11.61□□□□□ -0.55
CEF1Q03654 FRE6YLL051C 2139 nt11.59□□□□□ -0.55
CEF1Q03654 VPS60YDR486C 690 nt11.58□□□□□ -0.56
CEF1Q03654 YSP3YOR003W 1437 nt11.57□□□□□ -0.56
CEF1Q03654 FEN2YCR028C 1539 nt11.56□□□□□ -0.56
CEF1Q03654 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.55□□□□□ -0.56
CEF1Q03654 ALG3YBL082C 1377 nt11.54□□□□□ -0.56
CEF1Q03654 PEX25YPL112C 1185 nt11.5□□□□□ -0.57
CEF1Q03654 YLR415CYLR415C 339 nt11.49□□□□□ -0.57
CEF1Q03654 PRE6YOL038W 765 nt11.49□□□□□ -0.57
CEF1Q03654 YFL054CYFL054C 1941 nt11.48□□□□□ -0.57
CEF1Q03654 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.47□□□□□ -0.57
CEF1Q03654 YIR016WYIR016W 798 nt11.47□□□□□ -0.57
CEF1Q03654 SWC5YBR231C 912 nt11.47□□□□□ -0.57
CEF1Q03654 MIC12YBR262C 321 nt11.45□□□□□ -0.58
CEF1Q03654 SPT8YLR055C 1809 nt11.44□□□□□ -0.58
CEF1Q03654 YFL066CYFL066C 1179 nt11.43□□□□□ -0.58
CEF1Q03654 PAU16YKL224C 372 nt11.42□□□□□ -0.58
CEF1Q03654 YNL115CYNL115C 1935 nt11.42□□□□□ -0.58
CEF1Q03654 RAX1YOR301W 1308 nt11.39□□□□□ -0.59
CEF1Q03654 RRT5YFR032C 870 nt11.39□□□□□ -0.59
CEF1Q03654 VPS75YNL246W 795 nt11.32□□□□□ -0.6
CEF1Q03654 SWE1YJL187C 2460 nt11.31□□□□□ -0.6
CEF1Q03654 BNA2YJR078W 1362 nt11.3□□□□□ -0.6
CEF1Q03654 YGR201CYGR201C 678 nt11.26□□□□□ -0.61
CEF1Q03654 XDJ1YLR090W 1380 nt11.26□□□□□ -0.61
CEF1Q03654 SHM2YLR058C 1410 nt11.25□□□□□ -0.61
CEF1Q03654 TIM17YJL143W 477 nt11.24□□□□□ -0.61
CEF1Q03654 CCA1YER168C 1641 nt11.23□□□□□ -0.61
CEF1Q03654 AGP1YCL025C 1902 nt11.2□□□□□ -0.62
CEF1Q03654 NIT1YIL164C 600 nt11.2□□□□□ -0.62
CEF1Q03654 MIR1YJR077C 936 nt11.2□□□□□ -0.62
CEF1Q03654 HHO1YPL127C 777 nt11.2□□□□□ -0.62
CEF1Q03654 GDH3YAL062W 1374 nt11.16□□□□□ -0.62
CEF1Q03654 SGT2YOR007C 1041 nt11.11□□□□□ -0.63
CEF1Q03654 DAT1YML113W 747 nt11.1□□□□□ -0.63
CEF1Q03654 NAT4YMR069W 858 nt11.09□□□□□ -0.63
CEF1Q03654 THI74YDR438W 1113 nt11.08□□□□□ -0.64
CEF1Q03654 GLK1YCL040W 1503 nt11.07□□□□□ -0.64
CEF1Q03654 MSF1YPR047W 1410 nt11.07□□□□□ -0.64
CEF1Q03654 DUT1YBR252W 444 nt11.06□□□□□ -0.64
CEF1Q03654 AVT6YER119C 1347 nt11.05□□□□□ -0.64
CEF1Q03654 YDR010CYDR010C 333 nt11.04□□□□□ -0.64
CEF1Q03654 SHB17YKR043C 816 nt11.02□□□□□ -0.65
CEF1Q03654 MCH5YOR306C 1566 nt11.02□□□□□ -0.65
CEF1Q03654 SSN3YPL042C 1668 nt11.01□□□□□ -0.65
CEF1Q03654 PAU7YAR020C 168 nt11□□□□□ -0.65
CEF1Q03654 GOR1YNL274C 1053 nt11□□□□□ -0.65
CEF1Q03654 UBA4YHR111W 1323 nt11□□□□□ -0.65
CEF1Q03654 SBA1YKL117W 651 nt10.96□□□□□ -0.65
CEF1Q03654 YCR102CYCR102C 1107 nt10.95□□□□□ -0.66
CEF1Q03654 RET2YFR051C 1641 nt10.95□□□□□ -0.66
CEF1Q03654 STR3YGL184C 1398 nt10.92□□□□□ -0.66
CEF1Q03654 NBP35YGL091C 987 nt10.91□□□□□ -0.66
CEF1Q03654 FUR4YBR021W 1902 nt10.91□□□□□ -0.66
CEF1Q03654 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.91□□□□□ -0.66
CEF1Q03654 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.91□□□□□ -0.66
CEF1Q03654 YCL074WYCL074W 927 nt10.9□□□□□ -0.66
CEF1Q03654 YGL034CYGL034C 366 nt10.9□□□□□ -0.66
CEF1Q03654 YSR3YKR053C 1215 nt10.87□□□□□ -0.67
CEF1Q03654 BSP1YPR171W 1731 nt10.87□□□□□ -0.67
CEF1Q03654 DUS1YML080W 1272 nt10.85□□□□□ -0.67
CEF1Q03654 SFA1YDL168W 1161 nt10.84□□□□□ -0.67
CEF1Q03654 PHO89YBR296C 1725 nt10.82□□□□□ -0.68
CEF1Q03654 YCR087WYCR087W 516 nt10.81□□□□□ -0.68
CEF1Q03654 TIR3YIL011W 810 nt10.81□□□□□ -0.68
CEF1Q03654 XYL2YLR070C 1071 nt10.8□□□□□ -0.68
CEF1Q03654 SHH4YLR164W 507 nt10.79□□□□□ -0.68
CEF1Q03654 COQ2YNR041C 1119 nt10.77□□□□□ -0.69
CEF1Q03654 HSP60YLR259C 1719 nt10.76□□□□□ -0.69
CEF1Q03654 AIM45YPR004C 1035 nt10.76□□□□□ -0.69
CEF1Q03654 ARP6YLR085C 1317 nt10.76□□□□□ -0.69
CEF1Q03654 LSC2YGR244C 1284 nt10.75□□□□□ -0.69
CEF1Q03654 AQY2YLL052C 450 nt10.75□□□□□ -0.69
CEF1Q03654 GID7YCL039W 2238 nt10.74□□□□□ -0.69
CEF1Q03654 POM34YLR018C 900 nt10.73□□□□□ -0.69
CEF1Q03654 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.72□□□□□ -0.69
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