Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 Q0182Q0182 405 nt10.05□□□□□ -0.8
NUP49Q02199 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.04□□□□□ -0.8
NUP49Q02199 YEL076CYEL076C 651 nt10.04□□□□□ -0.8
NUP49Q02199 YLR464WYLR464W 651 nt10.04□□□□□ -0.8
NUP49Q02199 GAL1YBR020W 1587 nt10.04□□□□□ -0.8
NUP49Q02199 MOT3YMR070W 1473 nt10.04□□□□□ -0.8
NUP49Q02199 TRM5YHR070W 1500 nt10.03□□□□□ -0.8
NUP49Q02199 AAC1YMR056C 930 nt10.01□□□□□ -0.81
NUP49Q02199 DPS1YLL018C 1674 nt10□□□□□ -0.81
NUP49Q02199 DIC1YLR348C 897 nt10□□□□□ -0.81
NUP49Q02199 DDR2YOL052C-A 186 nt10□□□□□ -0.81
NUP49Q02199 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.98□□□□□ -0.81
NUP49Q02199 SPP1YPL138C 1062 nt9.98□□□□□ -0.81
NUP49Q02199 ANP1YEL036C 1503 nt9.97□□□□□ -0.81
NUP49Q02199 MIC12YBR262C 321 nt9.93□□□□□ -0.82
NUP49Q02199 YKR005CYKR005C 1578 nt9.92□□□□□ -0.82
NUP49Q02199 BNA2YJR078W 1362 nt9.92□□□□□ -0.82
NUP49Q02199 BMT6YLR063W 1098 nt9.92□□□□□ -0.82
NUP49Q02199 WSC2YNL283C 1512 nt9.92□□□□□ -0.82
NUP49Q02199 AQY1YPR192W 918 nt9.91□□□□□ -0.82
NUP49Q02199 AGP1YCL025C 1902 nt9.91□□□□□ -0.82
NUP49Q02199 NAR1YNL240C 1476 nt9.9□□□□□ -0.83
NUP49Q02199 SNF1YDR477W 1902 nt9.88□□□□□ -0.83
NUP49Q02199 BIO5YNR056C 1686 nt9.87□□□□□ -0.83
NUP49Q02199 YCL074WYCL074W 927 nt9.86□□□□□ -0.83
NUP49Q02199 PTH1YHR189W 573 nt9.86□□□□□ -0.83
NUP49Q02199 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.85□□□□□ -0.83
NUP49Q02199 SPC25YER018C 666 nt9.85□□□□□ -0.83
NUP49Q02199 YLR235CYLR235C 399 nt9.85□□□□□ -0.83
NUP49Q02199 STB1YNL309W 1263 nt9.85□□□□□ -0.83
NUP49Q02199 FEN2YCR028C 1539 nt9.83□□□□□ -0.84
NUP49Q02199 DUS1YML080W 1272 nt9.83□□□□□ -0.84
NUP49Q02199 YGR259CYGR259C 441 nt9.82□□□□□ -0.84
NUP49Q02199 HHO1YPL127C 777 nt9.8□□□□□ -0.84
NUP49Q02199 PBP1YGR178C 2169 nt9.8□□□□□ -0.84
NUP49Q02199 GPI16YHR188C 1833 nt9.79□□□□□ -0.84
NUP49Q02199 IRC24YIR036C 792 nt9.78□□□□□ -0.84
NUP49Q02199 TIM23YNR017W 669 nt9.77□□□□□ -0.85
NUP49Q02199 YIR016WYIR016W 798 nt9.76□□□□□ -0.85
NUP49Q02199 CYT2YKL087C 675 nt9.76□□□□□ -0.85
NUP49Q02199 YKL030WYKL030W 606 nt9.75□□□□□ -0.85
NUP49Q02199 YLR179CYLR179C 606 nt9.75□□□□□ -0.85
NUP49Q02199 XDJ1YLR090W 1380 nt9.75□□□□□ -0.85
NUP49Q02199 VPS60YDR486C 690 nt9.74□□□□□ -0.85
NUP49Q02199 YGR201CYGR201C 678 nt9.73□□□□□ -0.85
NUP49Q02199 RTG1YOL067C 534 nt9.73□□□□□ -0.85
NUP49Q02199 CCT4YDL143W 1587 nt9.71□□□□□ -0.85
NUP49Q02199 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.7□□□□□ -0.86
NUP49Q02199 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.7□□□□□ -0.86
NUP49Q02199 AHT1YHR093W 549 nt9.69□□□□□ -0.86
NUP49Q02199 ALG3YBL082C 1377 nt9.69□□□□□ -0.86
NUP49Q02199 STR3YGL184C 1398 nt9.67□□□□□ -0.86
NUP49Q02199 DUT1YBR252W 444 nt9.65□□□□□ -0.86
NUP49Q02199 SWC5YBR231C 912 nt9.64□□□□□ -0.87
NUP49Q02199 YPR064WYPR064W 420 nt9.61□□□□□ -0.87
NUP49Q02199 MRPL8YJL063C 717 nt9.59□□□□□ -0.87
NUP49Q02199 RTN2YDL204W 1182 nt9.56□□□□□ -0.88
NUP49Q02199 AQY2YLL052C 450 nt9.56□□□□□ -0.88
NUP49Q02199 TAD3YLR316C 969 nt9.56□□□□□ -0.88
NUP49Q02199 AVT6YER119C 1347 nt9.56□□□□□ -0.88
NUP49Q02199 HUA1YGR268C 597 nt9.54□□□□□ -0.88
NUP49Q02199 GOR1YNL274C 1053 nt9.54□□□□□ -0.88
NUP49Q02199 CMP2YML057W 1815 nt9.54□□□□□ -0.88
NUP49Q02199 GDH3YAL062W 1374 nt9.52□□□□□ -0.88
NUP49Q02199 ADO1YJR105W 1023 nt9.52□□□□□ -0.89
NUP49Q02199 YAT1YAR035W 2064 nt9.51□□□□□ -0.89
NUP49Q02199 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.49□□□□□ -0.89
NUP49Q02199 BDH1YAL060W 1149 nt9.45□□□□□ -0.9
NUP49Q02199 RPM1RPM1 483 nt9.45□□□□□ -0.9
NUP49Q02199 NDI1YML120C 1542 nt9.44□□□□□ -0.9
NUP49Q02199 SHM2YLR058C 1410 nt9.42□□□□□ -0.9
NUP49Q02199 HSL7YBR133C 2484 nt9.41□□□□□ -0.9
NUP49Q02199 YLR415CYLR415C 339 nt9.4□□□□□ -0.9
NUP49Q02199 DAT1YML113W 747 nt9.4□□□□□ -0.9
NUP49Q02199 PLB1YMR008C 1995 nt9.37□□□□□ -0.91
NUP49Q02199 YSP3YOR003W 1437 nt9.37□□□□□ -0.91
NUP49Q02199 ARP6YLR085C 1317 nt9.35□□□□□ -0.91
NUP49Q02199 TIM17YJL143W 477 nt9.35□□□□□ -0.91
NUP49Q02199 NBP35YGL091C 987 nt9.34□□□□□ -0.91
NUP49Q02199 NIT1YIL164C 600 nt9.34□□□□□ -0.91
NUP49Q02199 HIF1YLL022C 1158 nt9.34□□□□□ -0.91
NUP49Q02199 SPT20YOL148C 1815 nt9.33□□□□□ -0.92
NUP49Q02199 PRM5YIL117C 957 nt9.31□□□□□ -0.92
NUP49Q02199 ALD4YOR374W 1560 nt9.31□□□□□ -0.92
NUP49Q02199 YCR102CYCR102C 1107 nt9.29□□□□□ -0.92
NUP49Q02199 RPC82YPR190C 1965 nt9.29□□□□□ -0.92
NUP49Q02199 PEX25YPL112C 1185 nt9.28□□□□□ -0.92
NUP49Q02199 INA1YLR413W 2028 nt9.27□□□□□ -0.92
NUP49Q02199 YNL115CYNL115C 1935 nt9.27□□□□□ -0.93
NUP49Q02199 SGT2YOR007C 1041 nt9.25□□□□□ -0.93
NUP49Q02199 YFR018CYFR018C 1092 nt9.24□□□□□ -0.93
NUP49Q02199 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.23□□□□□ -0.93
NUP49Q02199 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.23□□□□□ -0.93
NUP49Q02199 UTR1YJR049C 1593 nt9.21□□□□□ -0.93
NUP49Q02199 YFL066CYFL066C 1179 nt9.2□□□□□ -0.94
NUP49Q02199 YDR094WYDR094W 336 nt9.18□□□□□ -0.94
NUP49Q02199 VPS75YNL246W 795 nt9.18□□□□□ -0.94
NUP49Q02199 PRE6YOL038W 765 nt9.16□□□□□ -0.94
NUP49Q02199 LSC2YGR244C 1284 nt9.15□□□□□ -0.94
NUP49Q02199 ZRT3YKL175W 1512 nt9.15□□□□□ -0.95
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