Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1cQ01815 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1cQ01815 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna1cQ01815 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1cQ01815 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1cQ01815 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1cQ01815 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1cQ01815 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1cQ01815 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1cQ01815 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1cQ01815 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna1cQ01815 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1cQ01815 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1cQ01815 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1cQ01815 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1cQ01815 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1cQ01815 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1cQ01815 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1cQ01815 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1cQ01815 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna1cQ01815 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1cQ01815 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1cQ01815 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna1cQ01815 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna1cQ01815 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1cQ01815 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1cQ01815 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1cQ01815 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1cQ01815 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1cQ01815 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1cQ01815 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1cQ01815 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1cQ01815 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cacna1cQ01815 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cacna1cQ01815 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna1cQ01815 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1cQ01815 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1cQ01815 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna1cQ01815 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna1cQ01815 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna1cQ01815 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna1cQ01815 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1cQ01815 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna1cQ01815 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna1cQ01815 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna1cQ01815 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna1cQ01815 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1cQ01815 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna1cQ01815 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1cQ01815 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna1cQ01815 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1cQ01815 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1cQ01815 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna1cQ01815 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cacna1cQ01815 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1cQ01815 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna1cQ01815 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cacna1cQ01815 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna1cQ01815 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1cQ01815 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna1cQ01815 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1cQ01815 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1cQ01815 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna1cQ01815 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1cQ01815 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna1cQ01815 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna1cQ01815 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna1cQ01815 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna1cQ01815 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna1cQ01815 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna1cQ01815 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1cQ01815 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna1cQ01815 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna1cQ01815 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna1cQ01815 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1cQ01815 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna1cQ01815 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna1cQ01815 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna1cQ01815 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna1cQ01815 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cacna1cQ01815 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna1cQ01815 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1cQ01815 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1cQ01815 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1cQ01815 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1cQ01815 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1cQ01815 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1cQ01815 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna1cQ01815 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1cQ01815 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1cQ01815 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna1cQ01815 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna1cQ01815 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1cQ01815 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna1cQ01815 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1cQ01815 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1cQ01815 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna1cQ01815 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1cQ01815 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna1cQ01815 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms