Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
Psmb7P70195 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Psmb7P70195 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Psmb7P70195 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Psmb7P70195 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Psmb7P70195 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Psmb7P70195 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Psmb7P70195 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Psmb7P70195 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Psmb7P70195 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Psmb7P70195 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Psmb7P70195 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Psmb7P70195 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Psmb7P70195 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Psmb7P70195 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Psmb7P70195 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Psmb7P70195 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Psmb7P70195 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Psmb7P70195 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Psmb7P70195 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Psmb7P70195 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Psmb7P70195 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Psmb7P70195 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Psmb7P70195 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Psmb7P70195 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Psmb7P70195 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Psmb7P70195 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Psmb7P70195 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Psmb7P70195 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Psmb7P70195 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Psmb7P70195 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Psmb7P70195 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Psmb7P70195 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Psmb7P70195 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Psmb7P70195 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Psmb7P70195 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Psmb7P70195 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Psmb7P70195 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Psmb7P70195 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Psmb7P70195 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Psmb7P70195 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Psmb7P70195 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Psmb7P70195 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Psmb7P70195 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Psmb7P70195 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Psmb7P70195 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Psmb7P70195 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Psmb7P70195 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Psmb7P70195 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Psmb7P70195 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
Psmb7P70195 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Psmb7P70195 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Psmb7P70195 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Psmb7P70195 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Psmb7P70195 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Psmb7P70195 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Psmb7P70195 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Psmb7P70195 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Psmb7P70195 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Psmb7P70195 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Psmb7P70195 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Psmb7P70195 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Psmb7P70195 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Psmb7P70195 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Psmb7P70195 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Psmb7P70195 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Psmb7P70195 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,7■■■□□ 2,03
Psmb7P70195 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Psmb7P70195 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Psmb7P70195 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Psmb7P70195 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Psmb7P70195 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Psmb7P70195 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Psmb7P70195 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Psmb7P70195 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Psmb7P70195 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Psmb7P70195 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Psmb7P70195 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Psmb7P70195 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Psmb7P70195 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Psmb7P70195 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Psmb7P70195 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Psmb7P70195 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Psmb7P70195 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Psmb7P70195 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Psmb7P70195 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Psmb7P70195 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Psmb7P70195 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2
Psmb7P70195 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Psmb7P70195 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Psmb7P70195 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Psmb7P70195 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Psmb7P70195 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Psmb7P70195 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Psmb7P70195 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Psmb7P70195 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Psmb7P70195 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Psmb7P70195 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Psmb7P70195 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Psmb7P70195 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,9 ms