Protein–RNA interactions for Protein: P97360

Etv6, Transcription factor ETV6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv6P97360 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Etv6P97360 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Etv6P97360 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Etv6P97360 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Etv6P97360 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Etv6P97360 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Etv6P97360 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Etv6P97360 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Etv6P97360 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Etv6P97360 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Etv6P97360 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Etv6P97360 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Etv6P97360 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Etv6P97360 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Etv6P97360 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Etv6P97360 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Etv6P97360 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Etv6P97360 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Etv6P97360 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Etv6P97360 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Etv6P97360 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Etv6P97360 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Etv6P97360 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Etv6P97360 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Etv6P97360 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Etv6P97360 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Etv6P97360 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Etv6P97360 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Etv6P97360 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Etv6P97360 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Etv6P97360 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Etv6P97360 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Etv6P97360 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Etv6P97360 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Etv6P97360 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Etv6P97360 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Etv6P97360 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Etv6P97360 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Etv6P97360 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Etv6P97360 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Etv6P97360 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Etv6P97360 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Etv6P97360 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Etv6P97360 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Etv6P97360 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Etv6P97360 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Etv6P97360 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Etv6P97360 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Etv6P97360 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Etv6P97360 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Etv6P97360 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Etv6P97360 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Etv6P97360 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Etv6P97360 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Etv6P97360 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Etv6P97360 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Etv6P97360 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Etv6P97360 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Etv6P97360 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Etv6P97360 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Etv6P97360 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Etv6P97360 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Etv6P97360 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Etv6P97360 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Etv6P97360 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Etv6P97360 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Etv6P97360 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Etv6P97360 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Etv6P97360 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Etv6P97360 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Etv6P97360 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Etv6P97360 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Etv6P97360 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Etv6P97360 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Etv6P97360 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Etv6P97360 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Etv6P97360 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Etv6P97360 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Etv6P97360 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Etv6P97360 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Etv6P97360 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Etv6P97360 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Etv6P97360 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Etv6P97360 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Etv6P97360 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Etv6P97360 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Etv6P97360 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Etv6P97360 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Etv6P97360 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Etv6P97360 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Etv6P97360 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Etv6P97360 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Etv6P97360 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Etv6P97360 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Etv6P97360 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Etv6P97360 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Etv6P97360 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Etv6P97360 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Etv6P97360 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Etv6P97360 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms