Protein–RNA interactions for Protein: Q03178

PIR1, Cell wall mannoprotein PIR1, yeastyeast

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR1Q03178 STB1YNL309W 1263 nt10.96□□□□□ -0.65
PIR1Q03178 SPC25YER018C 666 nt10.94□□□□□ -0.66
PIR1Q03178 RRT5YFR032C 870 nt10.94□□□□□ -0.66
PIR1Q03178 BDH1YAL060W 1149 nt10.94□□□□□ -0.66
PIR1Q03178 CRR1YLR213C 1269 nt10.94□□□□□ -0.66
PIR1Q03178 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.93□□□□□ -0.66
PIR1Q03178 DDR2YOL052C-A 186 nt10.93□□□□□ -0.66
PIR1Q03178 YFL066CYFL066C 1179 nt10.92□□□□□ -0.66
PIR1Q03178 YFL067WYFL067W 528 nt10.92□□□□□ -0.66
PIR1Q03178 CCT4YDL143W 1587 nt10.91□□□□□ -0.66
PIR1Q03178 PEX25YPL112C 1185 nt10.9□□□□□ -0.66
PIR1Q03178 YSP3YOR003W 1437 nt10.9□□□□□ -0.66
PIR1Q03178 GPI16YHR188C 1833 nt10.88□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 RTF1YGL244W 1677 nt10.88□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 PIB2YGL023C 1908 nt10.88□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.87□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 VPS60YDR486C 690 nt10.87□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 YLR415CYLR415C 339 nt10.87□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 BOP3YNL042W 1191 nt10.87□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 LYS4YDR234W 2082 nt10.87□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 YNL115CYNL115C 1935 nt10.85□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 SWC5YBR231C 912 nt10.84□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 MIC10YCL057C-A 294 nt10.84□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 ALG3YBL082C 1377 nt10.84□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 SNG1YGR197C 1644 nt10.84□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 ANP1YEL036C 1503 nt10.84□□□□□ -0.67
PIR1Q03178 HEM12YDR047W 1089 nt10.82□□□□□ -0.68
PIR1Q03178 FEN2YCR028C 1539 nt10.82□□□□□ -0.68
PIR1Q03178 YIR016WYIR016W 798 nt10.72□□□□□ -0.69
PIR1Q03178 SBA1YKL117W 651 nt10.72□□□□□ -0.69
PIR1Q03178 PTK1YKL198C 1989 nt10.71□□□□□ -0.69
PIR1Q03178 SPT8YLR055C 1809 nt10.7□□□□□ -0.7
PIR1Q03178 VPS75YNL246W 795 nt10.68□□□□□ -0.7
PIR1Q03178 NAT4YMR069W 858 nt10.67□□□□□ -0.7
PIR1Q03178 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.66□□□□□ -0.7
PIR1Q03178 MIR1YJR077C 936 nt10.66□□□□□ -0.7
PIR1Q03178 GLK1YCL040W 1503 nt10.64□□□□□ -0.71
PIR1Q03178 THI74YDR438W 1113 nt10.6□□□□□ -0.71
PIR1Q03178 TIM17YJL143W 477 nt10.6□□□□□ -0.71
PIR1Q03178 MSF1YPR047W 1410 nt10.59□□□□□ -0.71
PIR1Q03178 BNA2YJR078W 1362 nt10.58□□□□□ -0.72
PIR1Q03178 MIC12YBR262C 321 nt10.58□□□□□ -0.72
PIR1Q03178 SHM2YLR058C 1410 nt10.58□□□□□ -0.72
PIR1Q03178 XDJ1YLR090W 1380 nt10.56□□□□□ -0.72
PIR1Q03178 YFL054CYFL054C 1941 nt10.55□□□□□ -0.72
PIR1Q03178 RAX1YOR301W 1308 nt10.55□□□□□ -0.72
PIR1Q03178 PAU7YAR020C 168 nt10.52□□□□□ -0.73
PIR1Q03178 DAT1YML113W 747 nt10.5□□□□□ -0.73
PIR1Q03178 NIT1YIL164C 600 nt10.48□□□□□ -0.73
PIR1Q03178 SGT2YOR007C 1041 nt10.48□□□□□ -0.73
PIR1Q03178 GDH3YAL062W 1374 nt10.48□□□□□ -0.73
PIR1Q03178 SHB17YKR043C 816 nt10.46□□□□□ -0.73
PIR1Q03178 HHO1YPL127C 777 nt10.46□□□□□ -0.73
PIR1Q03178 UBA4YHR111W 1323 nt10.45□□□□□ -0.74
PIR1Q03178 YGR201CYGR201C 678 nt10.45□□□□□ -0.74
PIR1Q03178 YDR010CYDR010C 333 nt10.42□□□□□ -0.74
PIR1Q03178 YGL034CYGL034C 366 nt10.4□□□□□ -0.74
PIR1Q03178 AVT6YER119C 1347 nt10.38□□□□□ -0.75
PIR1Q03178 YSR3YKR053C 1215 nt10.38□□□□□ -0.75
PIR1Q03178 CCA1YER168C 1641 nt10.37□□□□□ -0.75
PIR1Q03178 AGP1YCL025C 1902 nt10.37□□□□□ -0.75
PIR1Q03178 SWE1YJL187C 2460 nt10.34□□□□□ -0.75
PIR1Q03178 XYL2YLR070C 1071 nt10.34□□□□□ -0.75
PIR1Q03178 DUT1YBR252W 444 nt10.33□□□□□ -0.76
PIR1Q03178 RET2YFR051C 1641 nt10.32□□□□□ -0.76
PIR1Q03178 YMR244WYMR244W 1068 nt10.31□□□□□ -0.76
PIR1Q03178 GOR1YNL274C 1053 nt10.31□□□□□ -0.76
PIR1Q03178 PHO89YBR296C 1725 nt10.3□□□□□ -0.76
PIR1Q03178 RBG1YAL036C 1110 nt10.27□□□□□ -0.77
PIR1Q03178 GLR1YPL091W 1452 nt10.26□□□□□ -0.77
PIR1Q03178 NDI1YML120C 1542 nt10.26□□□□□ -0.77
PIR1Q03178 YCR087WYCR087W 516 nt10.23□□□□□ -0.77
PIR1Q03178 YCR102CYCR102C 1107 nt10.23□□□□□ -0.77
PIR1Q03178 AIM45YPR004C 1035 nt10.22□□□□□ -0.77
PIR1Q03178 SFA1YDL168W 1161 nt10.2□□□□□ -0.78
PIR1Q03178 COQ2YNR041C 1119 nt10.19□□□□□ -0.78
PIR1Q03178 MRP20YDR405W 792 nt10.16□□□□□ -0.78
PIR1Q03178 DUS1YML080W 1272 nt10.16□□□□□ -0.78
PIR1Q03178 NBP35YGL091C 987 nt10.14□□□□□ -0.79
PIR1Q03178 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.14□□□□□ -0.79
PIR1Q03178 SHH4YLR164W 507 nt10.14□□□□□ -0.79
PIR1Q03178 RBG2YGR173W 1107 nt10.11□□□□□ -0.79
PIR1Q03178 STR3YGL184C 1398 nt10.11□□□□□ -0.79
PIR1Q03178 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.09□□□□□ -0.79
PIR1Q03178 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.09□□□□□ -0.79
PIR1Q03178 TIR3YIL011W 810 nt10.08□□□□□ -0.8
PIR1Q03178 AQY2YLL052C 450 nt10.08□□□□□ -0.8
PIR1Q03178 YCL074WYCL074W 927 nt10.06□□□□□ -0.8
PIR1Q03178 RPL4BYDR012W 1089 nt10.03□□□□□ -0.8
PIR1Q03178 TOM6YOR045W 186 nt10.03□□□□□ -0.8
PIR1Q03178 RPL4AYBR031W 1089 nt10.03□□□□□ -0.8
PIR1Q03178 RPS14BYJL191W 417 nt10□□□□□ -0.81
PIR1Q03178 POM34YLR018C 900 nt10□□□□□ -0.81
PIR1Q03178 YMR226CYMR226C 804 nt9.99□□□□□ -0.81
PIR1Q03178 FUR4YBR021W 1902 nt9.98□□□□□ -0.81
PIR1Q03178 PEX2YJL210W 816 nt9.98□□□□□ -0.81
PIR1Q03178 PRO1YDR300C 1287 nt9.97□□□□□ -0.81
PIR1Q03178 CLB6YGR109C 1143 nt9.97□□□□□ -0.81
PIR1Q03178 HIP1YGR191W 1812 nt9.96□□□□□ -0.82
PIR1Q03178 LSC2YGR244C 1284 nt9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.5 ms